Prospektiv definering av metastatiske duktale adenokarsinom-subtyper i bukspyttkjertelen ved hjelp av omfattende genomisk analyse (PanGen)

Dette er en prospektiv ikke-randomisert studie av pasienter med metastatisk pankreas duktalt adenokarsinom (PDAC) som gjennomgår førstelinjesystemisk kjemoterapi med enten folinsyre, fluorouracil, irinotekan og oksaliplatin (FOLFIRINOX) eller gemcitabin og nab-paclitaxel (GP)-regimer. , hvor tumorprøver, baseline- og serieblodprøver, og standardiserte kliniske og radiologiske vurderinger vil bli innhentet. Pasienter som planlegges for behandling med et undersøkelsesmiddel i en klinisk studie med enten FOLFIRINOX eller GP som kjemoterapiryggrad vil også være kvalifisert, så lenge andre kvalifikasjonskriterier for studien er oppfylt.

Totalt 190 pasienter vil bli rekruttert i løpet av studieperioden. Pasienter vil gjennomgå ny tumorbiopsi ved studiens baseline for omfattende molekylær karakterisering (biopsikohort). Pasienter hvis biopsi ikke var i stand til å gjennomgå hele genomet og transkriptomsekvensering (f. på grunn av utilstrekkelig tumorinnhold), men oppfyller alle andre kvalifikasjonskriterier vil omfatte arkivkohorten, hvor begrensede genomiske analyser vil bli utført på arkivsvulstprøver. Pasienter med en radiologisk diagnose av metastatisk PDAC uten bekreftende histologisk diagnose kan være kvalifisert; i disse tilfellene vil tumorbiopsi for å etablere en patologisk diagnose gis første prioritet. Resterende svulstprøver vil bli brukt til forskningsformål først etter at diagnosen PDAC er etablert. I de sjeldne tilfellene (<5%) hvor den histologiske diagnosen er en annen enn PDAC, vil pasienter bli sensurert fra studien og alt tumormateriale lagret for fremtidig klinisk bruk utenfor denne studien.

Alle pasienter vil gjennomgå seriell innsamling av plasma- og serumprøver ved baseline og hver 4. uke frem til slutten av studien. Disse skal brukes til utforskende biomarkøranalyser. Serumkreftantigen 19-9 (CA19-9), også kjent som karbohydratantigen 19-9, vil også bli målt ved baseline og hver 4. uke deretter som en del av rutinemessig standardbehandling frem til studiens slutt. I tillegg vil en helblodsprøve bli tatt ved baseline for å studere kimlinje-DNA-varianter. CT bryst, mage og bekken vil bli utført ved baseline og hver 8. uke, med radiologisk respons på terapi vurdert ved bruk av RECIST 1.1.

Pasienter må ha minst én tumorlesjon som kan biopsi, hvorfra minimum 3 tumorkjerner trygt kan oppnås under CT- eller ultralydveiledning, vurdert av en intervensjonsradiolog. Maksimalt 5 tumorkjerner vil bli tatt fra hver pasient ved baseline før behandling med FOLFIRINOX eller fastlege. På tidspunktet for radiologisk sykdomsprogresjon, vil en valgfri andre tumorbiopsi bli samlet inn fra pasienter i biopsikohorten for å studere endringer i de molekylære egenskapene til svulster under seleksjonstrykket av førstelinjesystemisk terapi. Denne tumorbiopsien vil bli utført ved å bruke nøyaktig de samme prosedyrene som er beskrevet for baselinebiopsien. Tumorbiopsier vil bli koordinert med British Columbia (BC) Cancer Personalized Oncogenomics (POG)-programmet og dataene og/eller prøvene som deles mellom de to studiene for å unngå ny prøvetaking av pasienten for både POG og PanGen, hvis pasienten deltar i begge studiene. Molekylære analyser vil bli utført av BC Cancer. Avhengig av mengden tumormateriale som er hentet fra hver pasient, vil molekylære analyser bli prioritert for først å etablere eller bekrefte histologisk diagnose og deretter bruke for helgenomsekvensering, heltranskriptomsekvensering, proteomikk og pasientavledede modeller.

Det primære endepunktet til PanGen er generering av molekylære og fenotypiske signaturer av individuelle svulster i en klinisk relevant tidsramme. Signaturdataene vil være korrelert med klinisk utfall. En av hovedstyrkene til denne kohorttilnærmingen vil være den strenge annoteringen av PDAC-pasienters kliniske egenskaper og utfall for alle behandlinger (førstelinje og andre) knyttet til den molekylære profilen. Etterforskerne har potensiale til å være kvikke etter hvert som mer data genereres, flere hypoteser kan utforskes og andre finjusteres eller elimineres.