Détection simultanée d'altérations somatiques quantitatives à l'aide de la méthode Qantitative Multiplex Pcr of Short Fluorescent Fragments (QMPSF) dans le cancer du côlon de stade II-III : une étude prospective (Code Barre)

L'envahissement ganglionnaire reste le principal critère de chimiothérapie postopératoire chez les patients atteints d'un cancer du côlon (CC) sans métastase à distance. À ce jour, la valeur pronostique des altérations moléculaires quantitatives somatiques telles que la perte ou le gain de région génomique n'est pas établie dans le CC.

OBJECTIFS ET MÉTHODES : En utilisant la méthode de dépistage en une étape basée sur la PCR multiplex quantitative de fragments fluorescents courts (QMPSF), nous avons cherché à évaluer le rôle pronostique de la détection simultanée des principales altérations somatiques quantitatives dans les CC de stade II-III.

Patients et méthodes. Nous avons recruté et recueilli toutes les caractéristiques de base des patients opérés pour un CC de stade II-III avec des tissus congelés de stockage. Le QMPSF était basé sur une amplification simultanée de 9 séquences génomiques cibles sélectionnées dans la littérature : DCC (18q21) ; EGFR (7p12); P53 (17p13.1); BLK (8p23-p22); c-myc (8q24.12); APC (5q22.2) ; ERBB2 (17q12); STK6 (20q13.31); NR21 (14p11.1) et deux témoins : DCOHM (5q31.1) ; HMBS (11q23.3). La comparaison des électrophérogrammes de chaque amplicon obtenus à partir d'une tumeur par rapport à un tissu péritumoral normal nous a permis d'identifier la région génomique de gain ou de perte. Le critère principal était la récidive locale et/ou à distance et la relation entre les altérations cliniques et moléculaires simples ou combinées et la récidive a été évaluée.