Definindo Prospectivamente Subtipos de Adenocarcinoma Ductal Pancreático Metastático por Análise Genômica Abrangente (PanGen)

Este é um estudo prospectivo não randomizado de pacientes com adenocarcinoma ductal pancreático metastático (PDAC) submetidos a quimioterapia sistêmica de primeira linha com regimes à base de ácido folínico, fluorouracil, irinotecano e oxaliplatina (FOLFIRINOX) ou gencitabina e nab-paclitaxel (GP). , onde serão obtidas amostras tumorais, amostras de sangue basais e seriadas e avaliações clínicas e radiológicas padronizadas. Os pacientes planejados para tratamento com agente(s) em investigação dentro de um ensaio clínico usando FOLFIRINOX ou GP como base de quimioterapia também serão elegíveis, desde que outros critérios de elegibilidade para o estudo sejam atendidos.

Um total de 190 pacientes serão recrutados durante o período do estudo. Os pacientes serão submetidos a biópsia de tumor fresco na linha de base do estudo para caracterização molecular abrangente (coorte de biópsia). Pacientes cuja biópsia foi incapaz de passar por todo o sequenciamento do genoma e do transcriptoma (por exemplo, devido ao conteúdo tumoral insuficiente), mas preencher todos os outros critérios de elegibilidade, fará parte da coorte de arquivo, onde análises genômicas limitadas serão realizadas em amostras de tumor de arquivo. Pacientes com diagnóstico radiológico de PDAC metastático sem diagnóstico histológico confirmatório podem ser elegíveis; nesses casos, a biópsia do tumor para estabelecer um diagnóstico patológico terá prioridade. As amostras remanescentes do tumor serão utilizadas para fins de pesquisa somente após o diagnóstico de PDAC ter sido estabelecido. No evento raro (<5%) em que o diagnóstico histológico é diferente de PDAC, os pacientes serão censurados do estudo e todos os materiais tumorais armazenados para uso clínico futuro fora deste estudo.

Todos os pacientes serão submetidos à coleta seriada de amostras de plasma e soro no início do estudo e a cada 4 semanas até o final do estudo. Estes serão usados ​​para análises exploratórias de biomarcadores. O antígeno de câncer sérico 19-9 (CA19-9), também conhecido como antígeno de carboidrato 19-9, também será medido no início do estudo e a cada 4 semanas como parte do padrão de atendimento de rotina até o final do estudo. Além disso, uma amostra de sangue total será coletada na linha de base para estudar variantes de DNA germinativo. A TC de tórax, abdome e pelve será realizada no início e a cada 8 semanas, com resposta radiológica à terapia avaliada usando RECIST 1.1.

Os pacientes devem ter pelo menos uma lesão tumoral passível de biópsia, da qual um mínimo de 3 núcleos tumorais podem ser obtidos com segurança sob orientação de TC ou ultrassom, conforme avaliado por um radiologista intervencionista da equipe. Um máximo de 5 núcleos tumorais serão retirados de cada paciente na linha de base antes do tratamento com FOLFIRINOX ou GP. No momento da progressão radiológica da doença, uma segunda biópsia opcional do tumor será coletada de pacientes na coorte de biópsia para estudar as mudanças nas características moleculares dos tumores sob a pressão de seleção da terapia sistêmica de primeira linha. Esta biópsia do tumor será realizada usando exatamente os mesmos procedimentos descritos para a biópsia de linha de base. As biópsias de tumor serão coordenadas com o programa Cancer Customized Oncogenomics (POG) da Colúmbia Britânica (BC) e os dados e/ou amostras serão compartilhados entre os dois estudos para evitar a reamostragem do paciente para POG e PanGen, se o paciente estiver participando de ambos os estudos. As análises moleculares serão realizadas pela BC Cancer. Dependendo da quantidade de material tumoral obtido de cada paciente, as análises moleculares serão priorizadas para primeiro estabelecer ou confirmar o diagnóstico histológico e, em seguida, usar para sequenciamento do genoma completo, sequenciamento do transcriptoma completo, proteômica e modelos derivados do paciente.

O objetivo primário do PanGen é a geração de assinaturas moleculares e fenotípicas de tumores individuais em um período de tempo clinicamente relevante. Os dados da assinatura serão correlacionados com o resultado clínico. Um dos principais pontos fortes dessa abordagem de coorte será a anotação rigorosa das características clínicas e resultados dos pacientes com PDAC para todos os tratamentos (de primeira linha e outros) vinculados ao perfil molecular. Os investigadores têm potencial para serem ágeis à medida que mais dados são gerados, mais hipóteses podem ser exploradas e outras ajustadas ou eliminadas.