Uppkomst av resistens i tarmmikrofloran under karbapenembehandlingar (ERIC)

Användningen av karbapenemer, mycket brett spektrum av antibiotika som sista utväg, blir allt vanligare på grund av den ökade förekomsten på sjukhus och i samhället av utökat spektrum β-laktamas (ESBL) som producerar gramnegativa baciller (GNB), inklusive CTX-M typ , som är resistenta mot alla andra β-laktamantibiotika. Samtidigt skapar det ett selektivt tryck mot uppkomsten av stammar som också är resistenta mot karbapenemer, vilket försätter patienter i en katastrofal situation med terapeutisk återvändsgränd. En bättre förståelse av mekanismerna för uppkomsten av BGN som är resistent mot karbapenemer är nödvändig för att optimera deras användning och vidta förebyggande åtgärder för att bevara deras effektivitet.

Hypoteser: Karbapenemer inducerar hos behandlade patienter uppkomsten av resistent GNB i tarmfloran och har en inverkan på kolonisationsresistens i tarmmikrobiotan.

Primärt mål: Att bestämma frekvensen av uppkomst av karbapenemresistent GNB i tarmfloran i slutet av en behandling med imipenem eller ertapenem.

Sekundära mål:

• Bedöm förekomsten av karbapenemresistent GNB i tarmfloran före behandling.
• Utvärdera förekomsten och/eller persistensen av karbapenemresistent GNB i tarmfloran på dag 3 av behandlingen och 15 dagar och 1 månad efter avslutad behandling.
• Bestäm de molekylära mekanismerna för resistens hos intressanta stammar.
• Beskriv mag-tarmkanalens kolonisering av icke-kommensala mikroorganismer före och efter behandling (påverkan på kolonisationsmotstånd).
• Beskriv egenskaperna hos patienter med uppkomst av resistens jämfört med patienter som inte gör det.
• Korrekt konservering av avföring av 10 patienter för metagenomisk och/eller metatranskriptomisk analys av förändringar i tarmfloran.

Primärt effektmått: Förekomst av karbapenemresistent GNB i avföringen i slutet av behandlingen hos patienter som inte gjorde det tidigare, efter odling på selektiva medier.

Sekundära slutpunkter:

• Förekomst av karbapenemresistent GNB i avföring före behandling, dag 3 och 15 dagar och 1 månad efter avslutad behandling, efter odling på selektivt medium.
• PCR och sekvensering av resistensgener från stammar av intresse.
• Kolonisering av matsmältningskanalen av icke-kommensala mikroorganismer före och efter behandling.
• Egenskaper hos patienter med eller utan uppkomst av resistens.