Badanie udziału zmutowanych białek P53/YAP w oporność na terapię w nawracającym raku głowy i szyi

Celem badania jest scharakteryzowanie sieci molekularnych zarządzanych przez zmutowane białko p53, odgrywających istotną rolę w rozwoju wznowy miejscowej w nowotworach głowy i szyi HNSCC, w celu zidentyfikowania głównych aktorów zaangażowanych w oporność na obecną terapię i podjęcie próby opracowania nowych, bardziej skutecznych terapii. Strategie terapeutyczne w nowotworach głowy i szyi.

Ponadto badane zostanie istnienie znaczącego związku między czasem wystąpienia nawrotu a deregulacją zidentyfikowanych sieci molekularnych.

To badanie pozwoli zatem:

1. Identyfikacja sieci związanych z obecnością mutacji w genie TP53 istotnych dla rozwoju nawrotu, porównując tkanki guza pierwotnego z odpowiednią tkanką nawrotu u pacjentów dotkniętych nowotworami głowy i szyi, poprzez:

   1. profile ekspresji kodujących i niekodujących RNA (kohorta retrospektywna)
   2. profil mutacyjny według NGS (kohorta retrospektywna)
   3. Sekwencjonowanie RNA pojedynczej komórki (SC-RNASEQ) na próbkach należących do prospektywnej kohorty
2. Scharakteryzuj mechanizmy molekularne leżące u podstaw sieci zależnych od TP53, odgrywające kluczową rolę w oporności na terapię, przy użyciu systemów komórek opornych i kultur organoidalnych pochodzących z nowotworów głowy i szyi HNSCC (PDO) (kohorta prospektywna).
3. Zidentyfikuj najlepsze kombinacje leczenia zdolne do celowania w sieci zidentyfikowane jako związane z oporem (kohorta prospektywna).
4. Ocena odpowiedzi na leczenie in vivo przy użyciu syngenicznego modelu nowotworów głowy i szyi HNSCC (model MOC).