Вирусная этиология тяжелой острой респираторной инфекции в регистре тяжелобольных (VERIFY)

Ожидается, что данные о бремени, тяжести и этиологии ТОРИ среди пациентов в критическом состоянии будут иметь большое значение для определения приоритетности усилий по профилактике и контролю18, а также для планирования будущих исследований противовирусных препаратов и других терапевтических методов.

Поскольку грипп является распространенной причиной серьезных респираторных заболеваний в Саудовской Аравии, хотя имеются лишь ограниченные данные о наиболее тяжело больных гриппом пациентах, мы будем проводить эпиднадзор за тяжелобольными пациентами с ТОРИ и проводить типирование и субтипирование вирусов гриппа в образцах БАЛ. Мы будем хранить образцы для будущего изучения предрасполагающих факторов риска, включая генетические факторы.

Мультиплексная ПЦР позволит сократить затраты и время на выявление респираторных возбудителей. В последние годы снижение стоимости технологий полногеномного секвенирования (WGS) оказалось ценным инструментом для понимания растущей угрозы, создаваемой новыми патогенами. Метагеномное секвенирование нового поколения (M-NGS) за последнее десятилетие оказало преобразующее воздействие на исследование и понимание сложных микробных сообществ. M-NGS просто захватывает и определяет все нуклеиновые кислоты в образце, что позволяет идентифицировать смешанную популяцию микроорганизмов. Эта мощная платформа одновременно идентифицирует генетические материалы любых организмов, независимо от других методов, в которых используются конкретные праймеры для идентификации конкретных целей.

Основная цель реестра VERIFY — изучить вирусологическую этиологию ТОРИ среди пациентов в критическом состоянии, находящихся на искусственной вентиляции легких, в географической репрезентативной выборке из Саудовской Аравии, чтобы получить более точную оценку распространенности вирусных патогенов путем систематического отбора проб из нижних дыхательных путей и использования серологических исследований. среди критически больных пациентов в географической репрезентативной выборке из Саудовской Аравии. Вклад вирусов может быть недооценен из-за использования образцов только из верхних дыхательных путей и позднего обращения больных в отделение интенсивной терапии (когда антиген уже не обнаруживается). Поэтому систематический подход с использованием мини-БАЛ для получения проб из нижних дыхательных путей, вероятно, даст более точную оценку.