Definición prospectiva de subtipos de adenocarcinoma ductal pancreático metastásico mediante análisis genómico integral (PanGen)

Este es un estudio prospectivo no aleatorizado de pacientes con adenocarcinoma ductal pancreático metastásico (PDAC) sometidos a quimioterapia sistémica de primera línea con regímenes basados ​​en ácido folínico, fluorouracilo, irinotecán y oxaliplatino (FOLFIRINOX) o gemcitabina y nab-paclitaxel (GP). , donde se obtendrán muestras tumorales, muestras de sangre basales y seriadas, y evaluaciones clínicas y radiológicas estandarizadas. Los pacientes cuyo tratamiento esté planificado con uno o más agentes en investigación dentro de un ensayo clínico que utilice FOLFIRINOX o GP como base de la quimioterapia también serán elegibles, siempre que se cumplan otros criterios de elegibilidad para el estudio.

Se reclutará un total de 190 pacientes durante el período de estudio. Los pacientes se someterán a una biopsia de tumor fresco al inicio del estudio para una caracterización molecular integral (cohorte de biopsia). Pacientes cuya biopsia no pudo someterse a la secuenciación del genoma completo y del transcriptoma (p. debido a un contenido tumoral insuficiente), pero cumplen con todos los demás criterios de elegibilidad, formarán parte de la cohorte de archivo, donde se realizarán análisis genómicos limitados en muestras de tumor de archivo. Los pacientes con un diagnóstico radiológico de PDAC metastásico sin un diagnóstico histológico confirmatorio pueden ser elegibles; en estos casos se dará prioridad a la biopsia del tumor para establecer un diagnóstico anatomopatológico. Las muestras tumorales restantes se utilizarán con fines de investigación solo después de que se haya establecido el diagnóstico de PDAC. En el caso poco frecuente (<5 %) en el que el diagnóstico histológico sea distinto de PDAC, los pacientes serán excluidos del estudio y todos los materiales tumorales se almacenarán para uso clínico futuro fuera de este estudio.

Todos los pacientes se someterán a una recolección en serie de muestras de plasma y suero al inicio del estudio y cada 4 semanas hasta el final del estudio. Estos se utilizarán para análisis exploratorios de biomarcadores. El antígeno sérico de cáncer 19-9 (CA19-9), también conocido como antígeno de carbohidrato 19-9, también se medirá al inicio y cada 4 semanas a partir de entonces como parte de la atención estándar de rutina hasta el final del estudio. Además, se recolectará una muestra de sangre total al inicio del estudio para estudiar las variantes de ADN de la línea germinal. Se realizará una TC de tórax, abdomen y pelvis al inicio del estudio y cada 8 semanas, y la respuesta radiológica al tratamiento se evaluará mediante RECIST 1.1.

Los pacientes deben tener al menos una lesión tumoral susceptible de biopsia a partir de la cual se puedan obtener con seguridad un mínimo de 3 núcleos tumorales bajo guía por TC o ecografía, según la evaluación de un radiólogo intervencionista del personal. Se tomará un máximo de 5 núcleos tumorales de cada paciente al inicio antes del tratamiento con FOLFIRINOX o GP. En el momento de la progresión radiológica de la enfermedad, se obtendrá una segunda biopsia tumoral opcional de los pacientes de la cohorte de biopsias para estudiar los cambios en las características moleculares de los tumores bajo la presión de selección de la terapia sistémica de primera línea. Esta biopsia del tumor se realizará utilizando exactamente los mismos procedimientos descritos para la biopsia de referencia. Las biopsias tumorales se coordinarán con el programa Oncogenómica personalizada del cáncer (POG) de la Columbia Británica (BC) y los datos o las muestras se compartirán entre los dos estudios para evitar volver a tomar muestras del paciente tanto para POG como para PanGen, si el paciente participa en ambos estudios. Los análisis moleculares serán realizados por BC Cancer. Dependiendo de la cantidad de material tumoral obtenido de cada paciente, se priorizarán los análisis moleculares para establecer o confirmar primero el diagnóstico histológico y luego utilizarlos para la secuenciación del genoma completo, la secuenciación del transcriptoma completo, la proteómica y los modelos derivados del paciente.

El criterio principal de valoración de PanGen es la generación de firmas moleculares y fenotípicas de tumores individuales en un período de tiempo clínicamente relevante. Los datos de la firma se correlacionarán con el resultado clínico. Una de las fortalezas clave de este enfoque de cohorte será la anotación rigurosa de las características clínicas de los pacientes con PDAC y los resultados de todos los tratamientos (primera línea y otros) vinculados al perfil molecular. Los investigadores tienen el potencial de ser ágiles a medida que se generan más datos, se pueden explorar más hipótesis y otras se pueden ajustar o eliminar.