Prospektiv definition af metastatisk pancreas duktal adenokarcinom undertyper ved hjælp af omfattende genomisk analyse (PanGen)

Dette er en prospektiv ikke-randomiseret undersøgelse af patienter med metastatisk pancreas duktalt adenokarcinom (PDAC), der gennemgår førstelinjes systemisk kemoterapi med enten folinsyre, fluorouracil, irinotecan og oxaliplatin (FOLFIRINOX) eller gemcitabin og nab-paclitaxel (GP)-regimer. , hvor tumorprøver, baseline- og serielle blodprøver og standardiserede kliniske og radiologiske vurderinger vil blive indhentet. Patienter, der er planlagt til behandling med et eller flere forsøgsmidler inden for et klinisk forsøg med enten FOLFIRINOX eller GP som kemoterapirygraden, vil også være kvalificerede, så længe andre berettigelseskriterier for undersøgelsen er opfyldt.

I alt 190 patienter vil blive rekrutteret i løbet af undersøgelsesperioden. Patienterne vil gennemgå frisk tumorbiopsi ved undersøgelsens baseline for omfattende molekylær karakterisering (biopsikohorte). Patienter, hvis biopsi ikke var i stand til at gennemgå hele genomet og transkriptomsekventering (f. på grund af utilstrækkeligt tumorindhold), men opfylder alle andre berettigelseskriterier vil omfatte arkivkohorten, hvor begrænsede genomiske analyser vil blive udført på arkivtumorprøver. Patienter med en radiologisk diagnose af metastatisk PDAC uden en bekræftende histologisk diagnose kan være kvalificerede; i disse tilfælde vil tumorbiopsi til fastsættelse af en patologisk diagnose have første prioritet. Resterende tumorprøver vil kun blive brugt til forskningsformål, efter at diagnosen PDAC er blevet etableret. I de sjældne tilfælde (<5%), hvor den histologiske diagnose er en anden end PDAC, vil patienter blive censureret fra undersøgelsen, og alt tumormateriale opbevares til fremtidig klinisk brug uden for denne undersøgelse.

Alle patienter vil gennemgå serieopsamling af plasma- og serumprøver ved baseline og hver 4. uge indtil afslutningen af ​​undersøgelsen. Disse vil blive brugt til eksplorative biomarkøranalyser. Serumcancerantigen 19-9 (CA19-9), også kendt som kulhydratantigen 19-9, vil også blive målt ved baseline og hver 4. uge derefter som en del af rutinemæssig standardbehandling indtil afslutningen af ​​undersøgelsen. Derudover vil en fuldblodsprøve blive indsamlet ved baseline for at studere kimlinje-DNA-varianter. CT bryst, abdomen og bækken vil blive udført ved baseline og hver 8. uge, med radiologisk respons på behandlingen vurderet ved hjælp af RECIST 1.1.

Patienter skal have mindst én tumorlæsion, der er modtagelig for biopsi, hvorfra mindst 3 tumorkerner sikkert kan opnås under CT- eller ultralydsvejledning, som vurderet af en interventionsradiolog. Der tages maksimalt 5 tumorkerner fra hver patient ved baseline før behandling med FOLFIRINOX eller GP. På tidspunktet for radiologisk sygdomsprogression vil en valgfri anden tumorbiopsi blive indsamlet fra patienter i biopsikohorten for at studere ændringer i tumorernes molekylære karakteristika under selektionstrykket af førstelinjes systemisk terapi. Denne tumorbiopsi vil blive udført ved hjælp af nøjagtig de samme procedurer, der er beskrevet for basislinjebiopsien. Tumorbiopsier vil blive koordineret med British Columbia (BC) Cancer Personalized Oncogenomics (POG)-programmet og de data og/eller prøver, der deles mellem de to undersøgelser for at undgå genudtagning af patienten for både POG og PanGen, hvis patienten deltager i begge studier. Molekylære analyser vil blive udført af BC Cancer. Afhængigt af mængden af ​​tumormateriale opnået fra hver patient, vil molekylære analyser blive prioriteret for først at etablere eller bekræfte histologisk diagnose og derefter bruge til helgenom-sekventering, hel-transkriptom-sekventering, proteomik og patient-afledte modeller.

Det primære endepunkt for PanGen er generering af molekylære og fænotypiske signaturer af individuelle tumorer i en klinisk relevant tidsramme. Signaturdataene vil være korreleret med det kliniske resultat. En af de vigtigste styrker ved denne kohortetilgang vil være den strenge annotering af PDAC-patienters kliniske træk og resultater for alle behandlinger (førstelinje og andre) knyttet til den molekylære profil. Efterforskerne har potentialet til at være kvikke, efterhånden som flere data genereres, flere hypoteser kan udforskes og andre finjusteres eller elimineres.