Prospektiv definition av metastatiska pankreatiska duktala adenokarcinomsubtyper genom omfattande genomisk analys (PanGen)

Detta är en prospektiv icke-randomiserad studie av patienter med metastaserande pankreas duktalt adenokarcinom (PDAC) som genomgår första linjens systemisk kemoterapi med antingen folinsyra, fluorouracil, irinotekan och oxaliplatin (FOLFIRINOX) eller gemcitabin och nab-paklitaxel (GP)-regimer. , där tumörprover, baslinje- och serieblodprover och standardiserade kliniska och radiologiska bedömningar kommer att erhållas. Patienter som planeras för behandling med ett eller flera prövningsmedel inom en klinisk prövning med antingen FOLFIRINOX eller GP som kemoterapiryggrad kommer också att vara berättigade, så länge andra behörighetskriterier för studien är uppfyllda.

Totalt kommer 190 patienter att rekryteras under studieperioden. Patienterna kommer att genomgå ny tumörbiopsi vid studiens baslinje för omfattande molekylär karakterisering (biopsikohort). Patienter vars biopsi inte kunde genomgå hela genomet och transkriptomsekvensering (t. på grund av otillräckligt tumörinnehåll) men uppfyller alla andra behörighetskriterier kommer att omfatta arkivkohorten, där begränsade genomiska analyser kommer att utföras på arkivtumörprover. Patienter med en radiologisk diagnos av metastaserande PDAC utan en bekräftande histologisk diagnos kan vara berättigade; i dessa fall kommer tumörbiopsi för att fastställa en patologisk diagnos att ges första prioritet. Återstående tumörprover kommer att användas för forskningsändamål först efter att diagnosen PDAC har fastställts. I de sällsynta fall (<5%) där den histologiska diagnosen är en annan än PDAC, kommer patienter att censureras från studien och allt tumörmaterial lagras för framtida klinisk användning utanför denna studie.

Alla patienter kommer att genomgå seriell insamling av plasma- och serumprover vid baslinjen och var 4:e vecka fram till slutet av studien. Dessa kommer att användas för explorativa biomarköranalyser. Serumcancerantigen 19-9 (CA19-9), även känd som kolhydratantigen 19-9, kommer också att mätas vid baslinjen och var 4:e vecka därefter som en del av rutinmässig standardvård fram till studiens slut. Dessutom kommer ett helblodsprov att samlas in vid baslinjen för att studera könscellers DNA-varianter. CT bröst, buk och bäcken kommer att utföras vid baslinjen och var 8:e vecka, med radiologiskt svar på behandlingen bedömd med RECIST 1.1.

Patienter måste ha minst en tumörskada som är mottaglig för biopsi från vilken minst 3 tumörkärnor kan erhållas på ett säkert sätt under CT- eller ultraljudsvägledning, enligt bedömning av en personalinterventionsradiolog. Maximalt 5 tumörkärnor kommer att tas från varje patient vid baslinjen före behandling med FOLFIRINOX eller GP. Vid tidpunkten för den radiologiska sjukdomsprogressionen kommer en valfri andra tumörbiopsi att samlas in från patienter i biopsikohorten för att studera förändringar i tumörernas molekylära egenskaper under selektionstrycket från första linjens systemisk terapi. Denna tumörbiopsi kommer att utföras med exakt samma procedurer som beskrivs för baslinjebiopsi. Tumörbiopsier kommer att samordnas med British Columbia (BC) Cancer Personalized Oncogenomics (POG)-programmet och data och/eller prover som delas mellan de två studierna för att undvika omprov från patienten för både POG och PanGen, om patienten deltar i båda studierna. Molekylära analyser kommer att utföras av BC Cancer. Beroende på mängden tumörmaterial som erhålls från varje patient kommer molekylära analyser att prioriteras för att först fastställa eller bekräfta histologisk diagnos och sedan användas för helgenomsekvensering, heltranskriptomsekvensering, proteomik och patienthärledda modeller.

Den primära slutpunkten för PanGen är genereringen av molekylära och fenotypiska signaturer av enskilda tumörer inom en kliniskt relevant tidsram. Signaturdata kommer att korreleras med kliniskt utfall. En av de viktigaste styrkorna med denna kohortmetod kommer att vara den rigorösa annoteringen av PDAC-patienters kliniska egenskaper och resultat för alla behandlingar (första linjen och andra) kopplade till den molekylära profilen. Utredarna har potential att vara smidiga när mer data genereras, fler hypoteser kan utforskas och andra finjusteras eller elimineras.