Genomewide Search dla Loci leżącego u podstaw zespołu metabolicznego

TŁO:

Zespół metaboliczny, charakteryzujący się skupieniem wielu nieprawidłowości metabolicznych, w tym otyłości brzusznej, dyslipidemii, hiperinsulinemii, hiperglikemii i nadciśnienia tętniczego, jest jednym z najważniejszych czynników ryzyka chorób sercowo-naczyniowych i udaru mózgu. Genetyka odgrywa znaczącą rolę w określaniu indywidualnej podatności na zespół metaboliczny i międzyosobniczej zmienności związanych z nim fenotypów, chociaż te czynniki genetyczne pozostają w dużej mierze nieznane. Celem długoterminowym jest identyfikacja genów podatności na zespół metaboliczny i ich funkcjonalnych wariantów.

NARRACJA PROJEKTOWA:

Celem badań jest zbadanie podstawowej struktury fenotypowej zespołu metabolicznego i systematyczne poszukiwanie loci genetycznych predysponujących do zespołu metabolicznego przy użyciu metody skanowania genomu. Konkretne cele to: (1) badanie przesiewowe około 10 000 par rodzeństwa w wieku od 40 do 64 lat w Anqing, Anhui w Chinach, pod kątem pośrednich fenotypów zespołu metabolicznego, w tym wskaźnika masy ciała, obwodu talii i bioder, profili lipidów w surowicy (trójglicerydy, , cholesterol LDL i cholesterol całkowity), poziom glukozy i insuliny w surowicy na czczo oraz ciśnienie krwi; (2) zbadanie podstawowej struktury fenotypowej zespołu metabolicznego u około 10 000 ustalonych par rodzeństwa przy użyciu analizy czynnikowej; (3) aby wybrać i przeskanować genom 800 rodzin jądrowych z puli ustalonych par rodzeństwa przy użyciu zestawu do badań przesiewowych Webera 10 markerów. Każda wybrana rodzina nuklearna zawiera „probanda” i >= 3 innych członków rodziny. Wartości trzech najbardziej znaczących czynników zespołu metabolicznego w analizie czynnikowej (patrz cel szczegółowy 2) zostaną wykorzystane do sklasyfikowania statusu „proband” dla każdego badanego. „Proband” definiuje się jako mający >=2 z 3 wartości czynników mieszczących się po tej samej stronie ogonów percentyla 10/90 odpowiednich rozkładów populacji dostosowanych do wieku i płci; (4) przetestowanie powiązań w rodzinach zeskanowanych genomem na fenotypach pośrednich i czynnikach zespołu metabolicznego przy użyciu metody Unified Haseman-Elston. Oprócz testu jednowymiarowego zostanie przeprowadzona analiza powiązań przy użyciu nowej, wielowymiarowej wersji metody Unified HE, która została ostatnio zaproponowana i okazała się znacznie silniejsza niż test jednowymiarowy dla cech o wspólnych determinantach genetycznych; (5) przeprowadzenie badań powiązań ekspansji lub replikacji na loci zidentyfikowanych w skanie genomu w 300-400 dodatkowych rodzinach z >=1 probantem z gęstszym zestawem markerów.