Nästa generations sekvenseringsdiagnostik av bakteriemi vid sepsis (NextGeneSiS)
Nästa generations sekvenseringsdiagnostik av bakteriemi vid sepsis (Nästa GeneSiS-försök) - Studieprotokoll för en prospektiv, observationell, icke-interventionell, multicenter, klinisk prövning
Sepsis är fortfarande en stor utmaning, även inom modern intensivvårdsmedicin. Identifieringen av den orsakande patogenen är avgörande för en tidig optimering av den antimikrobiella behandlingsregimen hos patienter med sepsis. I detta sammanhang kan kulturbaserade diagnostiska procedurer (t.ex. blodkulturer) representerar standarden på vården, även om de är förknippade med relevanta begränsningar. Därför kulturoberoende metoder (t.ex. Next-Generation Sequencing (NGS) verkar vara ett attraktivt alternativ. Genom identifiering av cirkulerande cellfritt DNA i blodet och användningen av den kvantitativa sepsisindikerande kvantifierarpoängen (SIQ) kan orsakande patogener identifieras och potentiella kontaminationer kan uteslutas.
Målet med den presenterade studien är därför att bedöma den diagnostiska prestandan hos en NGS-baserad metod för detektion av relevanta infekterande organismer i en stor kohort av septiska patienter (n=500). Dessutom kommer rimligheten i denna NGS-baserade metod att uppskattas av en panel av oberoende kliniska specialister, som retrospektivt identifierar potentiella förändringar i patienternas hantering baserat på NGS-resultat.
Studieöversikt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljerad beskrivning
Sepsis är fortfarande en stor utmaning, även inom modern intensivvårdsmedicin. Identifieringen av den orsakande patogenen är avgörande för en tidig optimering av den antimikrobiella behandlingsregimen hos patienter med sepsis. I detta sammanhang representerar kulturbaserade diagnostiska procedurer (t.ex. blododlingar) standarden på vården, även om de är förknippade med relevanta begränsningar. Följaktligen kan odlingsoberoende molekylära diagnostiska procedurer vara till hjälp för identifiering av den orsakande patogenen hos infekterade patienter. Speciellt konceptet med en opartisk sekvensanalys av cirkulerande cellfritt DNA (cfDNA) från plasmaprover från septiska patienter genom nästa generations sekvensering (NGS) har nyligen identifierats som en lovande diagnostisk plattform för kritiskt sjuka patienter som lider av blodomloppsinfektioner. Även om detta nya tillvägagångssätt kan vara mer känsligt och specifikt än kulturbaserade toppmoderna teknologier, behövs ytterligare kliniska prövningar för att exakt definiera prestandan såväl som det kliniska värdet av en NGS-baserad metod.
Next GeneSiS är en prospektiv, observationell, icke-interventionell, multicenterstudie för att bedöma den diagnostiska prestandan hos en NGS-baserad metod för detektering av relevanta infekterande organismer hos patienter med misstänkt eller påvisad sepsis (enligt de senaste sepsisdefinitionerna [sepsis-3] ) genom användning av den kvantitativa sepsis-indikerande kvantifieraren (SIQ) poäng i jämförelse med standard (kulturbaserade) mikrobiologiska tester. Dessutom kommer det kliniska värdet av denna NGS-baserade metod att uppskattas av en panel av oberoende kliniska specialister, som retrospektivt identifierar potentiella förändringar i patienternas hantering baserat på NGS-resultat. Ytterligare undergruppsanalyser kommer att fokusera på det kliniska värdet, särskilt för patienter som lider av ett misslyckande av empirisk behandling inom de första tre dagarna efter debut (som bedömts av (1.) patientens död eller bristande förbättring av patientens kliniska tillstånd ( i termer av en otillräcklig minskning av SOFA-poäng) eller (2.) ihållande höga prokalcitoninnivåer).
Denna prospektiva, observationella, icke-interventionella, multicenterstudie undersöker för första gången prestandan och det kliniska värdet av en NGS-baserad metod för upptäckt av bakteriemi hos patienter med sepsis och kan därför vara ett avgörande steg mot klinisk användning av NGS i denna indikation.
Två uppsättningar blododlingar (2x aeroba / 2x anaeroba) kommer att samlas in vid studieinkludering (=Start) samt 72 timmar efteråt (=72h). Parallellt måste plasmaprover för NGS-baserade mätningar erhållas enligt tidigare beskrivning. Ytterligare blodprover för NGS-baserade mätningar kan samlas in närhelst läkare beställer blododlingar (2x aerobic / 2x anaerobic) på grund av den kliniska misstanken om en blodomloppsinfektion (BSI) inom de första 3 dagarna efter att studien inkluderats. Resultat av mikrobiologisk rutindiagnostik i prover som skiljer sig från blod (t.ex. kroppsvätska, vävnad, bronkoalveolsköljning, endotrakealt aspirat) kommer att användas för ytterligare analyser när de erhålls inom en tidsram på ≤72 timmar före eller efter tidpunkterna för NGS-baserade mätningar. Klinisk datainsamling och (om möjligt) PCT-mätningar kommer att utföras vid Onset såväl som 72 timmar efter studieinkludering. Den slutliga utvärderingen av patienterna kommer att utföras efter 28 dagar.
Studietyp
Inskrivning (Faktisk)
Kontakter och platser
Studieorter
-
-
-
Aachen, Tyskland, 52074
- RWTH Aachen University
-
Baden-Baden, Tyskland, 76532
- Klinikum Mittelbaden Baden-Baden Balg
-
Berlin, Tyskland
- Charité - Universitätsmedizin Berlin
-
Bielefeld, Tyskland, 33617
- Evangelisches Krankenhaus Bethel gGmbH
-
Bonn, Tyskland
- University Hospital Bonn
-
Bremerhaven, Tyskland, 27574
- Klinikum Bremerhaven Reinkenheide gGmbH
-
Duesseldorf, Tyskland, 40225
- Duesseldorf University Hospital
-
Essen, Tyskland, 45147
- University Hospital Essen
-
Frankfurt, Tyskland, 60590
- University Hospital Frankfurt
-
Göttingen, Tyskland, 37077
- University Medical Center Göttingen
-
Hannover, Tyskland, 30625
- Medical School Hannover
-
Heidelberg, Tyskland, 69120
- University Hospital Heidelberg
-
Heidenheim, Tyskland
- Kliniken Landkreis Heidenheim gGmbH
-
Köln, Tyskland
- University Hospital Köln
-
Leipzig, Tyskland
- University Hospital Leipzig
-
Luckau, Tyskland, 15926
- Evangelisches Krankenhaus Luckau gGmbH
-
Munich, Tyskland, 81675
- University Hospital Rechts der Isar
-
Regensburg, Tyskland, 93053
- University Hospital of Regensburg
-
Rostock, Tyskland, 18057
- University of Rostock
-
Tübingen, Tyskland, 72076
- University Hospital Tübingen
-
Ulm, Tyskland, 89081
- Ulm University Medical Center
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
Tar emot friska volontärer
Kön som är behöriga för studier
Testmetod
Studera befolkning
Beskrivning
Inklusionskriterier:
- Ålder ≥18 år
- Informerat samtycke
- Sepsis (med insjuknande ≤24h): Patienter med en livshotande organdysfunktion orsakad av ett dysreglerat värdsvar på en misstänkt eller bevisad infektion. Organdysfunktion kan identifieras som en akut förändring i total SOFA-poäng ≥2 poäng till följd av infektionen. Patienter kan också omedelbart identifieras vid sängkanten med qSOFA, dvs förändring i mental status, systoliskt blodtryck ≤100 mmHg eller andningsfrekvens ≥22/min.
- eller Septisk chock (med insjuknande ≤24h): Patienter med septisk chock kan identifieras med en klinisk konstruktion av sepsis med ihållande hypotoni som kräver vasopressorer för att upprätthålla medelartärtrycket (MAP) ≥65 mmHg och som har en serumlaktatnivå >2mmol/L ( 18 mg/dL) trots adekvat volymupplivning.
Exklusions kriterier:
- Ålder ≤18 år
- Vägra att ge samtycke
- Patienten kommer troligen att skrivas ut från ICU inom de första 72 timmarna efter inkluderingen
- Palliativ behandlingsuppsåt
- Klinikern är inte engagerad i aggressiv behandling
- Döden anses vara nära förestående och oundviklig
- Patienter som tidigare inkluderats, men som återinlagts på intensivvårdsavdelningen under samma sjukhusvistelse, kommer inte att inkluderas en andra gång.
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
- Observationsmodeller: Kohort
- Tidsperspektiv: Blivande
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Sepsisgrupp
Patienter (n=500) med misstänkt eller påvisad sepsis eller septisk chock (enligt Sepsis-3-definitionerna).
|
Hos 500 patienter med misstänkt eller påvisad sepsis eller septisk chock (enligt Sepsis-3-definitionerna) kommer patienternas egenskaper och rutinmässiga blodparametrar att fastställas vid sepsis debut samt 72 timmar efteråt.
Vid samma tidpunkter kommer 2 uppsättningar blododlingar och ett blodrör för nästa generations sekvensering (NGS)-diagnostik att samlas in.
En utvärdering av resultatet kommer att utföras 28 dagar efter sepsis debut.
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Känslighet [%] (av den NGS-baserade SIQ-poängen i jämförelse med blododlingsdiagnostik, som guldstandarden för identifiering av den orsakande patogenen i sepsis)
Tidsram: 2 år
|
Andel positiva som är korrekt identifierade som sådana.
|
2 år
|
|
Specificitet [%] (av den NGS-baserade SIQ-poängen i jämförelse med blododlingsdiagnostik, som guldstandarden för identifiering av den orsakande patogenen vid sepsis)
Tidsram: 2 år
|
Andel negativ som är korrekt identifierade som sådana.
|
2 år
|
|
Positivt prediktivt värde [%] (av den NGS-baserade SIQ-poängen i jämförelse med blododlingsdiagnostik, som guldstandarden för identifiering av den orsakande patogenen i sepsis)
Tidsram: 2 år
|
Andel positiva som är riktigt positiva.
|
2 år
|
|
Negativt prediktivt värde [%] (av den NGS-baserade SIQ-poängen i jämförelse med blododlingsdiagnostik, som guldstandard för identifiering av den orsakande patogenen vid sepsis)
Tidsram: 2 år
|
Andel negativa som är sant negativa.
|
2 år
|
|
Cohens kappa-koefficient [ingen mätenhet; 0</=k</=1] (av den NGS-baserade SIQ-poängen i jämförelse med blododlingsdiagnostik, som guldstandarden för identifiering av den orsakande patogenen vid sepsis)
Tidsram: 2 år
|
Mätning av interobservatörsöverenskommelsen mellan båda objekten.
|
2 år
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Plausibilitet [%] (av den NGS-baserade SIQ-poängen)
Tidsram: 2,5 år
|
Med hjälp av en majoritetsregel kommer SIQ-resultaten att utvärderas för rimlighet av en panel av tre oberoende kliniska specialister som inte är associerade med studieplatsen.
Därför kommer panelen att förses med sammanfattningar av kliniska fall, NGS-resultat och standard-of-care-resultat från alla testade prover.
Resultat av mikrobiologisk rutindiagnostik i prover som skiljer sig från blod (t.ex.
kroppsvätska, vävnad, bronkoalveolsköljning, endotrakealt aspirat) kommer att inkluderas när de har erhållits inom en tidsram på ≤72 timmar före eller efter tidpunkterna för NGS-baserade mätningar.
|
2,5 år
|
|
Förändringar i behandlingen [%] (som kan ha inträffat om den NGS-baserade SIQ-poängen hade varit tillgänglig för klinisk användning)
Tidsram: 2,5 år
|
Med hjälp av en majoritetsregel kommer det kliniska värdet av det NGS-baserade tillvägagångssättet att uppskattas av en panel av tre oberoende kliniska specialister som inte är associerade med studieplatsen, som retrospektivt identifierar potentiella förändringar i patienternas hantering baserat på NGS-resultat.
Därför kommer panelen att förses med sammanfattningar av kliniska fall, NGS-resultat och standard-of-care-resultat från alla testade prover.
Resultat av mikrobiologisk rutindiagnostik i prover som skiljer sig från blod (t.ex.
kroppsvätska, vävnad, bronkoalveolsköljning, endotrakealt aspirat) kommer att inkluderas när de har erhållits inom en tidsram på ≤72 timmar före eller efter tidpunkterna för NGS-baserade mätningar.
För att identifiera potentiella förändringar i antimikrobiell behandling som kan ha inträffat om resultaten från NGS-tekniken hade varit tillgängliga för klinisk användning kommer panelen att förses med ett särskilt frågeformulär.
|
2,5 år
|
Samarbetspartners och utredare
Sponsor
Samarbetspartners
Utredare
- Huvudutredare: Thorsten Brenner, MD, University Hospital, Essen
Publikationer och användbara länkar
Allmänna publikationer
- Decker SO, Sigl A, Grumaz C, Stevens P, Vainshtein Y, Zimmermann S, Weigand MA, Hofer S, Sohn K, Brenner T. Immune-Response Patterns and Next Generation Sequencing Diagnostics for the Detection of Mycoses in Patients with Septic Shock-Results of a Combined Clinical and Experimental Investigation. Int J Mol Sci. 2017 Aug 18;18(8):1796. doi: 10.3390/ijms18081796.
- Grumaz S, Stevens P, Grumaz C, Decker SO, Weigand MA, Hofer S, Brenner T, von Haeseler A, Sohn K. Next-generation sequencing diagnostics of bacteremia in septic patients. Genome Med. 2016 Jul 1;8(1):73. doi: 10.1186/s13073-016-0326-8.
- Brenner T, Decker SO, Grumaz S, Stevens P, Bruckner T, Schmoch T, Pletz MW, Bracht H, Hofer S, Marx G, Weigand MA, Sohn K; TIFOnet Critical Care Trials Group. Next-generation sequencing diagnostics of bacteremia in sepsis (Next GeneSiS-Trial): Study protocol of a prospective, observational, noninterventional, multicenter, clinical trial. Medicine (Baltimore). 2018 Feb;97(6):e9868. doi: 10.1097/MD.0000000000009868.
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
Primärt slutförande (Faktisk)
Avslutad studie (Faktisk)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (Faktisk)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- S-084/2017
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .