Pojawienie się oporności w mikroflorze jelitowej podczas leczenia karbapenemami (ERIC)

Stosowanie karbapenemów, antybiotyków ostatniej szansy o bardzo szerokim spektrum działania, staje się coraz bardziej powszechne ze względu na zwiększoną częstość występowania w szpitalach i społecznościach β-laktamaz o rozszerzonym spektrum działania (ESBL) wytwarzających pałeczki Gram-ujemne (GNB), w tym CTX-M , które są oporne na wszystkie inne antybiotyki β-laktamowe. Tymczasem stwarza selektywną presję na pojawienie się szczepów opornych również na karbapenemy, stawiając pacjentów w katastrofalnej sytuacji terapeutycznego ślepego zaułka. Lepsze poznanie mechanizmów powstawania BGN opornych na karbapenemy jest niezbędne do optymalizacji ich stosowania i podjęcia działań zapobiegawczych w celu zachowania ich skuteczności.

Hipotezy: Karbapenemy indukują u leczonych pacjentów pojawienie się opornych GNB we florze jelitowej i wpływają na odporność kolonizacyjną mikroflory jelitowej.

Cel główny: Określenie częstości pojawiania się GNB opornych na karbapenemy we florze jelitowej po zakończeniu leczenia imipenemem lub ertapenemem.

Cel(e) drugorzędny(e):

• Przed rozpoczęciem leczenia należy ocenić obecność GNB opornych na karbapenemy we florze jelitowej.
• Ocenić obecność i/lub utrzymywanie się GNB opornych na karbapenemy we florze jelitowej w 3. dniu leczenia oraz 15 dni i 1 miesiąc po zakończeniu leczenia.
• Określenie molekularnych mechanizmów oporności szczepów będących przedmiotem zainteresowania.
• Opisać kolonizację przewodu pokarmowego przez mikroorganizmy niekomensalne przed i po leczeniu (wpływ na odporność na kolonizację).
• Opisać charakterystykę pacjentów z pojawieniem się oporności w porównaniu z pacjentami, u których nie występuje.
• Właściwa konserwacja stolca 10 pacjentów do analizy metagenomicznej i/lub metatranskryptomicznej zmian we florze jelitowej.

Pierwszorzędowy punkt końcowy: Obecność GNB opornego na karbapenemy w kale pod koniec leczenia u pacjentów, u których wcześniej tego nie było, po posiewie na pożywkę selektywną.

Drugorzędowe punkty końcowe:

• Obecność GNB opornych na karbapenemy w kale przed leczeniem, w 3 i 15 dniu oraz 1 miesiąc po zakończeniu leczenia, po posiewie na pożywki selektywne.
• PCR i sekwencjonowanie genów oporności z szczepów będących przedmiotem zainteresowania.
• Kolonizacja przewodu pokarmowego przez mikroorganizmy niekomensalne przed i po leczeniu.
• Charakterystyka pacjentów z lub bez pojawienia się oporności.