Samtidig upptäckt av kvantitativa somatiska förändringar med användning av den kvantitativa multiplex-Pcr-metoden för korta fluorescerande fragment (QMPSF) i tjocktarmscancer i steg II-III: en prospektiv studie (Code Barre)

Lymfkörtelpåverkan är fortfarande huvudkriteriet för postoperativ kemoterapi hos patienter med koloncancer (CC) utan fjärrmetastaser. Hittills är det prognostiska värdet av de somatiska kvantitativa molekylära förändringarna, såsom förlust eller vinst av genomisk region, inte fastställt i CC.

MÅL & METODER: Genom att använda enstegsscreeningsmetoden baserad på den kvantitativa multiplex-PCR av korta fluorescerande fragment (QMPSF), syftade vi till att bedöma den prognostiska rollen för den samtidiga detekteringen av huvudsakliga kvantitativa somatiska förändringar i steg II-III CC.

Patienter och metoder. Vi registrerade och samlade in alla baslinjekarakteristika för patienter som opererades för en stadium II-III CC med förvaringsfrysta vävnader. QMPSF baserades på en samtidig amplifiering av 9 utvalda genomiska målsekvenser från litteraturen: DCC (18q21); EGFR (7p12); P53 (17p13.1); BLK (8p23-p22); c-myc (8q24.12); APC (5q22,2); ERBB2 (17q12); STK6 (20q13,31); NR21 (14p11.1) och två kontroller: DCOHM (5q31.1); HMBS (11q23.3). Jämförelse av varje amplikonelektroferogram erhållet från tumör vs normal peritumoral vävnad tillät oss att identifiera genomisk region för vinst eller förlust. Den primära slutpunkten var det lokala och/eller avlägsna recidiv och sambandet mellan kliniska och enstaka eller kombinerade molekylära förändringar och recidiv utvärderades.