Definizione prospettica dei sottotipi di adenocarcinoma duttale pancreatico metastatico mediante un'analisi genomica completa (PanGen)

Questo è uno studio prospettico non randomizzato su pazienti con adenocarcinoma duttale pancreatico metastatico (PDAC) sottoposti a chemioterapia sistemica di prima linea con regimi a base di acido folinico, fluorouracile, irinotecan e oxaliplatino (FOLFIRINOX) o gemcitabina e nab-paclitaxel (GP) , dove saranno ottenuti campioni tumorali, campioni di sangue al basale e seriali e valutazioni cliniche e radiologiche standardizzate. Saranno ammissibili anche i pazienti pianificati per il trattamento con uno o più agenti sperimentali all'interno di uno studio clinico che utilizza FOLFIRINOX o GP come spina dorsale della chemioterapia, a condizione che siano soddisfatti altri criteri di ammissibilità per lo studio.

Un totale di 190 pazienti saranno reclutati durante il periodo di studio. I pazienti saranno sottoposti a biopsia del tumore fresco al basale dello studio per una caratterizzazione molecolare completa (coorte di biopsia). Pazienti la cui biopsia non è stata in grado di sottoporsi al sequenziamento dell'intero genoma e del trascrittoma (ad es. a causa di contenuto tumorale insufficiente) ma soddisfa tutti gli altri criteri di ammissibilità comprenderà la coorte di archivio, dove verranno eseguite analisi genomiche limitate su campioni di tumore archiviati. I pazienti con diagnosi radiologica di PDAC metastatico senza una diagnosi istologica di conferma possono essere ammissibili; in questi casi, sarà data la priorità alla biopsia del tumore per stabilire una diagnosi patologica. I restanti campioni di tumore verranno utilizzati per scopi di ricerca solo dopo che la diagnosi di PDAC è stata stabilita. Nel raro evento (<5%) in cui la diagnosi istologica è diversa da PDAC, i pazienti verranno censurati dallo studio e tutti i materiali tumorali verranno conservati per uso clinico futuro al di fuori di questo studio.

Tutti i pazienti saranno sottoposti a raccolta seriale di campioni di plasma e siero al basale e ogni 4 settimane fino alla fine dello studio. Questi saranno utilizzati per analisi esplorative di biomarcatori. Anche l'antigene del cancro sierico 19-9 (CA19-9), noto anche come antigene dei carboidrati 19-9, sarà misurato al basale e successivamente ogni 4 settimane come parte dello standard di cura di routine fino alla fine dello studio. Inoltre, verrà raccolto un campione di sangue intero al basale per studiare le varianti del DNA germinale. La TC del torace, dell'addome e del bacino verrà eseguita al basale e ogni 8 settimane, con risposta radiologica alla terapia valutata utilizzando RECIST 1.1.

I pazienti devono avere almeno una lesione tumorale suscettibile di biopsia da cui un minimo di 3 nuclei tumorali possono essere ottenuti in modo sicuro sotto guida TC o ecografica, come valutato da un radiologo interventista del personale. Verranno prelevati un massimo di 5 nuclei tumorali da ciascun paziente al basale prima del trattamento con FOLFIRINOX o GP. Al momento della progressione radiologica della malattia, verrà prelevata una seconda biopsia tumorale facoltativa dai pazienti nella coorte di biopsia per studiare i cambiamenti nelle caratteristiche molecolari dei tumori sotto la pressione selettiva della terapia sistemica di prima linea. Questa biopsia del tumore verrà eseguita utilizzando esattamente le stesse procedure descritte per la biopsia di base. Le biopsie tumorali saranno coordinate con il programma Oncogenomica personalizzata del cancro (POG) della Columbia Britannica (BC) e i dati e/o i campioni saranno condivisi tra i due studi per evitare di ricampionare il paziente sia per POG che per PanGen, se il paziente sta partecipando a entrambi gli studi. Le analisi molecolari saranno eseguite da BC Cancer. A seconda della quantità di materiale tumorale ottenuto da ciascun paziente, verrà data la priorità alle analisi molecolari per stabilire o confermare prima la diagnosi istologica e quindi utilizzare per il sequenziamento dell'intero genoma, il sequenziamento dell'intero trascrittoma, la proteomica e i modelli derivati ​​dal paziente.

L'endpoint primario di PanGen è la generazione di firme molecolari e fenotipiche di singoli tumori in un lasso di tempo clinicamente rilevante. I dati della firma saranno correlati con l'esito clinico. Uno dei principali punti di forza di questo approccio di coorte sarà la rigorosa annotazione delle caratteristiche cliniche e dei risultati dei pazienti PDAC a tutti i trattamenti (di prima linea e altri) legati al profilo molecolare. Gli investigatori hanno il potenziale per essere agili man mano che vengono generati più dati, più ipotesi possono essere esplorate e altre perfezionate o eliminate.