Innowacyjne multidyscyplinarne strategie zwalczania ciężkiej dengi (COMBAT)

Tło: Wiele trwających badań klinicznych nad dengą ma na celu ocenę zarówno związków terapeutycznych, jak i potencjalnych kandydatów na szczepionki. Związki terapeutyczne mają na celu nakierowanie na różne etapy replikacji wirusa dengi, takie jak wejście wirusa, poprzez hamowanie fuzji wirusa, inhibitor polimerazy NS5 i redukcję antygenemii NS1, żeby wymienić tylko kilka. Jednakże nie opracowano jeszcze podejścia opartego na omikach do identyfikacji szlaków metabolicznych wykorzystywanych przez dengę do osłabienia systemu gospodarza w celu uzyskania energii, a następnie wdrożenia wirusowych strategii unikania odporności. Badanie to skupi się na zbadaniu i zrozumieniu szlaków wykorzystywanych przez wirusa dengi oraz zbadaniu, czy zablokowanie zidentyfikowanego szlaku może spowodować „głód” wirusa.

• Badanie zapewni wgląd w zróżnicowany zakres markerów zakażenia dengą na poziomie systemowym oraz rozregulowane cząsteczki zaangażowane w szlaki komórkowe i metaboliczne podczas zakażenia dengą.
• Identyfikacja nowych szlaków, na które wpływa rozregulowanie cząsteczek, ujawni powiązanie biomarkerów z odpowiedzią immunologiczną i ciężkością choroby, pomagając w ten sposób usprawnić selekcję i leczenie pacjentów.
• Zidentyfikowane biomarkery będą istotne w monitorowaniu pacjentów, tworząc platformę dla wczesnej interwencji w celu złagodzenia ciężkiej postaci dengi poprzez nowe cele terapeutyczne i strategie postępowania.

Podstawowymi celami proponowanego badania są:

• Serotypowanie wirusa w zależności od przypadku i badanie profilu cytokin gospodarza.
• Ogólnoustrojowa transkryptomika i proteomika krwi podczas zakażenia dengą i jej związek z ciężkością choroby.
• Identyfikacja szlaków wpływających na dotkliwość za pomocą badań mechanistycznych in vitro.

Kohorty badawcze:

Wykorzystany zostanie materiał kliniczny z dwóch regionów endemicznych, jednego z Ameryki Środkowej (Gwatemala) i Azji Południowo-Wschodniej (Indie). Gwatemala jest wzorowym miejscem do badania infekcji DENV ze względu na charakterystyczne połączenie różnorodności klimatycznej oraz obecności gatunków endemicznych i dengi. Od pacjentów zostaną pobrane dwie próbki krwi (w dniu hospitalizacji i w dniu wypisu) zgodnie z poprawioną klasyfikacją przypadków WHO z 2009 roku: 1) denga bez objawów ostrzegawczych (DwoWS, n=200), 2) denga z objawami ostrzegawczymi (DWS, n=200), 3) ciężka denga (SD, n=200). Dodatkowo od zdrowych osób kontrolnych (n=200) zostaną pobrane próbki niezakażone dengą. Ta kohorta będzie pełnić funkcję kohorty ODKRYCIA. Będziemy pobierać pełną krew do probówki TempusTM (do sekwencjonowania RNA) i surowicę (do proteomiki i metabolomiki).

W ramach współpracy Indie-UE w zakresie badań naukowych i innowacji (R&I) oraz partnerstwa w zakresie współfinansowania w ramach programu ramowego UE dotyczącego badań naukowych i innowacji „Horyzont Europy” próbki będą pobierane z Indii, ze szpitala Artemis w New Delhi, Max Health Care w New Delhi ( oddział Fundacji Devki Devi) i Kasturba Medical College Hospital w Mangalore. Są to dwa epicentra endemicznej dengi w Indiach. Zostaną zebrane 50 próbek z każdej klasyfikacji nasilenia dengi (łącznie 150 próbek w każdej kategorii) i zdrowej kontroli negatywnej pod względem DENV (łącznie 150: 50 w każdym ośrodku). Kohorty indyjskie będą pełnić rolę kohort WALIDACYJNYCH.

Rekrutacja osób do kontroli Zdrowi uczestnicy, u których w ciągu ubiegłych trzech miesięcy wynik testu na obecność dengi był negatywny, nie zostaną zaproszeni do badania, które zostanie następnie dopasowane pod względem wieku i płci do przypadków. Próbki te zostaną zbadane pod kątem IgM przeciwko dendze i testu ELISA NS1, aby wykluczyć trwającą bezobjawową infekcję. Zostaną także poddani testowi ELISA IgG przeciwko dendze w celu sprawdzenia, czy nie przebyli zakażenia dengą. Każdy z uczestników kontroli zostanie także poproszony o przedstawienie szczegółowego wywiadu lekarskiego