BIOMIGA: Resultater fra magnetisk resonansbilleddannelse

Hamburg-dataene blev behandlet som angivet nedenfor og vil blive brugt som uafhængigt datasæt til hypotesegenerering. Dataene fra de to andre websteder (Italien og Spanien) vil blive behandlet identisk med datasættet i Hamborg:

rs-FMRI

Forbehandling af hviletilstandens funktionelle MR-data fulgte SPM12-pipelinen (https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/software/spm12/) ved brug af udsnitstidskorrektion, omjustering, samregistrering til det strukturelle billede, normalisering til MNI-rum og udjævning med en 8 mm^3 Gausian-kerne. Data blev yderligere analyseret ved hjælp af CONN-værktøjskassen (https://web.conn-toolbox.org/) hvor en 0,003-0,08 Hz temporal filter og denoising med lineær regression af forvirrende effekter (hvidt stof, CSF, bevægelse) og lineær detrending. Vi vælger:

• Lokal Homogenitet (LCOR),
• Globale korrelationer (GCOR),
• Seed-Based Correlations (SBC): Frø til voxel og ROI til ROI med en ekstra maske af hypothalamus
• Uafhængige komponentanalyser (gruppe-ICA),
• Amplitude af lavfrekvente udsving (ALFF)

De beregnede statistiske sammenligninger er defineret som primære og sekundære udfald nedenfor og inkluderer (i) forudsigelse af behandlingsresultat (reduktion i hovedpinedage) fra T0 (yderligere PR), (ii) ændringer mellem T0 og T1, (iii) forskelle mellem raske kontroller og migrænepatienter ved T0 (yderligere HvsPAT), og (iv) forskelle mellem respondere og non-respondere ved T0 og T1.

I den hypotese, der genererer Hamburg-data, blev der fundet signifikante resultater ved en tærskel på klyngevis FDR-korrigeret p<0,05 med en indgangstærskel på voxel-vis ukorrigeret p<0,001, når korrigeret for alder og køn i:

• LCOR: PR: To klynger i venstre lateral occipital cortex og højre temporal fusiform cortex; HvsPAT: bilateral thalamus venstre frontale operculum.
• SBC frø til Voxel: PR: Hypothalamus 2 klynger, Sensorisk Motor Lateral R 1 klynge, Visula Lateral L 1 klynge, Visuel Lateral R 3 klynge; HvsPAT: Sensori Motor Lateral L 5 klynge, Sensori Motor Lateral R 1 klynge, Sensori Motor Superior 3 klynge, Visual Medial 3 klynge, Visual Occipital 1 klynge, Visual Lateral L 4 klynge, Visual Lateral R 1 klynge,
• ICA: ICA 5 2 klynge, ICA 16 2 klynge, ICA 28 1 klynge, ICA 34 2 klynge; HvsPAT: ICA 4 3 cluster, ICA 6 4 cluster, ICA 14 4 cluster, ICA 18 2 cluster, ICA 27 3 cluster, ICA 29 14 cluster, ICA 33 3 cluster, ICA 36 7 cluster, ICA 38 cluster
• Der var ingen signifikante resultater for SBC ROI til ROI, GCOR og ALFF
• Der var ingen signifikante resultater for den valgte tærskel for sammenligningerne mellem respondere og ikke-responderer ved T0 og T1. Foreløbige resultater for lokal og global forbindelse blev for nylig præsenteret på en videnskabelig konference.

For at gengive de signifikante resultater fra Hamburg-dataene er der valgt en lille volumenkorrigeret tærskel på p<0,05. For ikke-signifikante resultater vil den statistiske tærskel for data fra de to andre steder blive sat til voxel-vist FWE-korrigeret p<0,05.

MPRAGE Raw T1-billeder (aka MPRAGE) blev behandlet ved hjælp af CAT12-værktøjskassen (https://neuro-jena.github.io/cat12-help/) som omfatter SPM12 (https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/software/spm12/). For kontroller og migrænepatienter med data fra kun den første dag, blev billederne segmenteret i rum med gråt og hvidt stof og normaliseret. For patienter med data fra 2 dage blev data segmenteret i længderetningen. Billeder af gråt og hvidt stof blev glattet med en isotrop Gauss-kerne på 6 mm3. T-test og F-test implementeret i SPM12 værktøjskassen blev brugt til at estimere signifikante forskelle ved en tærskel på klyngemæssigt korrekt p<0,05. Det individuelle totale intrakranielle volumen (TIV), som også estimeres af CAT12-værktøjskassen, blev brugt som kovariat til at kontrollere for forskellige hjernestørrelser. Alder og køn blev brugt som yderligere kovariater, når det var angivet. Alle resultater blev maskeret af grå- eller hvidstofmasker, der stammede fra en segmentering af de gennemsnitlige normaliserede T1'er for deltagerne. Den statistiske tærskel for de hypoteser, der genererer datasæt fra Hamburg, blev sat til klyngevis FDR-korrigeret p<0,05 med en indgangstærskel på voxel-vist ukorrigeret p<0,001. Da der ikke blev opnået signifikante resultater, vil den statistiske tærskel for data fra de to andre steder blive sat til voxel-vist FWE-korrigeret p<0,05.

ASL ASL er endnu ikke analyseret for nogen af ​​webstederne. Til statistikken vil vi bruge Cerebral Perfusion Images, der stammer fra værktøjskassen ASLtbx (https://www.cfn.upenn.edu/zewang/ASLtbx_manual.pdf). Ikke desto mindre, da forskellige billeddannelsesprotokoller var tilgængelige i Spanien og Italien, skal en sammenligning af ligheden bevises først. Derfor erhvervede vi begge protokoller i Hamburg-dataene. Da vi ikke forventer nogen forskelle her, vil den statistiske tærskel blive sat til voxel-mæssigt FWE-korrigeret p<0,05.

Effektberegning baseret på Hamburg MR-data Effektanalyse af det primære udfald "forudsigelse af hovedpinereduktion med hviletilstand funktionelle tilslutningsmål fra fMRI på dag 1", for hvilke rs-fMRI-data fra 54 migrænepatienter fra det hypotesegenererende sted Hamburg blev analyseret vha. CONN-værktøjskassen afslørede, at 37 migrænepatienter er nødvendige for at reproducere resultatet af signifikant comodulation i lokal korrelation, når korrigeret for alder og køn (80 % Power, FWE-korrigeret p<0,05 beregnet med PowerMap). Indledende kvalitetstjek af dataene fra de to andre steder afslører nok tilgængelige data til reproduktion.