Metastaattisten haiman kanavan adenokarsinooman alatyyppien määrittäminen kattavalla genomisella analyysillä (PanGen)

Tämä on prospektiivinen ei-satunnaistettu tutkimus potilaista, joilla on metastaattinen haiman duktaalinen adenokarsinooma (PDAC), jotka saavat ensilinjan systeemistä solunsalpaajahoitoa joko foliinihapolla, fluorourasiililla, irinotekaanilla ja oksaliplatiinilla (FOLFIRINOX) tai gemsitabiinilla ja nab-paklitakselipohjaisella hoito-ohjelmalla (GP). , jossa otetaan kasvainnäytteet, perus- ja sarjaverinäytteet sekä standardoidut kliiniset ja radiologiset arvioinnit. Potilaat, joita on tarkoitus hoitaa kliinisessä tutkimuksessa tutkittavalla aineella (aineilla), joissa käytetään joko FOLFIRINOXia tai GP:tä kemoterapian runkoverkona, ovat myös kelvollisia, mikäli muut tutkimuksen kelpoisuuskriteerit täyttyvät.

Tutkimusjakson aikana rekrytoidaan yhteensä 190 potilasta. Potilaille tehdään uusi kasvainbiopsia tutkimuksen lähtötilanteessa kattavaa molekyylien karakterisointia varten (biopsiakohortti). Potilaat, joiden biopsia ei kyennyt läpikäymään koko genomin ja transkription sekvensointia (esim. riittämättömän kasvainsisällön vuoksi), mutta täyttävät kaikki muut kelpoisuusehdot, muodostavat arkiston kohortin, jossa suoritetaan rajoitettuja genomianalyysejä arkistoiduille kasvainnäytteille. Potilaat, joilla on metastaattisen PDAC:n radiologinen diagnoosi ilman vahvistavaa histologista diagnoosia, voivat olla kelvollisia; näissä tapauksissa tuumoribiopsia patologisen diagnoosin määrittämiseksi on etusijalla. Jäljellä olevia kasvainnäytteitä käytetään tutkimustarkoituksiin vasta, kun PDAC-diagnoosi on vahvistettu. Siinä harvinaisessa tapauksessa (<5 %), jossa histologinen diagnoosi on muu kuin PDAC, potilaat sensuroidaan tutkimuksesta ja kaikki kasvainmateriaalit tallennetaan tulevaa kliinistä käyttöä varten tämän tutkimuksen ulkopuolella.

Kaikille potilaille suoritetaan plasma- ja seeruminäytteiden sarjakeräys lähtötilanteessa ja joka 4. viikko tutkimuksen loppuun asti. Näitä käytetään tutkiviin biomarkkerianalyyseihin. Seerumin syöpäantigeeni 19-9 (CA19-9), joka tunnetaan myös nimellä hiilihydraattiantigeeni 19-9, mitataan myös lähtötilanteessa ja sen jälkeen 4 viikon välein osana rutiininomaista hoitoa tutkimuksen loppuun asti. Lisäksi kokoverinäyte kerätään lähtötilanteessa ituradan DNA-varianttien tutkimiseksi. Rintakehän, vatsan ja lantion CT tehdään lähtötilanteessa ja 8 viikon välein, ja radiologista hoitovastetta arvioidaan käyttämällä RECIST 1.1:tä.

Potilaalla on oltava vähintään yksi kasvainleesio, josta voidaan ottaa biopsia ja josta voidaan turvallisesti saada vähintään 3 kasvainydintä TT- tai ultraääniohjauksessa henkilöstön interventioradiologin arvioiden mukaan. Jokaiselta potilaalta otetaan lähtötilanteessa enintään 5 kasvainydintä ennen FOLFIRINOX- tai GP-hoitoa. Radiologisen taudin etenemisen aikana biopsiakohortin potilailta kerätään valinnainen toinen kasvainbiopsia, jotta voidaan tutkia muutoksia kasvainten molekyyliominaisuuksissa ensimmäisen linjan systeemisen hoidon valintapaineen alaisena. Tämä kasvainbiopsia suoritetaan käyttäen täsmälleen samoja menetelmiä, jotka on kuvattu perustason biopsiassa. Tuumoribiopsiat koordinoidaan British Columbia (BC) Cancer Personalized Oncogenomics (POG) -ohjelman kanssa ja tiedot ja/tai näytteet jaetaan näiden kahden tutkimuksen välillä, jotta vältetään uudelleennäytteenotto sekä POG- että PanGen-tutkimuksessa, jos potilas osallistuu molemmat opinnot. Molekyylianalyysit suorittaa BC Cancer. Riippuen kustakin potilaasta saadun kasvainmateriaalin määrästä, molekyylianalyysit priorisoidaan ensin histologisen diagnoosin määrittämiseksi tai vahvistamiseksi ja sitten niitä käytetään koko genomin sekvensointiin, koko transkription sekvensointiin, proteomiikkaan ja potilasperäisiin malleihin.

PanGenin ensisijainen päätetapahtuma on yksittäisten kasvainten molekulaaristen ja fenotyyppisten allekirjoitusten luominen kliinisesti merkityksellisenä ajanjaksona. Allekirjoitustiedot korreloidaan kliinisen tuloksen kanssa. Yksi tämän kohorttilähestymistavan tärkeimmistä vahvuuksista on PDAC-potilaiden kliinisten ominaisuuksien ja tulosten tarkka merkitseminen kaikkiin molekyyliprofiiliin liittyviin hoitoihin (ensimmäinen linja ja muut). Tutkijoilla on potentiaalia olla ketterä, kun enemmän tietoa syntyy, enemmän hypoteeseja voidaan tutkia ja muita hienosäätää tai eliminoida.