Полногеномный поиск локусов, лежащих в основе метаболического синдрома

ФОН:

Метаболический синдром, характеризующийся кластеризацией множественных метаболических нарушений, включая абдоминальное ожирение, дислипидемию, гиперинсулинемию, гипергликемию и артериальную гипертензию, является одним из наиболее важных факторов риска сердечно-сосудистых заболеваний и инсульта. Генетика играет важную роль в определении индивидуальной предрасположенности к метаболическому синдрому и межиндивидуальных вариаций связанных с ним фенотипов, хотя эти генетические факторы остаются в значительной степени неизвестными. Долгосрочная цель состоит в том, чтобы идентифицировать гены предрасположенности к метаболическому синдрому и их функциональные варианты.

ОПИСАНИЕ ДИЗАЙНА:

Целью исследования является изучение лежащей в основе фенотипической структуры метаболического синдрома и систематический поиск генетических локусов, предрасполагающих к метаболическому синдрому, с использованием подхода сканирования генома. Конкретные цели заключаются в следующем: (1) провести скрининг около 10 000 пар братьев и сестер в возрасте от 40 до 64 лет в Аньцине, Аньхой, Китай, на промежуточные фенотипы метаболического синдрома, включая индекс массы тела, окружность талии и бедер, профили липидов сыворотки (триглицериды, ЛПВП- , ЛПНП- и общий холестерин), уровень глюкозы и инсулина в сыворотке натощак и кровяное давление; (2) изучить основную фенотипическую структуру метаболического синдрома примерно у 10 000 установленных пар братьев и сестер с использованием факторного анализа; (3) отобрать и сканировать геном 800 нуклеарных семей из пула установленных сиблинговых пар с использованием скринингового набора Вебера из 10 маркеров. Каждая выбранная нуклеарная семья содержит «пробанда» и >=3 других членов семьи. Значения трех наиболее значимых факторов метаболического синдрома в факторном анализе (см. конкретную цель 2) будут использоваться для классификации статуса «пробанда» для каждого субъекта. «Пробанд» определяется как имеющий >=2 из 3 значений факторов, попадающих в одну и ту же сторону 10/90 хвостов процентилей соответствующего распределения населения с поправкой на возраст и пол; (4) проверить сцепление в геномно-сканированных семьях по промежуточным фенотипам и факторам метаболического синдрома с использованием унифицированного метода Хасемана-Эльстона. В дополнение к одномерному тесту анализ сцепления будет выполняться с использованием новой многомерной версии унифицированного метода H-E, который недавно был предложен и показал себя значительно более мощным, чем одномерный тест для признаков с общими генетическими детерминантами; (5) провести исследования экспансии или репликативного сцепления локусов, идентифицированных при сканировании генома, в 300-400 дополнительных семьях с >=1 пробандом с более плотным набором маркеров.