Définition prospective des sous-types d'adénocarcinome canalaire pancréatique métastatique par une analyse génomique complète (PanGen)

Il s'agit d'une étude prospective non randomisée portant sur des patients atteints d'un adénocarcinome canalaire pancréatique métastatique (PDAC) subissant une chimiothérapie systémique de première intention avec soit de l'acide folinique, du fluorouracile, de l'irinotécan et de l'oxaliplatine (FOLFIRINOX) soit des schémas thérapeutiques à base de gemcitabine et de nab-paclitaxel (GP). , où des échantillons de tumeurs, des échantillons de sang de base et en série, et des évaluations cliniques et radiologiques standardisées seront obtenus. Les patients prévus pour un traitement avec un ou des agents expérimentaux dans le cadre d'un essai clinique utilisant FOLFIRINOX ou un médecin généraliste comme colonne vertébrale de la chimiothérapie seront également éligibles, à condition que les autres critères d'éligibilité pour l'étude soient remplis.

Au total, 190 patients seront recrutés au cours de la période d'étude. Les patients subiront une biopsie tumorale fraîche au départ de l'étude pour une caractérisation moléculaire complète (cohorte de biopsie). Les patients dont la biopsie n'a pas pu subir le séquençage du génome entier et du transcriptome (par ex. en raison d'un contenu tumoral insuffisant) mais remplissant tous les autres critères d'éligibilité comprendra la cohorte d'archives, où des analyses génomiques limitées seront effectuées sur des échantillons de tumeurs d'archives. Les patients avec un diagnostic radiologique de PDAC métastatique sans diagnostic histologique de confirmation peuvent être éligibles ; dans ces cas, la biopsie tumorale pour établir un diagnostic pathologique sera prioritaire. Les échantillons de tumeurs restants ne seront utilisés à des fins de recherche qu'après que le diagnostic de PDAC aura été établi. Dans les rares cas (< 5 %) où le diagnostic histologique est autre que PDAC, les patients seront censurés de l'étude et tous les matériaux tumoraux seront stockés pour une utilisation clinique future en dehors de cette étude.

Tous les patients subiront une collecte en série d'échantillons de plasma et de sérum au départ et toutes les 4 semaines jusqu'à la fin de l'étude. Ceux-ci seront utilisés pour des analyses exploratoires de biomarqueurs. L'antigène sérique du cancer 19-9 (CA19-9), également connu sous le nom d'antigène glucidique 19-9, sera également mesuré au départ et toutes les 4 semaines par la suite dans le cadre de la norme de soins de routine jusqu'à la fin de l'étude. De plus, un échantillon de sang total sera prélevé au départ pour étudier les variantes de l'ADN germinal. Une tomodensitométrie thoracique, abdominale et pelvienne sera réalisée au départ et toutes les 8 semaines, la réponse radiologique au traitement étant évaluée à l'aide de RECIST 1.1.

Les patients doivent avoir au moins une lésion tumorale se prêtant à une biopsie à partir de laquelle un minimum de 3 noyaux tumoraux peuvent être obtenus en toute sécurité sous guidage CT ou échographique, tel qu'évalué par un radiologue interventionnel du personnel. Un maximum de 5 noyaux tumoraux seront prélevés sur chaque patient au départ avant le traitement par FOLFIRINOX ou GP. Au moment de la progression radiologique de la maladie, une deuxième biopsie tumorale facultative sera prélevée sur les patients de la cohorte de biopsie pour étudier les changements dans les caractéristiques moléculaires des tumeurs sous la pression de sélection du traitement systémique de première ligne. Cette biopsie tumorale sera réalisée en utilisant exactement les mêmes procédures décrites pour la biopsie de référence. Les biopsies tumorales seront coordonnées avec le programme d'oncogénomique personnalisée du cancer (POG) de la Colombie-Britannique (C.-B.) et les données et/ou les échantillons partagés entre les deux études afin d'éviter de rééchantillonner le patient pour le POG et le PanGen, si le patient participe à les deux études. Des analyses moléculaires seront effectuées par BC Cancer. En fonction de la quantité de matériel tumoral obtenu de chaque patient, les analyses moléculaires seront priorisées pour établir ou confirmer le diagnostic histologique, puis utilisées pour le séquençage du génome entier, le séquençage du transcriptome entier, la protéomique et les modèles dérivés du patient.

Le critère d'évaluation principal de PanGen est la génération de signatures moléculaires et phénotypiques de tumeurs individuelles dans un délai cliniquement pertinent. Les données de signature seront corrélées avec les résultats cliniques. L'une des principales forces de cette approche de cohorte sera l'annotation rigoureuse des caractéristiques cliniques et des résultats des patients PDAC à tous les traitements (première ligne et autres) liés au profil moléculaire. Les enquêteurs ont le potentiel d'être agiles à mesure que davantage de données sont générées, que davantage d'hypothèses peuvent être explorées et que d'autres peuvent être affinées ou éliminées.