BIOMIGA: Resultados de Ressonância Magnética

Os dados de Hamburgo foram processados ​​conforme indicado abaixo e serão utilizados como conjunto de dados independente para geração de hipóteses. Os dados dos outros dois locais (Itália e Espanha) serão processados ​​de forma idêntica ao conjunto de dados de Hamburgo:

rs-FMRI

O pré-processamento dos dados funcionais de MR em estado de repouso seguiu o pipeline SPM12 (//www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/software/spm12/) usando correção de tempo de fatia, realinhamento, co-registro para a imagem estrutural, normalização no espaço MNI e suavização com um kernel Gausiano de 8 mm ^ 3. Os dados foram analisados ​​posteriormente usando a caixa de ferramentas CONN (https://web.conn-toolbox.org/) onde um 0,003-0,08 Filtro temporal Hz e remoção de ruído com regressão linear de efeitos de confusão (substância branca, LCR, movimento) e eliminação de tendência linear. Nós escolhemos:

• Homogeneidade Local (LCOR),
• Correlações Globais (GCOR),
• Correlações Baseadas em Sementes (SBC): Semente para voxel e ROI para ROI com uma máscara adicional do hipotálamo
• Análises de Componentes Independentes (grupo-ICA),
• Amplitude de flutuações de baixa frequência (ALFF)

As comparações estatísticas calculadas são definidas como resultados primários e secundários abaixo e incluem (i) previsão do resultado do tratamento (redução nos dias de dor de cabeça) de T0 (RP adicional), (ii) alterações entre T0 e T1, (iii) diferenças entre controles saudáveis ​​e pacientes com enxaqueca em T0 (mais HvsPAT) e (iv) diferenças entre respondedores e não respondedores em T0 e T1.

Na hipótese de geração de dados de Hamburgo, resultados significativos em um limiar de p <0,05 corrigido por FDR por cluster com um limiar de entrada de p <0,001 não corrigido por voxel, quando corrigido para idade e sexo em:

• LCOR: PR: Dois agrupamentos no córtex occipital lateral esquerdo e no córtex fusiforme temporal direito; HvsPAT: tálamo bilateral, opérculo frontal esquerdo.
• Semente SBC para Voxel: PR: clusters do Hipotálamo 2, cluster Sensori Motor Lateral R 1, cluster Visula Lateral L 1, cluster Visual Lateral R 3; HvsPAT: Cluster Sensori Motor Lateral L 5, Cluster Sensori Motor Lateral R 1, Cluster Sensori Motor Superior 3, Cluster Visual Medial 3, Cluster Visual Occipital 1, Cluster Visual Lateral L 4, Cluster Visual Lateral R 1,
• ICA: cluster ICA 5 2, cluster ICA 16 2, cluster ICA 28 1, cluster ICA 34 2; HvsPAT: ICA 4 3 cluster, ICA 6 4 cluster, ICA 14 4 cluster, ICA 18 2 cluster, ICA 27 3 cluster, ICA 29 14 cluster, ICA 33 3 cluster, ICA 36 7 cluster, ICA 38 6 cluster
• Não houve resultados significativos para SBC ROI para ROI, GCOR e ALFF
• Não houve resultados significativos para o limiar escolhido para as comparações entre respondedores e não respondedores em T0 e T1. Os resultados preliminares para a conectividade local e global foram recentemente apresentados numa conferência científica.

Para reproduzir os resultados significativos dos dados de Hamburgo, foi escolhido um pequeno limiar corrigido pelo volume de p<0,05. Para resultados não significativos, o limite estatístico para os dados dos outros dois locais será definido para p<0,05 corrigido por FWE em termos de voxel.

Imagens MPRAGE Raw T1 (também conhecidas como MPRAGE) foram processadas usando a caixa de ferramentas CAT12 (https://neuro-jena.github.io/cat12-help/) que estende o SPM12 (https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/software/spm12/). Para controles e pacientes com enxaqueca com dados apenas do primeiro dia, as imagens foram segmentadas em compartimentos de substância cinzenta e branca e normalizadas. Para pacientes com dados de 2 dias, os dados foram segmentados longitudinalmente. Imagens de matéria cinzenta e branca foram suavizadas com um núcleo gaussiano isotrópico de 6 mm3. O teste T e os testes F implementados na caixa de ferramentas SPM12 foram usados ​​para estimar diferenças significativas em um limite de p <0,05 correto por cluster. O volume intracraniano total individual (TIV), que também é estimado pela caixa de ferramentas CAT12, foi usado como covariável para controlar diferentes tamanhos cerebrais. Idade e sexo foram utilizados como covariáveis ​​adicionais quando indicado. Todos os resultados foram mascarados por máscaras de substância cinzenta ou branca decorrentes de uma segmentação dos T1s normalizados médios dos participantes. O limite estatístico para as hipóteses que geram o conjunto de dados de Hamburgo foi definido para p <0,05 corrigido por FDR por cluster com um limite de entrada de p <0,001 não corrigido por voxel. Como nenhum resultado significativo foi alcançado, o limite estatístico para os dados dos outros dois locais será definido para p<0,05 corrigido por FWE em termos de voxel.

ASL ASL ainda não foi analisado para nenhum dos sites. Para as estatísticas usaremos Imagens de Perfusão Cerebral provenientes da caixa de ferramentas ASLtbx (https://www.cfn.upenn.edu/zewang/ASLtbx_manual.pdf). No entanto, como estavam disponíveis diferentes protocolos de imagem em Espanha e Itália, é necessário primeiro comprovar uma comparação da igualdade. Portanto, adquirimos ambos os protocolos nos dados de Hamburgo. Como não esperamos quaisquer diferenças aqui, o limite estatístico será definido para p<0,05 corrigido por FWE em termos de voxel.

Cálculo de potência com base em dados de RM de Hamburgo Análise de potência do resultado primário "predição de redução de dor de cabeça com medidas de conectividade funcional em estado de repouso de fMRI do dia 1" para o qual foram analisados ​​dados de rs-fMRI de 54 pacientes com enxaqueca do local gerador de hipóteses de Hamburgo usando a caixa de ferramentas CONN revelou que 37 pacientes com enxaqueca são necessários para reproduzir o resultado de comodulação significativa na correlação local quando corrigido para idade e sexo (poder de 80%, p <0,05 corrigido por FWE calculado com PowerMap). As verificações iniciais de qualidade dos dados dos outros dois locais revelam dados disponíveis suficientes para reprodução.