Преобразование генетических знаний в клиническую помощь при неаутоиммунном диабете (TRANSLATE)

Проект TRANSLATE — это интегративный проект с многогранными целями, которые можно разбить на две основные группы. Основой для обеих колонок является анализ WGS в условиях клинической диагностики, чтобы направлять лечение пациента. Пациенты не рандомизируются, а критерии включения и исключения преднамеренно широкие и минимальные соответственно.

Первая колонка — это проект клинической разработки, целью которого является завершение нового диагностического процесса. Эта колонка будет посвящена разработке новых направлений и раскрытию барьеров и проблем, связанных с прецизионной медициной на основе генов, чтобы способствовать устойчивому внедрению прецизионной медицины на основе генов за пределами проекта TRANSLATE.

В ходе проекта мы хотели бы сосредоточиться на потенциальных барьерах на пути широкого применения точной медицины на основе генов при распространенном заболевании. К ним могут относиться:

• Проблемы, связанные с выбором вариантов, которые считаются клинически действенными, автоматизацией генетической интерпретации/трансляции и возможностью крупномасштабного внедрения прецизионной медицины
• Этические опасения пациентов, клиницистов и других технических специалистов в отношении применения и полезности генетической информации
• Валидность и ограничения текущих вычислительных конвейеров для вызова вариантов, включая вызов структурных вариантов и совокупных генетических инструментов.
• Проблемы, связанные с функциональной совместимостью ИТ-систем и баз данных на национальном уровне в Дании, в частности, как центральные базы данных могут быть связаны с конечными клиническими пользователями.
• Как внедрение генетического анализа влияет на принятие клинических решений и/или клиническую траекторию как качественно, так и количественно

Вторая колонка — это исследовательский проект на основе регистров, в котором мы будем использовать данные пациентов для развития прецизионной медицины на основе генов. В этой колонке мы рассмотрим, как создать всеобъемлющую исследовательскую инфраструктуру, а также ответим на конкретные исследовательские вопросы. Мы рассмотрим, как объединить и согласовать генетические данные с другими датскими источниками реестра. Мы будем использовать недавно созданные методологии, чтобы сосредоточиться на следующих областях исследований в отношении стратификации пациентов, клинических траекторий, развития осложнений и других клинически значимых исходов:

• Показатели полигенного риска
• Алгоритмы машинного обучения
• Сочетание полигенных и моногенных признаков
• Вариант без кодирования
• Структурные вариации, особенно делеции и дупликации экзонов, которые ранее были показаны как причина моногенного диабета.