Nadzór genetyczny malarii

Jest to prospektywne badanie obserwacyjne pacjentów z kliniczną infekcją Plasmodium falciparum i/lub Plasmodium Viviax przy użyciu DNA pasożyta z próbek krwi wysuszonych z punktu opieki, a także krótkiej ankiety dotyczącej danych demograficznych pacjentów, zatrudnienia, podróży i korzystania z telefonu komórkowego w celu zbadania genotypów pasożyta P. falciparum, cech populacji i wzorców przepływu genów.

W chwili włączenia do badania i przed zastosowaniem standardowego leczenia, suszone plamki krwi (DBS) będą pobierane przez pobieranie krwi z palca od pacjentów, przy czym od każdego pacjenta pobierane będą dwie lub trzy plamki krwi na jednym kawałku bibuły filtracyjnej. Każda plamka krwi będzie zawierała ~20 μl krwi, co daje w sumie ~ 40-60 μl krwi pobieranej od każdego pacjenta do badania.

Aby lepiej zrozumieć możliwe miejsca przenoszenia malarii i powiązać różnorodność genetyczną z położeniem geograficznym, pacjentom lub ich rodzicom/opiekunom zostanie również zadany krótki zestaw pytań dotyczących danych demograficznych, ich miejsca zamieszkania i pracy, ostatnich korzystania z telefonu i historii podróży. Podstawowe pytania dotyczące korzystania z telefonu dostarczą informacji na temat korzystania z telefonów komórkowych w badanej populacji, w tym z jakich firm telefonii komórkowej korzysta oraz ile kart SIM i telefonów posiada każda osoba. Zostanie wykorzystany do pozyskiwania informacji o przemieszczaniu się ludności z zanonimizowanych, zagregowanych danych dotyczących korzystania z telefonów komórkowych, tj. rejestrów szczegółów połączeń (CDR), uzyskanych od operatorów telefonii komórkowej w każdym kraju. Zostanie to wykorzystane do modelowania przemieszczania się populacji, jego wpływu na rozmieszczenie malarii i oporności na leki przeciwmalaryczne, a następnie przewidywania potencjalnych dróg rozprzestrzeniania się malarii i oporności na leki przeciwmalaryczne. Ponieważ niektóre z tych informacji mogą być wrażliwe, podczas procesu wyrażania zgody pacjent będzie miał możliwość nieudzielania niektórych lub wszystkich tych informacji bez konieczności podania przyczyny. Dla tych, którzy nie chcą podawać informacji, zostanie to udokumentowane w formularzu ankiety. Duplikat kodu kreskowego próbki zostanie umieszczony na tym samym formularzu, aby informacje w nim zawarte można było dopasować do odpowiedniej plamki krwi i związanych z nią danych genetycznych, przy jednoczesnym zachowaniu anonimowości próbki.

Wszyscy pacjenci biorący udział w badaniu otrzymają standardową opiekę nad malarią falciparum, w tym farmakoterapię, zgodnie z krajowymi wytycznymi dotyczącymi leczenia w ich kraju.