Epidemiologien til hepatitt E-virusinfeksjon i Israel og potensielle risikofaktorer

Hepatitt E-virus er et enkeltstrenget positiv-sense RNA-virus med genom på omtrent 7,2 kb i lengde. HEV-genomet er avdekket ved 5'-enden etterfulgt av en liten utranslatert region på 27 nukleotider og polyadenalert i 3'-enden foran en annen UTR på 65 nukleotider. HEV har tre åpne leserammer: ORF1, ORF2 og ORF3 som koder for strukturelle og ikke-strukturelle proteiner. ORF1 er den største, omtrent 5000 nt i lengde, plassert i 5'-enden og koder for viktige proteiner for replikasjonsprosessen (metyltransferase, papainlignende cysteinprotease, helicase og RNA-avhengig RNA-polymerase). En ikke-kodende, hypervariabel region i ORF1 viser betydelig genetisk mangfold; denne regionen ser ut til å modulere effektiviteten til HEV-replikering. Spesielt er forskjellene i genomstørrelsen blant forskjellige HEV-stammer hovedsakelig begrenset til denne regionen. ORF2 er lokalisert i 3'-enden, koder for strukturelle kapsidproteiner på 660 aminosyrer og inneholder tre potensielle glykosyleringsseter. ORF2-proteinet inneholder flere immunogene steder og nøytraliserende antistoffer er rettet mot det al., . Den essensielle regionen i proteinet for immunogenisitet er 452aa-617aa og de nøytraliserende epitopene har nylig vist seg å være konformasjonelle. ORF3 er lokalisert mellom de to andre avlesningene rammer inn og koder for et lite fosfoprotein på 123 aminosyrer. Den nøyaktige funksjonen er ennå ikke bestemt, men flere funksjoner har blitt foreslått. Det antas å samhandle med cellulær mitogenaktivert proteinkinasefosfatase og andre ekstracellulære kinaser, og fremme celleoverlevelse gjennom aktivering av intracellulære signalveier. Dessuten ser det ut til at bindingen av det ORF3-kodede proteinet til vertsspesifikke proteiner påvirker patogenesen av HEV-infeksjoner. En skjematisk tegning av HEV-genomet er beskrevet i figur 1.