Inicjatywa sekwencjonowania genomu dziedzicznej spastycznej paraplegii (HSPseq)

Dziedziczne paraplegie spastyczne (HSP) to grupa ponad 80 dziedzicznych chorób neurogenetycznych, które mają wspólną cechę postępującej spastyczności. Łącznie HSP stanowią najczęstszą przyczynę dziedzicznej spastyczności i związanej z nią niepełnosprawności, z łączną częstością występowania 2-5 przypadków na 100 000 osób na całym świecie. W postaciach rozpoczynających się w dzieciństwie początkowe objawy są często niespecyficzne i wiele dzieci może nie otrzymać diagnozy, dopóki nie zostaną rozpoznane postępujące cechy, co często prowadzi do znacznego opóźnienia diagnostycznego. Badania genetyczne u dzieci ze spastycznym porażeniem kończyn dolnych nie są jeszcze standardową praktyką.

Rozpoznanie kliniczne HSP nie sugeruje nic na temat jego molekularnej przyczyny, z szerokim zakresem wyników zależnych od dotkniętego genu. Ostatnie postępy w genetyce HSP wskazują na znaczenie tej dziedziny i potrzebę bardziej szczegółowych badań. Ponadto relacje między cechami klinicznymi a mechanizmami genetycznymi nie są dobrze poznane.

Biorąc pod uwagę wpływ genetyki na prawdopodobieństwo rozwoju HSP, a także złożoność i różnorodność fenotypów, postęp w genetyce HSP będzie wymagał wysiłków związanych ze stosunkowo dużymi próbami populacji HSP. Łącząc bardzo szczegółowe informacje o fenotypie z analizami DNA o wysokiej rozdzielczości i wykorzystując nowe podejścia do porównywania informacji o sekwencjach w genach kandydujących lub szukając powiązań fenotyp/genotyp poprzez skanowanie całego genomu, badacze chcą być liderem w tej powstającej dziedzinie HSP badania.

Cele tego badania obejmują:

1. Identyfikacja znalezisk genetycznych (zmiany pojedynczego nukleotydu lub warianty liczby kopii) u pacjentów z postępującą spastyczną paraplegią i zaburzeniami pokrewnymi.
2. Aby skorelować odkrycia molekularne z fenotypami HSP.