Genetisk övervakning av malaria

Detta är en prospektiv observationsstudie av patienter med klinisk Plasmodium falciparum och/eller Plasmodium Viviax-infektion med hjälp av parasit-DNA från fingerprickstorkade blodfläcksprover samt en kort undersökning om patientdemografi, sysselsättning, resor och mobiltelefonanvändning att studera P. falciparum parasit genotyper, populationsegenskaper och genflödesmönster.

Vid inkludering i studien och innan standardbehandling administreras kommer torkade blodfläckar (DBS) att erhållas genom blodprov med fingerstick från patienter, med två eller tre blodfläckar på en bit filterpapper från varje patient. Varje blodfläck kommer att innehålla ~20 µl blod, för totalt ~ 40-60 ul blod som samlas in från varje patient för studien.

För att få en större förståelse för de möjliga platserna för överföring av malaria och för att relatera genetisk mångfald till geografisk plats, kommer patienter eller deras föräldrar/vårdnadshavare också att ställas en kort uppsättning frågor om demografi, deras vistelseorter och arbete, senaste mobil telefonanvändning och deras resor. De grundläggande frågorna om telefonanvändning kommer att ge information om användningen av mobiltelefoner i studiepopulationen, inklusive vilka mobiltelefonbolag som används och hur många SIM-kort och telefoner varje person har med sig. Det kommer att användas för att härleda information om befolkningsrörelser från anonymiserade, aggregerade data om mobiltelefonanvändning, dvs. samtalsdata (CDR), erhållna från mobiltelefonföretag i varje land. Detta kommer att användas för modellering av befolkningsrörelser, dess inverkan på spridningen av malaria och antimalarialäkemedelsresistens, och efterföljande förutsägelse av potentiella spridningsvägar för malaria och antimalarialäkemedelsresistens. Eftersom en del av denna information kan vara känslig kommer patienten under samtyckesprocessen att ges möjlighet att inte tillhandahålla en del av eller all denna information utan att behöva ange en anledning. För den som inte vill lämna information kommer detta att dokumenteras i enkätformuläret. En dubblett av provets streckkod kommer att placeras på samma formulär, så att informationen däri kan matchas med den relevanta blodfläcken och dess relaterade genetiska data, samtidigt som provets anonymitet bibehålls.

Alla patienter i studien kommer att få standardvård för falciparum malaria inklusive läkemedelsbehandling enligt de nationella behandlingsriktlinjerna i deras land.