Инновационные междисциплинарные стратегии борьбы с тяжелой формой денге (COMBAT)

Предыстория: Многие текущие клинические испытания против денге направлены на оценку как терапевтических соединений, так и потенциальных кандидатов на вакцины. Терапевтические соединения нацелены на различные стадии репликации вируса денге, такие как проникновение вируса, путем ингибирования слияния вирусов, ингибитора полимеразы NS5 и снижения антигенемии NS1, и это лишь некоторые из них. Однако основанный на омике подход к выявлению метаболических путей, которые денге использует для разрушения системы хозяина с целью получения энергии и последующего применения стратегий уклонения от вирусного иммунитета, еще не разработан. Это исследование будет сосредоточено на изучении и понимании путей, по которым использует вирус денге, а также на изучении того, может ли блокирование выявленного пути привести к «голоданию» вируса.

• Исследование даст представление о разнообразном диапазоне маркеров инфекции денге на системном уровне и о нарушенной регуляции молекул, участвующих в клеточных и метаболических путях во время инфекции денге.
• Идентификация новых путей, на которые влияет молекулярная дисрегуляция, раскроет связь биомаркеров с иммунным ответом и тяжестью заболевания, тем самым помогая улучшить сортировку пациентов и лечение.
• Выявленные биомаркеры будут иметь важное значение для наблюдения за пациентами, создавая платформу для раннего вмешательства для смягчения последствий тяжелой лихорадки денге с помощью новых терапевтических целей и стратегий управления.

Основными задачами предлагаемого исследования являются:

• Индивидуальное серотипирование вируса и исследование профиля цитокинов хозяина.
• Общесистемная транскриптомика и протеомика крови во время инфекции денге и ее связь с тяжестью заболевания.
• Выявление путей, влияющих на тяжесть заболевания, с помощью механистических исследований in vitro.

Группы исследования:

Будет использован клинический материал из двух эндемичных регионов: Центральной Америки (Гватемала) и Юго-Восточной Азии (Индия). Гватемала является образцовым местом для изучения инфекции DENV благодаря особому сочетанию климатического разнообразия и присутствия эндемиков и лихорадки денге. У пациентов будут взяты два образца крови (в день госпитализации и в день выписки) в соответствии с пересмотренной классификацией случаев ВОЗ 2009 г.: 1) лихорадка денге без настораживающих признаков (DwoWS, n=200), 2) лихорадка денге с настораживающими признаками. (DWS, n=200), 3) тяжелая лихорадка денге (SD, n=200). Кроме того, у здоровых людей контрольной группы (n=200) будут взяты образцы, не инфицированные денге. Эта когорта будет действовать как когорта DISCOVERY. Мы соберем цельную кровь в пробирку TempusTM (для секвенирования РНК) и сыворотку (для протеомики и метаболомики).

В рамках сотрудничества Индии и ЕС в области исследований и инноваций (НИОКР) и партнерства по совместному финансированию в рамках рамочной программы ЕС по НИОКР «Горизонт Европы» образцы будут собраны в Индии, в больнице Артемида, Нью-Дели, Max Health Care, Нью-Дели ( подразделение Фонда Девки Деви) и Больницу Медицинского колледжа Кастурба, Мангалор. Это два эпицентра эндемической лихорадки денге в Индии. Будет собрано по 50 образцов из каждой классификации степени тяжести лихорадки денге (всего 150 образцов в каждой категории) и здоровых контрольных больных с отрицательным DENV (всего 150:50 в каждом месте). Индийские когорты будут действовать как когорты ПРОВЕРКИ.

Набор контрольной группы. Здоровые участники, у которых за последние три месяца был отрицательный результат теста на инфекцию денге, не будут участвовать в исследовании, которое будет дополнительно сопоставлено по возрасту и полу со случаями. Эти образцы будут проверены на наличие IgM против денге и ИФА NS1, чтобы исключить продолжающуюся бессимптомную инфекцию. Они также будут подвергнуты тесту ELISA на антитела к денге IgG, чтобы проверить наличие перенесенной инфекции денге. Каждому из участников контрольной группы также будет предложено предоставить подробную историю болезни.