Virale Ätiologie schwerer akuter Atemwegsinfektionen bei kritisch kranken Patienten (VERIFY)

Es wird erwartet, dass Daten über die Belastung, den Schweregrad und die Ätiologie von SARI bei kritisch kranken Patienten von großem Wert für die Priorisierung von Präventions- und Kontrollbemühungen18 und für die Gestaltung zukünftiger Interventionsstudien zu antiviralen Arzneimitteln und anderen Therapiemodalitäten sind.

Da Influenza in Saudi-Arabien eine häufige Ursache für schwere Atemwegserkrankungen ist, obwohl nur begrenzte Daten zu den am schwersten an Influenza erkrankten Patienten verfügbar sind, werden wir eine Überwachung bei kritisch kranken SARI-Patienten durchführen und eine Typisierung und Subtypisierung von Influenzaviren in BAL-Proben durchführen. Wir werden Proben für zukünftige Untersuchungen prädisponierender Risikofaktoren, einschließlich genetischer Faktoren, aufbewahren.

Durch Multiplex-PCR werden Kosten und Zeit für den Nachweis von Atemwegserregern reduziert. In den letzten Jahren haben sich die sinkenden Kosten von WGS-Technologien (Whole Genome Sequencing) als wertvolles Instrument erwiesen, um die wachsende Bedrohung durch neu auftretende Krankheitserreger zu verstehen. Das metagenomische Next-Generation-Sequencing (M-NGS) hat im letzten Jahrzehnt eine transformative Wirkung auf die Untersuchung und das Verständnis komplexer mikrobieller Gemeinschaften gehabt. Bei M-NGS handelt es sich lediglich um die Erfassung und Bestimmung aller Nukleinsäuren in einer Probe, wodurch eine gemischte Population von Mikroorganismen identifiziert werden konnte. Diese leistungsstarke Plattform identifiziert gleichzeitig genetisches Material aller Organismen, unabhängig von anderen Methoden, die spezifische Primer zur Identifizierung spezifischer Ziele verwendeten.

Das Hauptziel des VERIFY-Registers besteht darin, die virologischen Ätiologien von SARI bei beatmeten kritisch kranken Patienten in einer geografisch repräsentativen Stichprobe aus Saudi-Arabien zu untersuchen, um durch systematische Probenentnahme aus den unteren Atemwegen und den Einsatz von Serologie eine bessere Schätzung der Prävalenz viraler Krankheitserreger zu erhalten unter kritisch kranken Patienten in einer geografisch repräsentativen Stichprobe aus Saudi-Arabien. Der Beitrag von Viren kann aufgrund der ausschließlichen Verwendung von Proben der oberen Atemwege und der späten Vorstellung der Fälle auf der Intensivstation (zu diesem Zeitpunkt ist kein Antigen mehr nachweisbar) unterschätzt werden. Daher wird ein systematischer Ansatz unter Verwendung von Mini-BAL zur Gewinnung von Proben aus den unteren Atemwegen wahrscheinlich zu besseren Schätzungen führen.