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Sequenzierungsdiagnostik der nächsten Generation für Bakteriämie bei Sepsis (NextGeneSiS)

17. Mai 2022 aktualisiert von: Thorsten Brenner, MD, University Hospital Heidelberg

Next-Generation Sequencing Diagnostics of Bacteremia in Sepsis (Next GeneSiS-Trial) – Studienprotokoll für eine prospektive, beobachtende, nicht-interventionelle, multizentrische, klinische Studie

Sepsis bleibt auch in der modernen Intensivmedizin eine große Herausforderung. Die Identifizierung des verursachenden Erregers ist entscheidend für eine frühzeitige Optimierung des antimikrobiellen Behandlungsregimes bei Patienten mit Sepsis. In diesem Zusammenhang sind kulturbasierte Diagnoseverfahren (z. Blutkulturen) stellen den Versorgungsstandard dar, sind jedoch mit entsprechenden Einschränkungen verbunden. Daher sind kulturunabhängige Methoden (z. Next-Generation Sequencing (NGS)) scheinen eine attraktive Alternative zu sein. Durch die Identifizierung zirkulierender zellfreier DNA im Blut und die Verwendung des Quantitative Sepsis Indication Quantifier (SIQ)-Scores können verursachende Krankheitserreger identifiziert und potenzielle Kontaminationen ausgeschlossen werden.

Das Ziel der vorgestellten Studie ist es daher, die diagnostische Leistung eines NGS-basierten Ansatzes zum Nachweis relevanter infektiöser Organismen in einer großen Kohorte von septischen Patienten (n=500) zu bewerten. Darüber hinaus wird die Plausibilität dieses NGS-basierten Ansatzes von einem Gremium unabhängiger klinischer Spezialisten bewertet, die anhand der NGS-Ergebnisse rückblickend mögliche Änderungen im Patientenmanagement identifizieren.

Studienübersicht

Status

Abgeschlossen

Bedingungen

Intervention / Behandlung

Detaillierte Beschreibung

Sepsis bleibt auch in der modernen Intensivmedizin eine große Herausforderung. Die Identifizierung des verursachenden Erregers ist entscheidend für eine frühzeitige Optimierung des antimikrobiellen Behandlungsregimes bei Patienten mit Sepsis. In diesem Zusammenhang stellen kulturbasierte diagnostische Verfahren (z. B. Blutkulturen) den Versorgungsstandard dar, sind jedoch mit entsprechenden Einschränkungen verbunden. Dementsprechend könnten kulturunabhängige molekulardiagnostische Verfahren zur Identifizierung des ursächlichen Erregers bei infizierten Patienten hilfreich sein. Insbesondere das Konzept einer unvoreingenommenen Sequenzanalyse zirkulierender zellfreier DNA (cfDNA) aus Plasmaproben septischer Patienten durch Next-Generation-Sequencing (NGS) wurde kürzlich als vielversprechende diagnostische Plattform für kritisch kranke Patienten mit Blutstrominfektionen identifiziert. Obwohl dieser neue Ansatz empfindlicher und spezifischer sein könnte als kulturbasierte State-of-the-Art-Technologien, sind zusätzliche klinische Studien erforderlich, um die Leistung sowie den klinischen Wert eines NGS-basierten Ansatzes genau zu definieren.

Next GeneSiS ist eine prospektive, beobachtende, nicht-interventionelle, multizentrische Studie zur Bewertung der diagnostischen Leistung eines NGS-basierten Ansatzes zum Nachweis relevanter infektiöser Organismen bei Patienten mit vermuteter oder nachgewiesener Sepsis (gemäß neueren Sepsis-Definitionen [Sepsis-3] ) durch die Verwendung des SIQ-Scores (Quantitative Sepsis Indication Quantifier) ​​im Vergleich zu standardmäßigen (kulturbasierten) mikrobiologischen Tests. Darüber hinaus wird der klinische Wert dieses NGS-basierten Ansatzes von einem Gremium unabhängiger klinischer Spezialisten geschätzt, die anhand der NGS-Ergebnisse rückblickend mögliche Änderungen im Patientenmanagement identifizieren. Weitere Subgruppenanalysen konzentrieren sich auf den klinischen Wert insbesondere für Patienten, bei denen die empirische Behandlung innerhalb der ersten drei Tage nach Beginn fehlschlug (beurteilt durch (1.) Tod des Patienten oder ausbleibende Verbesserung des klinischen Zustands des Patienten ( im Sinne eines unzureichenden Absinkens des SOFA-Scores) oder (2.) anhaltend hoher Procalcitoninspiegel).

Diese prospektive, beobachtende, nicht-interventionelle, multizentrische Studie untersucht zum ersten Mal die Leistungsfähigkeit sowie den klinischen Wert eines NGS-basierten Ansatzes zum Nachweis einer Bakteriämie bei Patienten mit Sepsis und kann daher ein entscheidender Schritt in Richtung der klinischen Anwendung sein von NGS in dieser Indikation.

Zwei Sätze Blutkulturen (2x aerob / 2x anaerob) werden bei Studieneinschluss (=Onset) sowie 72 Stunden danach (=72h) entnommen. Parallel dazu müssen Plasmaproben für NGS-basierte Messungen wie zuvor beschrieben gewonnen werden. Weitere Blutproben für NGS-basierte Messungen können bei ärztlicher Anordnung von Blutkulturen (2x aerob / 2x anaerob) aufgrund des klinischen Verdachts auf eine Blutstrominfektion (BSI) innerhalb der ersten 3 Tage nach Studieneinschluss entnommen werden. Ergebnisse der mikrobiologischen Routinediagnostik in anderen Proben als Blut (z. Körperflüssigkeit, Gewebe, bronchoalveoläre Lavage, endotracheales Aspirat) werden für weitere Analysen verwendet, wenn sie innerhalb eines Zeitrahmens von ≤72 Stunden vor oder nach den Zeitpunkten für NGS-basierte Messungen gewonnen werden. Die Erhebung klinischer Daten und (falls möglich) PCT-Messungen werden zu Beginn sowie 72 Stunden nach Studieneinschluss durchgeführt. Die endgültige Ergebnisbewertung der Patienten wird nach 28 Tagen durchgeführt.

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Tatsächlich)

500

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

  • Deutschland
      • Aachen, Deutschland, 52074
        • RWTH Aachen University
      • Baden-Baden, Deutschland, 76532
        • Klinikum Mittelbaden Baden-Baden Balg
      • Berlin, Deutschland
        • Charité - Universitätsmedizin Berlin
      • Bielefeld, Deutschland, 33617
        • Evangelisches Krankenhaus Bethel gGmbH
      • Bonn, Deutschland
        • University Hospital Bonn
      • Bremerhaven, Deutschland, 27574
        • Klinikum Bremerhaven Reinkenheide gGmbH
      • Duesseldorf, Deutschland, 40225
        • Duesseldorf University Hospital
      • Essen, Deutschland, 45147
        • University Hospital Essen
      • Frankfurt, Deutschland, 60590
        • University Hospital Frankfurt
      • Göttingen, Deutschland, 37077
        • University Medical Center Göttingen
      • Hannover, Deutschland, 30625
        • Medical School Hannover
      • Heidelberg, Deutschland, 69120
        • University Hospital Heidelberg
      • Heidenheim, Deutschland
        • Kliniken Landkreis Heidenheim gGmbH
      • Köln, Deutschland
        • University Hospital Köln
      • Leipzig, Deutschland
        • University Hospital Leipzig
      • Luckau, Deutschland, 15926
        • Evangelisches Krankenhaus Luckau gGmbH
      • Munich, Deutschland, 81675
        • University Hospital Rechts der Isar
      • Regensburg, Deutschland, 93053
        • University Hospital of Regensburg
      • Rostock, Deutschland, 18057
        • University of Rostock
      • Tübingen, Deutschland, 72076
        • University Hospital Tübingen
      • Ulm, Deutschland, 89081
        • Ulm University Medical Center

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

18 Jahre bis 99 Jahre (Erwachsene, Älterer Erwachsener)

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Studienberechtigte Geschlechter

Alle

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

Patienten mit Sepsis oder septischem Schock gemäß den neuen Sepsis-Definitionen (Sepsis-3) mit Beginn < 24 Stunden sind für den Studieneinschluss geeignet.

Beschreibung

Einschlusskriterien:

  • Alter ≥18 Jahre
  • Einverständniserklärung
  • Sepsis (mit Beginn ≤ 24 h): Patienten mit einer lebensbedrohlichen Organfunktionsstörung, die durch eine fehlregulierte Wirtsantwort auf eine vermutete oder nachgewiesene Infektion verursacht wird. Eine Organdysfunktion kann als akute Veränderung des Gesamt-SOFA-Scores ≥ 2 Punkte als Folge der Infektion identifiziert werden. Patienten können auch direkt am Krankenbett mit qSOFA identifiziert werden, dh Veränderung des Geisteszustands, systolischer Blutdruck ≤ 100 mmHg oder Atemfrequenz ≥ 22/min.
  • oder septischer Schock (mit Beginn ≤ 24 h): Patienten mit septischem Schock können mit einem klinischen Konstrukt einer Sepsis mit anhaltender Hypotonie identifiziert werden, die Vasopressoren erfordert, um den mittleren arteriellen Druck (MAP) ≥ 65 mmHg aufrechtzuerhalten, und die einen Serumlaktatspiegel > 2 mmol/l aufweisen ( 18 mg/dL) trotz adäquater Volumenreanimation.

Ausschlusskriterien:

  • Alter ≤18 Jahre
  • Verweigerung der Einwilligung
  • Der Patient wird wahrscheinlich innerhalb der ersten 72 Stunden nach der Aufnahme von der Intensivstation entlassen
  • Palliative Behandlungsabsicht
  • Der Arzt verpflichtet sich nicht zu einer aggressiven Behandlung
  • Der Tod gilt als unmittelbar bevorstehend und unvermeidlich
  • Patienten, die zuvor aufgenommen wurden, aber während desselben Krankenhausaufenthalts wieder auf die Intensivstation aufgenommen werden, werden nicht ein zweites Mal aufgenommen.

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

  • Beobachtungsmodelle: Kohorte
  • Zeitperspektiven: Interessent

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
Intervention / Behandlung
Sepsis-Gruppe
Patienten (n=500) mit vermuteter oder nachgewiesener Sepsis oder septischem Schock (gemäß den Sepsis-3-Definitionen).
Diagnosetest: Sequenzierung der nächsten Generation
Bei 500 Patienten mit Verdacht auf oder nachgewiesener Sepsis oder septischem Schock (gemäß der Sepsis-3-Definition) werden Patientencharakteristika und routinemäßige Blutparameter bei Beginn der Sepsis sowie 72 Stunden danach bestimmt. Gleichzeitig werden 2 Sätze Blutkulturen und ein Blutröhrchen für die Next-Generation Sequencing (NGS)-Diagnostik entnommen. Eine Bewertung des Ergebnisses wird 28 Tage nach Beginn der Sepsis durchgeführt.

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Sensitivität [%] (des NGS-basierten SIQ-Scores im Vergleich zur Blutkulturdiagnostik, als Goldstandard zur Identifizierung des verursachenden Erregers bei Sepsis)
Zeitfenster: 2 Jahre
Anteil der korrekt als solche erkannten Positiven.
2 Jahre
Spezifität [%] (des NGS-basierten SIQ-Scores im Vergleich zur Blutkulturdiagnostik, als Goldstandard zur Identifizierung des Erregers der Sepsis)
Zeitfenster: 2 Jahre
Anteil der korrekt als solche erkannten Negative.
2 Jahre
Positiver Vorhersagewert [%] (des NGS-basierten SIQ-Scores im Vergleich zur Blutkulturdiagnostik, als Goldstandard zur Identifizierung des ursächlichen Erregers bei Sepsis)
Zeitfenster: 2 Jahre
Anteil der positiven Ergebnisse, die richtig positiv sind.
2 Jahre
Negativer prädiktiver Wert [%] (des NGS-basierten SIQ-Scores im Vergleich zur Blutkulturdiagnostik, als Goldstandard zur Identifizierung des ursächlichen Erregers bei Sepsis)
Zeitfenster: 2 Jahre
Anteil der Negative, die richtig negativ sind.
2 Jahre
Cohens Kappa-Koeffizient [keine Maßeinheit; 0</=k</=1] (des NGS-basierten SIQ-Scores im Vergleich zur Blutkulturdiagnostik, als Goldstandard zur Identifizierung des ursächlichen Erregers bei Sepsis)
Zeitfenster: 2 Jahre
Messung der Interobserver-Übereinstimmung zwischen beiden Items.
2 Jahre

Sekundäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Plausibilität [%] (des NGS-basierten SIQ-Scores)
Zeitfenster: 2,5 Jahre
Unter Verwendung einer Mehrheitsregel werden die SIQ-Score-Ergebnisse von einem Gremium aus drei unabhängigen klinischen Spezialisten, die nicht mit dem Studienzentrum verbunden sind, auf Plausibilität bewertet. Daher werden dem Gremium klinische Fallzusammenfassungen, NGS-Ergebnisse und Standard-of-Care-Ergebnisse von allen getesteten Proben zur Verfügung gestellt. Ergebnisse der mikrobiologischen Routinediagnostik in anderen Proben als Blut (z. Körperflüssigkeit, Gewebe, bronchoalveoläre Lavage, endotracheales Aspirat) werden eingeschlossen, wenn sie innerhalb eines Zeitrahmens von ≤72 Stunden vor oder nach den Zeitpunkten für NGS-basierte Messungen gewonnen wurden.
2,5 Jahre
Therapieänderungen [%] (die möglicherweise aufgetreten sind, wenn der NGS-basierte SIQ-Score für die klinische Anwendung verfügbar gewesen wäre)
Zeitfenster: 2,5 Jahre
Unter Verwendung einer Mehrheitsregel wird der klinische Wert des NGS-basierten Ansatzes von einem Gremium aus drei unabhängigen klinischen Spezialisten, die nicht mit dem Studienzentrum in Verbindung stehen, geschätzt, wobei potenzielle Änderungen im Patientenmanagement auf der Grundlage von NGS-Ergebnissen retrospektiv identifiziert werden. Daher werden dem Gremium klinische Fallzusammenfassungen, NGS-Ergebnisse und Standard-of-Care-Ergebnisse von allen getesteten Proben zur Verfügung gestellt. Ergebnisse der mikrobiologischen Routinediagnostik in anderen Proben als Blut (z. Körperflüssigkeit, Gewebe, bronchoalveoläre Lavage, endotracheales Aspirat) werden eingeschlossen, wenn sie innerhalb eines Zeitrahmens von ≤72 Stunden vor oder nach den Zeitpunkten für NGS-basierte Messungen gewonnen wurden. Um mögliche Änderungen im antimikrobiellen Management zu identifizieren, die aufgetreten wären, wenn die Ergebnisse der NGS-Technologie für den klinischen Einsatz verfügbar gewesen wären, wird dem Gremium ein spezieller Fragebogen zur Verfügung gestellt.
2,5 Jahre

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

University Hospital Heidelberg

Mitarbeiter

Fraunhofer Institute for Interfacial Engineering and Biotechnology
Dietmar Hopp Stiftung GmbH

Ermittler

  • Hauptermittler: Thorsten Brenner, MD, University Hospital, Essen

Publikationen und hilfreiche Links

Die Bereitstellung dieser Publikationen erfolgt freiwillig durch die für die Eingabe von Informationen über die Studie verantwortliche Person. Diese können sich auf alles beziehen, was mit dem Studium zu tun hat.

Allgemeine Veröffentlichungen

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

1. März 2019

Primärer Abschluss (Tatsächlich)

31. August 2021

Studienabschluss (Tatsächlich)

30. September 2021

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

19. November 2017

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

22. November 2017

Zuerst gepostet (Tatsächlich)

29. November 2017

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

18. Mai 2022

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

17. Mai 2022

Zuletzt verifiziert

1. Mai 2022

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Schlüsselwörter

Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen

Andere Studien-ID-Nummern

  • S-084/2017

Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)

Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?

Nein

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

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