Malarian geneettinen seuranta

Tämä on prospektiivinen havainnointitutkimus potilaista, joilla on kliininen Plasmodium falciparum ja/tai Plasmodium Viviax -infektio, jossa käytetään loisen DNA:ta hoitopisteestä otetuista sormenpistoilla kuivatuista veripistenäytteistä sekä lyhyt tutkimus potilaiden demografisista tiedoista, työllisyydestä, matkustamisesta ja matkapuhelimen käytöstä. tutkia P. falciparum -loisen genotyyppejä, populaatioiden ominaisuuksia ja geenivirtausmalleja.

Tutkimukseen sisällytettäessä ja ennen tavanomaisen hoidon antamista kuivatut veripisteet (DBS) saadaan sormenpistoverinäytteitä potilailta, jolloin jokaiselta potilaalta otetaan kaksi tai kolme veripistettä yhdestä suodatinpaperin palasta. Jokainen veripiste sisältää ~20 µl verta, jolloin jokaiselta potilaalta kerätään tutkimusta varten yhteensä ~ 40-60 ul verta.

Jotta malarian mahdollisista tartuntakohdista saataisiin parempi käsitys ja geneettisen monimuotoisuuden yhdistäminen maantieteelliseen sijaintiin, potilaille tai heidän vanhemmilleen/huoltajilleen esitetään myös lyhyt kysymyssarja väestötiedoista, heidän asuin- ja työpaikastaan ​​sekä viimeaikaisista matkapuhelimesta. puhelimen käyttö ja heidän matkustushistoriansa. Puhelimen käytön peruskysymykset antavat tietoa matkapuhelimien käytöstä tutkimusväestössä, mm. mitä matkapuhelinyhtiöitä käytetään ja kuinka monta SIM-korttia ja puhelinta kullakin henkilöllä on mukana. Sen avulla saadaan tietoa väestön liikkumisesta kunkin maan matkapuhelinyhtiöiltä hankituista anonymisoiduista, aggregoiduista matkapuhelimen käyttöä koskevista tiedoista eli puhelutietojen tietueista (CDR). Sitä käytetään mallintamaan väestön liikkumista, sen vaikutuksia malarian ja malarialääkeresistenssin leviämiseen sekä sitä myöhempään malarian ja malarialääkeresistenssin mahdollisten leviämisreittien ennustamiseen. Koska osa näistä tiedoista voi olla arkaluonteisia, potilaalle annetaan suostumusprosessin aikana mahdollisuus olla antamatta osaa tai kaikkia tietoja ilman syytä. Niille, jotka eivät halua antaa tietoja, tämä dokumentoidaan kyselylomakkeella. Näyteviivakoodin kaksoiskappale asetetaan tälle samalle lomakkeelle, jotta siinä olevat tiedot voidaan yhdistää asiaankuuluvaan veripisteeseen ja siihen liittyviin geneettisiin tietoihin näytteen anonymiteetin säilyttäen.

Kaikki tutkimukseen osallistuvat potilaat saavat tavallista falciparum-malarian hoitoa, mukaan lukien lääkehoitoa maansa kansallisten hoitosuositusten mukaisesti.