БИОМИГА: Результаты магнитно-резонансной томографии

Данные Гамбурга были обработаны, как указано ниже, и будут использоваться в качестве независимого набора данных для генерации гипотез. Данные двух других сайтов (Италии и Испании) будут обрабатываться идентично набору данных Гамбурга:

РС-ФМРТ

Предварительная обработка функциональных данных МРТ в состоянии покоя проводилась по конвейеру SPM12 (https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/software/spm12/) с использованием коррекции времени среза, перестройки, совместной регистрации со структурным изображением, нормализация в пространство MNI и сглаживание с помощью гаусова ядра 8 мм^3. Данные были дополнительно проанализированы с использованием CONN-toolbox (https://web.conn-toolbox.org/). где 0,003-0,08 Временной фильтр Гц и шумоподавление с линейной регрессией мешающих эффектов (белое вещество, спинномозговая жидкость, движение) и линейным удалением тренда. Мы выбираем:

• Локальная однородность (LCOR),
• Глобальные корреляции (GCOR),
• Корреляции на основе семян (SBC): от начального значения до вокселя и от ROI к ROI с дополнительной маской гипоталамуса.
• Независимый анализ компонентов (группа-ICA),
• Амплитуда низкочастотных колебаний (ALFF)

Рассчитанные статистические сравнения определяются как первичные и вторичные исходы, указанные ниже, и включают (i) прогнозирование результата лечения (уменьшение количества дней с головной болью) на основе T0 (дальнейшее PR), (ii) изменения между T0 и T1, (iii) различия между здоровыми людьми контрольной группы и пациенты с мигренью в Т0 (далее HvsPAT) и (iv) различия между ответившими и не ответившими на Т0 и Т1.

В гипотезе, генерирующей гамбургские данные, были обнаружены значимые результаты при пороге кластерной коррекции FDR p<0,05 с порогом входа воксельной нескорректированной p<0,001, с поправкой на возраст и пол:

• LCOR: PR: два кластера в левой латеральной затылочной коре и правой височной веретенообразной коре; HvsPAT: двусторонний таламус левой лобной покрышки.
• SBC Seed для вокселей: PR: кластер гипоталамуса 2, кластер сенсорно-моторной латеральной части R 1, кластер латеральной части зрительного нерва L 1, кластер зрительной латеральной части R 3; HvsPAT: Сенсорно-моторный латеральный кластер L 5, Сенсорно-моторный латеральный кластер R 1, Сенсорно-моторный верхний кластер 3, Зрительный медиальный кластер 3, Зрительный затылочный кластер 1, Зрительный латеральный кластер L 4, Зрительный латеральный кластер R 1,
• ICA: кластер ICA 5 2, кластер ICA 16 2, кластер ICA 28 1, кластер ICA 34 2; HvsPAT: кластер ICA 4 3, кластер ICA 6 4, кластер ICA 14 4, кластер ICA 18 2, кластер ICA 27 3, кластер ICA 29 14, кластер ICA 33 3, кластер ICA 36 7, кластер ICA 38 6
• Не было никаких существенных результатов для рентабельности инвестиций SBC в рентабельность инвестиций, GCOR и ALFF.
• Для выбранного порога не было получено значимых результатов для сравнения ответивших и не ответивших на T0 и T1. Предварительные результаты по локальному и глобальному подключению были недавно представлены на научной конференции.

Чтобы воспроизвести значимые результаты по данным Гамбурга, был выбран небольшой порог с поправкой на объем p<0,05. В случае незначительного результата статистический порог для данных двух других сайтов будет установлен как воксельно скорректированный FWE p<0,05.

MPRAGE Необработанные T1-изображения (также известные как MPRAGE) были обработаны с использованием набора инструментов CAT12 (https://neuro-jena.github.io/cat12-help/). который расширяет SPM12 (https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/software/spm12/). Для контрольной группы и пациентов с мигренью, у которых были данные только за первый день, изображения были сегментированы на отсеки серого и белого вещества и нормализованы. Для пациентов с данными за 2 дня данные были сегментированы в продольном направлении. Изображения серого и белого вещества сглаживались изотропным ядром Гаусса объемом 6 мм3. T-тест и F-тесты, реализованные в наборе инструментов SPM12, использовались для оценки значимых различий при пороге кластерной корректности p<0,05. Индивидуальный общий внутричерепной объем (TIV), который также оценивается с помощью набора инструментов CAT12, использовался в качестве ковариаты для контроля различных размеров мозга. При необходимости в качестве дополнительных ковариат использовались возраст и пол. Все результаты были замаскированы масками серого или белого вещества, возникающими в результате сегментации средних нормализованных значений T1 участников. Статистический порог для набора данных, генерирующих гипотезы, из Гамбурга был установлен на уровне кластерного скорректированного FDR p<0,05 с порогом входа для воксельного нескорректированного p<0,001. Поскольку значимых результатов достигнуто не было, статистический порог для данных двух других сайтов будет установлен на значение p<0,05, скорректированное с помощью вокселей FWE.

ASL ASL еще не анализировался ни на одном из сайтов. Для статистики мы будем использовать изображения перфузии головного мозга из набора инструментов ASLtbx (https://www.cfn.upenn.edu/zewang/ASLtbx_manual.pdf). Тем не менее, поскольку в Испании и Италии были доступны разные протоколы визуализации, сначала необходимо доказать равенство. Поэтому мы получили оба протокола в данных Гамбурга. Поскольку мы не ожидаем здесь каких-либо различий, статистический порог будет установлен на значение p<0,05, скорректированное с помощью вокселей FWE.

Расчет мощности на основе данных МРТ в Гамбурге. Анализ мощности основного результата «прогнозирование уменьшения головной боли с помощью показателей функциональной связи в состоянии покоя по данным фМРТ в день 1», для которого были проанализированы данные rs-фМРТ 54 пациентов с мигренью из центра генерации гипотез в Гамбурге с использованием Набор инструментов CONN показал, что 37 пациентов с мигренью необходимы для воспроизведения результата значительной комодуляции в локальной корреляции с поправкой на возраст и пол (мощность 80%, скорректированное FWE p<0,05, рассчитанное с помощью PowerMap). Первоначальные проверки качества данных с двух других сайтов выявили достаточно доступных данных для воспроизведения.