Epidemiologin av hepatit E-virusinfektion i Israel och potentiella riskfaktorer

Hepatit E-virus är ett enkelsträngat positiv-sens RNA-virus med ett genom på cirka 7,2 kb. HEV-genomet är täckt vid 5'-änden följt av en liten otranslaterad region på 27 nukleotider och polyadenalerad vid 3'-änden föregås av en annan UTR på 65 nukleotider. HEV har tre öppna läsramar: ORF1, ORF2 och ORF3 som kodar för strukturella och icke-strukturella proteiner. ORF1 är den största, cirka 5 000 nt i längd, belägen i 5'-änden och kodar för viktiga proteiner för replikationsprocessen (metyltransferas, papainliknande cysteinproteas, helikas och RNA-beroende RNA-polymeras). En icke-kodande, hypervariabel region inom ORF1 uppvisar betydande genetisk mångfald; denna region verkar modulera effektiviteten av HEV-replikering. Noterbart är att skillnaderna i genomstorleken mellan olika HEV-stammar huvudsakligen är begränsade till denna region. ORF2 är belägen vid 3'-änden, kodar för strukturella kapsidproteiner med 660 aminosyror och innehåller tre potentiella glykosyleringsställen. ORF2-proteinet innehåller flera immunogena ställen och neutraliserande antikroppar är riktade mot det al., . Den essentiella regionen i proteinet för immunogenicitet är 452aa-617aa och de neutraliserande epitoperna har nyligen visat sig vara konformationella. ORF3 ligger mellan de andra två avläsningarna ramar in och kodar för ett litet fosfoprotein med 123 aminosyror. Dess exakta funktion har ännu inte fastställts, men flera funktioner har föreslagits. Det tros interagera med cellulärt mitogenaktiverat proteinkinasfosfatas och andra extracellulära kinaser, vilket främjar cellöverlevnad genom aktivering av intracellulära signalvägar. Dessutom verkar bindningen av det ORF3-kodade proteinet till värdspecifika proteiner påverka patogenesen av HEV-infektioner En schematisk ritning av HEV-genomet beskrivs i figur 1.