Vznik rezistence ve střevní mikroflóře během léčby karbapenemem (ERIC)

Používání karbapenemů, velmi širokospektrých antibiotik poslední instance, se stává častějším kvůli zvýšené prevalenci v nemocnicích a komunitách rozšířeného spektra β-laktamáz (ESBL) produkujících gramnegativní bacily (GNB), včetně typu CTX-M , které jsou odolné vůči všem ostatním β-laktamovým antibiotikům. Mezitím vytváří selektivní tlak na vznik kmenů, které jsou také rezistentní vůči karbapenemům, čímž pacienty staví do katastrofální situace terapeutické slepé uličky. Lepší pochopení mechanismů vzniku BGN rezistentních vůči karbapenemům je nezbytné pro optimalizaci jejich použití a provedení preventivních opatření pro zachování jejich účinnosti.

Hypotézy: Karbapenemy indukují u léčených pacientů vznik rezistence GNB ve střevní flóře a mají vliv na kolonizační rezistenci střevní mikroflóry.

Primární cíl: Zjistit frekvenci výskytu GNB rezistentních na karbapenemy ve střevní flóře na konci léčby imipenemem nebo ertapenemem.

Sekundární cíle:

• Před léčbou vyhodnoťte přítomnost GNB rezistentního na karbapenem ve střevní flóře.
• Vyhodnoťte přítomnost a/nebo perzistenci GNB rezistentního na karbapenem ve střevní flóře 3. den léčby a 15 dnů a 1 měsíc po ukončení léčby.
• Určete molekulární mechanismy rezistence zájmových kmenů.
• Popište kolonizaci gastrointestinálního traktu nekomenzálními mikroorganismy před a po léčbě (vliv na rezistenci vůči kolonizaci).
• Popište charakteristiky pacientů se vznikem rezistence ve srovnání s pacienty, kteří ji nemají.
• Správná konzervace stolice 10 pacientů pro metagenomickou a/nebo metatranskriptomickou analýzu změn ve střevní flóře.

Primární cíl: Přítomnost GNB rezistentního na karbapenem ve stolici na konci léčby u pacientů, kteří tak neučinili dříve, po kultivaci na selektivních médiích.

Sekundární koncové body:

• Přítomnost GNB rezistentního na karbapenem ve stolici před léčbou, 3. a 15. den a 1 měsíc po ukončení léčby, po kultivaci na selektivním médiu.
• PCR a sekvenování genů rezistence ze sledovaných kmenů.
• Kolonizace trávicího traktu nekomenzálními mikroorganismy před a po léčbě.
• Charakteristika pacientů s nebo bez vzniku rezistence.