Проспективное определение подтипов метастатической протоковой аденокарциномы поджелудочной железы с помощью комплексного геномного анализа (PanGen)

Это проспективное нерандомизированное исследование пациентов с метастатической аденокарциномой протоков поджелудочной железы (PDAC), получающих системную химиотерапию первой линии с применением либо фолиевой кислоты, фторурацила, иринотекана и оксалиплатина (FOLFIRINOX), либо схем на основе гемцитабина и наб-паклитаксела (GP). , где будут получены образцы опухолей, базовые и серийные образцы крови, а также стандартизированные клинические и радиологические оценки. Пациенты, которым запланировано лечение исследуемым(и) агентом(ами) в рамках клинического исследования с использованием либо FOLFIRINOX, либо GP в качестве основы химиотерапии, также будут иметь право на участие, если будут соблюдены другие критерии приемлемости для исследования.

Всего за период исследования будет набрано 190 пациентов. Пациентам будет проведена биопсия свежей опухоли на исходном уровне исследования для всесторонней молекулярной характеристики (когорта биопсии). Пациенты, у которых не удалось провести биопсию всего генома и секвенирование транскриптома (например, из-за недостаточного содержания опухоли), но отвечающие всем остальным критериям приемлемости, будут включать архивную когорту, в которой будут выполняться ограниченные геномные анализы архивных образцов опухолей. Пациенты с рентгенологическим диагнозом метастатического PDAC без подтверждающего гистологического диагноза могут иметь право на участие; в этих случаях биопсия опухоли для установления патологического диагноза будет иметь первоочередное значение. Оставшиеся образцы опухоли будут использоваться в исследовательских целях только после установления диагноза PDAC. В редком случае (<5%), когда гистологический диагноз отличается от PDAC, пациенты будут исключены из исследования, а все опухолевые материалы сохранены для будущего клинического использования за пределами этого исследования.

Все пациенты будут подвергаться серийному сбору образцов плазмы и сыворотки в начале исследования и каждые 4 недели до конца исследования. Они будут использоваться для исследовательского анализа биомаркеров. Сывороточный раковый антиген 19-9 (CA19-9), также известный как углеводный антиген 19-9, также будет измеряться в начале исследования и каждые 4 недели после этого в рамках стандартного лечения до конца исследования. Кроме того, на исходном уровне будет взят образец цельной крови для изучения вариантов ДНК зародышевой линии. КТ грудной клетки, брюшной полости и таза будет выполняться на исходном уровне и каждые 8 ​​недель, при этом радиологический ответ на терапию оценивается с помощью RECIST 1.1.

Пациенты должны иметь по крайней мере одно опухолевое поражение, поддающееся биопсии, из которого можно безопасно получить как минимум 3 ядра опухоли под контролем КТ или УЗИ, по оценке штатного интервенционного рентгенолога. На исходном уровне у каждого пациента будет взято не более 5 ядер опухоли до начала лечения с помощью FOLFIRINOX или GP. Во время рентгенологического прогрессирования заболевания у пациентов в когорте биопсии будет взята необязательная вторая биопсия опухоли для изучения изменений в молекулярных характеристиках опухолей под давлением выбора системной терапии первой линии. Эта биопсия опухоли будет выполняться с использованием точно таких же процедур, которые описаны для исходной биопсии. Биопсия опухоли будет согласовываться с программой персонализированной онкогеномики рака (POG) Британской Колумбии (BC), а данные и/или образцы будут совместно использоваться двумя исследованиями, чтобы избежать повторного отбора проб у пациента как для POG, так и для PanGen, если пациент участвует в исследовании. оба исследования. Молекулярные анализы будут выполняться компанией BC Cancer. В зависимости от количества опухолевого материала, полученного от каждого пациента, молекулярные анализы будут иметь приоритет, чтобы сначала установить или подтвердить гистологический диагноз, а затем использовать для секвенирования всего генома, секвенирования всего транскриптома, протеомики и моделей, полученных от пациентов.

Первичной конечной точкой PanGen является получение молекулярных и фенотипических признаков отдельных опухолей в клинически значимых временных рамках. Сигнатурные данные будут коррелировать с клиническим исходом. Одной из ключевых сильных сторон этого когортного подхода будет строгая аннотация клинических особенностей пациентов с PDAC и результатов всех видов лечения (первой линии и других), связанных с молекулярным профилем. У исследователей есть потенциал быть шустрыми по мере того, как генерируется больше данных, может быть изучено больше гипотез, а другие уточнены или исключены.