Innovative tværfaglige strategier til bekæmpelse af svær dengue (COMBAT)

Baggrund: Mange igangværende kliniske forsøg med dengue har til formål at evaluere både terapeutiske forbindelser og potentielle vaccinekandidater. De terapeutiske forbindelser sigter mod at målrette forskellige stadier af dengue-virusreplikation, såsom viral indtrængen, ved at hæmme virusfusion, NS5-polymerasehæmmer og NS1-antigenæmi-reduktion, for at nævne nogle få. En omics-baseret tilgang til at identificere de metaboliske veje, som dengue bruger til at undergrave værtssystemet til at hente energi fra og efterfølgende implementere virale immunundvigelsesstrategier, er dog endnu ikke blevet etableret. Denne undersøgelse vil fokusere på at udforske og forstå de veje, som dengue-virussen udnytter, og undersøge, om blokering af den identificerede vej kan få virussen til at 'sulte'.

• Undersøgelsen vil give indsigt i den mangfoldige række af dengue-infektionsmarkører på systemniveau og de dysregulerede molekyler involveret i cellulære og metaboliske veje under dengue-infektion.
• Identifikationen af ​​nye veje påvirket af molekyle dysregulering vil afsløre sammenhængen mellem biomarkørerne med immunrespons og sygdommens sværhedsgrad, og derved bidrage til at forbedre patientens triage og behandling.
• De identificerede biomarkører vil være væsentlige i overvågningen af ​​patienter og skabe en platform for tidlig intervention til at afbøde svær dengue gennem nye terapeutiske mål og håndteringsstrategier.

De primære mål med den foreslåede undersøgelse er:

• Case-wise viral serotyping og undersøgelse af værtscytokinprofil.
• Systemomfattende blodtranskriptomik og proteomik under dengue-infektion og dens sammenhæng med sygdommens sværhedsgrad.
• Identifikation af veje, der påvirker sværhedsgraden ved in vitro-mekanistiske undersøgelser.

Studiekohorter:

Der vil blive brugt klinisk materiale fra to endemiske regioner, en fra Mellemamerika (Guatemala) og Sydøstasien (Indien). Guatemala er et eksemplarisk sted for at studere DENV-infektionen på grund af dens karakteristiske kombination af klimatisk mangfoldighed og endemisk og dengue-tilstedeværelse. To blodprøver (på indlæggelsesdagen og udskrivelsesdagen) fra patienterne vil blive indsamlet i henhold til WHOs reviderede 2009-tilfældeklassificering: 1) denguefeber uden advarselstegn (DwoWS, n=200), 2) denguefeber med advarselstegn (DWS, n=200), 3) svær dengue (SD, n=200). Derudover vil ikke-dengue-prøver blive indsamlet fra raske kontroller (n=200). Denne kohorte vil fungere som DISCOVERY-kohorten. Vi vil opsamle fuldblod i et TempusTM-rør (til RNA-sekventering) og serum (til proteomics og metabolomics).

Under Indien-EU-samarbejdet om forskning og innovation (F&I) og samfinansieringspartnerskab under EU's rammeprogram for F&I 'Horizon Europe, vil der blive indsamlet prøver fra Indien, fra Artemis Hospital, New Delhi, Max Health Care, New Delhi ( en enhed af Devki Devi Foundation) og Kasturba Medical College Hospital, Mangalore. Det er de to epicentre for dengue-endemien i Indien. 50 prøver fra hver dengue-sværhedsklassifikation (samlet prøver 150 i hver kategori) og DENV-negativ sund kontrol (i alt 150: 50 på hvert sted) vil blive indsamlet. De indiske kohorter vil fungere som VALIDERINGskohorter.

Rekruttering af kontroller Raske deltagere, der har testet negative for dengue-infektion inden for de seneste tre måneder, vil ikke blive rekrutteret til undersøgelsen, som vil blive yderligere alders- og kønsmatchet med tilfældene. Disse prøver vil blive testet for anti-dengue IgM og NS1 ELISA for at udelukke igangværende asymptomatisk infektion. De vil også blive udsat for anti-dengue IgG ELISA for at kontrollere for tidligere dengue-infektion. Hver af kontroldeltagerne vil også blive bedt om at give en detaljeret sygehistorie