Utilidade clínica do sequenciamento completo do exoma pediátrico

O sequenciamento de próxima geração (NGS) está mudando o paradigma dos testes genéticos clínicos. Ao contrário dos testes de gene único altamente focados, o NGS permite examinar painéis de genes, o exoma e todo o genoma. Com a ampla variedade de testes moleculares agora disponíveis, os médicos solicitantes enfrentam o dilema de selecionar a melhor ferramenta de diagnóstico para pacientes com suspeita de condições genéticas. O teste de gene único geralmente é mais apropriado para condições com características clínicas distintas e heterogeneidade mínima de locus. O teste de painel de genes baseado em NGS, que pode ser complementado com análise de microarranjo cromossômico (CMA) e outros métodos auxiliares, fornece uma abordagem abrangente e viável para distúrbios bem documentados, mas geneticamente heterogêneos. O sequenciamento completo do exoma (WES) e o sequenciamento completo do genoma (WGS) têm a vantagem de permitir a interrogação paralela da maioria dos genes no genoma humano. Para alguns, o WES é preferível aos métodos usados ​​anteriormente devido ao maior rendimento diagnóstico, menor tempo para o diagnóstico e melhor custo-benefício.

A capacidade de pesquisar o exoma abre novas oportunidades e novos desafios. Por exemplo, todas as regiões de codificação de genes conhecidos devem ser analisadas ao aplicar o WES a casos não diagnosticados com padrões de herança pouco claros. As limitações atuais nas capacidades de interpretação de variantes e validade clínica levantam questões sobre a utilidade clínica do WES como um teste de diagnóstico independente ou de primeira escolha. Desafios adicionais incluem aconselhamento pré e pós-teste com consentimento informado adequado e robusto, configuração e validação de análise bioinformática, interpretação e classificação de variantes, a necessidade de políticas e protocolos relativos à descoberta e relato de achados secundários não relacionados à indicação apresentada, um requisito para validação dos resultados do WES, garantia de conformidade com os padrões de controle de qualidade, armazenamento e acessibilidade de dados e questões de reembolso.

A introdução do WES no atendimento clínico pediátrico de populações sub-representadas levanta questões adicionais e considerações sobre cobertura de pagamento, acesso e padrões de atendimento. Além da enorme complexidade do teste e seus resultados, os médicos e os sistemas de saúde devem abordar inúmeras considerações, incluindo: cobertura de seguro público e privado; diferenças de linguagem e cultura e suas implicações para aconselhamento genético e relações médico-paciente; capacidade de acesso a testes de acompanhamento e cuidados clínicos; e capacidade de acesso a tratamento e serviços adequados. Essas questões e outras afetarão não apenas a tomada de decisão dos pacientes em relação ao WES, mas também suas necessidades pós-teste para acompanhamento do paciente. A importância de avaliar sistematicamente a utilidade clínica do NGS é fundamental para determinar em quais contextos clínicos e de saúde o WES será útil e para iniciar pesquisas sobre essas considerações.