Perinnöllinen spastinen paraplegia genominen sekvensointialoite (HSPseq)

Perinnölliset spastiset paraplegiat (HSP) ovat ryhmä yli 80 perinnöllistä neurogeneettistä sairautta, joilla on yhteinen piirre progressiivinen spastisuus. Yhdessä HSP:t ovat yleisin syy perinnölliseen spastisuuteen ja siihen liittyvään vammaisuuteen, ja niiden yhteenlaskettu esiintyvyys on 2-5 tapausta 100 000 henkilöä kohti maailmanlaajuisesti. Lapsuudessa alkaneissa muodoissa alkuoireet ovat usein epäspesifisiä, ja monet lapset eivät ehkä saa diagnoosia ennen kuin etenevät piirteet tunnistetaan, mikä usein johtaa merkittävään diagnoosin viivästymiseen. Spastista paraplegiaa sairastavien lasten geneettinen testaus ei ole vielä vakiokäytäntö.

HSP:n kliininen diagnoosi ei viittaa mitään sen molekyylisyystä, ja monet seuraukset riippuvat geenistä, johon se vaikuttaa. HSP-genetiikan viimeaikainen kehitys puhuu alan tärkeydestä ja tarkemman tutkimuksen tarpeesta. Lisäksi kliinisten piirteiden ja geneettisten mekanismien välisiä suhteita ei ymmärretä hyvin.

Kun otetaan huomioon genetiikan vaikutus HSP:n kehittymisen todennäköisyyteen sekä fenotyyppien monimutkaisuus ja monimuotoisuus, HSP-genetiikan edistyminen vaatii ponnisteluja suhteellisen suurten HSP-populaation näytteiden tarkastelussa. Yhdistämällä erittäin yksityiskohtaiset fenotyyppitiedot korkearesoluutioisiin DNA-analyyseihin ja käyttämällä uusia lähestymistapoja ehdokasgeenien sekvenssitietojen vertailuun tai etsimällä fenotyyppi/genotyyppi-assosiaatioita genominlaajuisella skannauksella, tutkijat pyrkivät olemaan johtaja tällä HSP:n nousevalla alueella. tutkimusta.

Tämän tutkimuksen tavoitteita ovat mm.

1. Geneettisten löydösten (yksittäisten nukleotidien muutokset tai kopioluvun variantit) tunnistaminen potilailla, joilla on etenevä spastinen paraplegia ja siihen liittyviä häiriöitä.
2. Korreloida molekyylilöydöksiä HSP-fenotyyppien kanssa.