Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

Bakteremian seuraavan sukupolven sekvensointidiagnostiikka sepsiksessä (NextGeneSiS)

tiistai 17. toukokuuta 2022 päivittänyt: Thorsten Brenner, MD, University Hospital Heidelberg

Bakteremian seuraavan sukupolven sekvensointidiagnostiikka sepsiksessä (seuraava GeneSiS-koe) – Prospektiivisen, havainnoivan, ei-interventionaalisen, monikeskuksen kliinisen tutkimuksen tutkimuspöytäkirja

Sepsis on edelleen suuri haaste jopa nykyaikaisessa tehohoidossa. Taudin aiheuttavan patogeenin tunnistaminen on ratkaisevan tärkeää sepsispotilaiden antimikrobisen hoito-ohjelman varhaisessa optimoinnissa. Tässä yhteydessä viljelyyn perustuvat diagnostiset toimenpiteet (esim. veriviljelmät) edustavat hoidon standardia, vaikka niihin liittyy olennaisia ​​rajoituksia. Siksi kulttuurista riippumattomia menetelmiä (esim. Next-Generation Sequencing (NGS)) näyttää houkuttelevalta vaihtoehdolta. Tunnistamalla verestä kiertävä soluvapaa DNA ja käyttämällä kvantitatiivista sepsis-indikoivaa kvantifiointiarvoa (SIQ) voidaan tunnistaa aiheuttavat patogeenit ja sulkea pois mahdolliset kontaminaatiot.

Esitetyn tutkimuksen tavoitteena on siksi arvioida NGS-pohjaisen lähestymistavan diagnostista suorituskykyä relevanttien infektoivien organismien havaitsemiseksi suuressa septisten potilaiden ryhmässä (n=500). Lisäksi riippumattomista kliinisistä asiantuntijoista koostuva paneeli arvioi tämän NGS-pohjaisen lähestymistavan uskottavuuden ja tunnistaa takautuvasti mahdolliset muutokset potilaiden hoidossa NGS-tulosten perusteella.

Tutkimuksen yleiskatsaus

Tila

Valmis

Ehdot

Interventio / Hoito

Yksityiskohtainen kuvaus

Sepsis on edelleen suuri haaste jopa nykyaikaisessa tehohoidossa. Taudin aiheuttavan patogeenin tunnistaminen on ratkaisevan tärkeää sepsispotilaiden antimikrobisen hoito-ohjelman varhaisessa optimoinnissa. Tässä yhteydessä viljelmiin perustuvat diagnostiset menetelmät (esim. veriviljelyt) edustavat hoidon standardia, vaikka niihin liittyy olennaisia ​​rajoituksia. Näin ollen viljelmästä riippumattomat molekyylidiagnostiset menetelmät voivat olla avuksi taudinaiheuttajaa aiheuttavan patogeenin tunnistamisessa tartunnan saaneilla potilailla. Erityisesti septisten potilaiden plasmanäytteistä peräisin olevan kiertävän soluttoman DNA:n (cfDNA) puolueeton sekvenssianalyysi seuraavan sukupolven sekvensoinnilla (NGS) on äskettäin tunnistettu lupaavaksi diagnostiseksi alustaksi kriittisesti sairaille potilaille, jotka kärsivät verenkierron infektioista. Vaikka tämä uusi lähestymistapa saattaa olla herkempi ja spesifisempi kuin kulttuuriin perustuvat huipputekniikat, tarvitaan lisää kliinisiä tutkimuksia NGS-pohjaisen lähestymistavan suorituskyvyn ja kliinisen arvon määrittämiseksi tarkasti.

Next GeneSiS on prospektiivinen, havainnollinen, ei-interventio, monikeskustutkimus, jolla arvioidaan NGS-pohjaisen lähestymistavan diagnostista suorituskykyä relevanttien infektoivien organismien havaitsemiseksi potilailla, joilla on epäilty tai todettu sepsis (viimeaikaisten sepsismääritelmien mukaan [sepsis-3]). ) käyttämällä kvantitatiivista sepsiksen osoittavaa kvantifiointiarvoa (SIQ) verrattuna tavanomaisiin (viljelypohjaisiin) mikrobiologisiin testeihin. Lisäksi riippumattomista kliinisistä asiantuntijoista koostuva paneeli arvioi tämän NGS-pohjaisen lähestymistavan kliinisen arvon ja tunnistaa takautuvasti mahdollisia muutoksia potilaiden hoidossa NGS-tulosten perusteella. Jatkossa alaryhmäanalyysit keskittyvät kliiniseen arvoon erityisesti potilailla, jotka kärsivät empiirisen hoidon epäonnistumisesta kolmen ensimmäisen päivän aikana (arvioitu (1.) potilaan kuolemalla tai potilaan kliinisen tilan paranemisen puutteella). SOFA-pisteiden riittämätön lasku) tai (2.) jatkuvasti korkeat prokalsitoniinitasot).

Tämä prospektiivinen, havainnollinen, ei-interventio, monikeskustutkimustutkimus tutkii ensimmäistä kertaa NGS-pohjaisen lähestymistavan suorituskykyä ja kliinistä arvoa bakteremian havaitsemiseksi sepsispotilailla ja voi siksi olla keskeinen askel kohti kliinistä käyttöä. NGS tässä indikaatiossa.

Kaksi veriviljelmäsarjaa (2x aerobinen / 2x anaerobinen) kerätään tutkimukseen sisällyttämisen yhteydessä (=alku) sekä 72 tuntia sen jälkeen (=72h). Samanaikaisesti plasmanäytteitä NGS-pohjaisia ​​mittauksia varten on hankittava aiemmin kuvatulla tavalla. Lisää verinäytteitä NGS-pohjaisia ​​mittauksia varten voidaan kerätä aina, kun lääkärit tilaavat veriviljelmiä (2x aerobinen / 2x anaerobinen), koska kliinisesti epäillään verenkiertoinfektiota (BSI) kolmen ensimmäisen päivän aikana tutkimukseen sisällyttämisen jälkeen. Mikrobiologisen rutiinidiagnostiikan tulokset eri näytteistä (esim. ruumiinneste, kudos, bronkoalveolaarinen huuhtelu, endotrakeaalinen aspiraatti) käytetään lisäanalyyseihin, kun ne saadaan ≤72 tunnin kuluessa ennen tai jälkeen NGS-pohjaisten mittausten aikapisteitä. Kliiniset tiedot ja (jos mahdollista) PCT-mittaukset suoritetaan tutkimuksen alkaessa sekä 72 tuntia tutkimukseen osallistumisen jälkeen. Potilaiden lopputuloksen arviointi suoritetaan 28 päivän kuluttua.

Opintotyyppi

Havainnollistava

Ilmoittautuminen (Todellinen)

500

Yhteystiedot ja paikat

Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.

Opiskelupaikat

  • Saksa
      • Aachen, Saksa, 52074
        • RWTH Aachen University
      • Baden-Baden, Saksa, 76532
        • Klinikum Mittelbaden Baden-Baden Balg
      • Berlin, Saksa
        • Charité - Universitätsmedizin Berlin
      • Bielefeld, Saksa, 33617
        • Evangelisches Krankenhaus Bethel gGmbH
      • Bonn, Saksa
        • University Hospital Bonn
      • Bremerhaven, Saksa, 27574
        • Klinikum Bremerhaven Reinkenheide gGmbH
      • Duesseldorf, Saksa, 40225
        • Duesseldorf University Hospital
      • Essen, Saksa, 45147
        • University Hospital Essen
      • Frankfurt, Saksa, 60590
        • University Hospital Frankfurt
      • Göttingen, Saksa, 37077
        • University Medical Center Göttingen
      • Hannover, Saksa, 30625
        • Medical School Hannover
      • Heidelberg, Saksa, 69120
        • University Hospital Heidelberg
      • Heidenheim, Saksa
        • Kliniken Landkreis Heidenheim gGmbH
      • Köln, Saksa
        • University Hospital Koln
      • Leipzig, Saksa
        • University Hospital Leipzig
      • Luckau, Saksa, 15926
        • Evangelisches Krankenhaus Luckau gGmbH
      • Munich, Saksa, 81675
        • University Hospital Rechts der Isar
      • Regensburg, Saksa, 93053
        • University Hospital of Regensburg
      • Rostock, Saksa, 18057
        • University of Rostock
      • Tübingen, Saksa, 72076
        • University Hospital Tübingen
      • Ulm, Saksa, 89081
        • Ulm University Medical Center

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

18 vuotta - 99 vuotta (Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Ei

Sukupuolet, jotka voivat opiskella

Kaikki

Näytteenottomenetelmä

Ei-todennäköisyysnäyte

Tutkimusväestö

Potilaat, joilla on uusien sepsismääritelmien (Sepsis-3) mukainen sepsis tai septinen sokki, jotka alkavat < 24 tuntia, voivat osallistua tutkimukseen.

Kuvaus

Sisällyttämiskriteerit:

  • Ikä ≥18v
  • Tietoinen suostumus
  • Sepsis (alkaa ≤ 24 h): Potilaat, joilla on hengenvaarallinen elinten toimintahäiriö, joka johtuu isännän epäsäännöllisestä vasteesta epäiltyyn tai todistettuun infektioon. Elinten toimintahäiriö voidaan tunnistaa akuuttiksi muutokseksi SOFA-kokonaispistemäärässä ≥2 pistettä infektion seurauksena. Potilaat voidaan myös välittömästi tunnistaa sängyn vieressä qSOFA:lla eli psyykkisen tilan muutoksilla, systolisella verenpaineella ≤100 mmHg tai hengitystiheydellä ≥22/min.
  • tai Septinen sokki (alkaa ≤ 24 h): Potilaat, joilla on septinen shokki, voidaan tunnistaa kliinisestä sepsiksen konstruktista ja jatkuvasta hypotensiosta, joka vaatii vasopressoreita ylläpitämään keskimääräistä valtimopainetta (MAP) ≥ 65 mmHg:ssa ja joiden seerumin laktaattitaso on > 2 mmol/l ( 18mg/dl) riittävästä elvytyksestä huolimatta.

Poissulkemiskriteerit:

  • Ikä ≤18v
  • Kieltäytyminen antamasta suostumusta
  • Potilas todennäköisesti kotiutetaan teho-osastolta ensimmäisten 72 tunnin kuluessa sisällyttämisestä
  • Palliatiivisen hoidon tarkoitus
  • Kliinikko ei ole sitoutunut aggressiiviseen hoitoon
  • Kuolemaa pidetään välittömänä ja väistämättömänä
  • Potilaita, jotka olivat aiemmin mukana, mutta jotka on otettu takaisin teho-osastolle saman sairaalahoidon aikana, ei oteta mukaan toista kertaa.

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

  • Havaintomallit: Kohortti
  • Aikanäkymät: Tulevaisuuden

Kohortit ja interventiot

Ryhmä/Kohortti
Interventio / Hoito
Sepsis ryhmä
Potilaat (n=500), joilla on epäilty tai todistettu sepsis tai septinen sokki (Sepsis-3-määritelmien mukaan).
Diagnostinen testi: Seuraavan sukupolven sekvensointi
500 potilaalla, joilla epäillään tai todistetusti sepsis tai septinen sokki (Sepsis-3-määritelmien mukaan), potilaan ominaisuudet ja rutiininomaiset veriparametrit määritetään sepsiksen alkaessa ja 72 tunnin kuluttua sen jälkeen. Samaan aikaan kerätään 2 sarjaa veriviljelmiä ja yksi veriputki Next-Generation Sequencing (NGS) -diagnostiikkaa varten. Tuloksen arviointi suoritetaan 28 päivän kuluttua sepsiksen alkamisesta.

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
Herkkyys [%] (NGS-pohjaisesta SIQ-pisteestä verrattuna veriviljelydiagnostiikkaan, kultastandardina sepsiksen aiheuttavan patogeenin tunnistamisessa)
Aikaikkuna: 2 vuotta
Niiden positiivisten osuudet, jotka on tunnistettu oikein sellaisiksi.
2 vuotta
Spesifisyys [%] (NGS-pohjaisesta SIQ-pisteestä verrattuna veriviljelydiagnostiikkaan kultaisena standardina sepsiksen aiheuttavan patogeenin tunnistamisessa)
Aikaikkuna: 2 vuotta
Negatiivien osuus, jotka on tunnistettu oikein sellaisiksi.
2 vuotta
Positiivinen ennustearvo [%] (NGS-pohjaisesta SIQ-pisteestä verrattuna veriviljelydiagnostiikkaan, kultastandardina sepsiksen aiheuttavan patogeenin tunnistamisessa)
Aikaikkuna: 2 vuotta
Positiivisten asioiden osuus, jotka ovat todella positiivisia.
2 vuotta
Negatiivinen ennustearvo [%] (NGS-pohjaisesta SIQ-pisteestä verrattuna veriviljelydiagnostiikkaan, kultastandardina sepsiksen aiheuttavan patogeenin tunnistamisessa)
Aikaikkuna: 2 vuotta
Negatiivisten asioiden osuus, jotka ovat todellisia negatiivisia.
2 vuotta
Cohenin kappakerroin [ei mittayksikköä; 0</=k</=1] (NGS-pohjaisesta SIQ-pisteestä verrattuna veriviljelydiagnostiikkaan, kultastandardina sepsiksen aiheuttavan patogeenin tunnistamisessa)
Aikaikkuna: 2 vuotta
Molempien kohteiden välisen tarkkailijasopimuksen mittaus.
2 vuotta

Toissijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
Uskottavuus [%] (NGS-pohjaisesta SIQ-pisteestä)
Aikaikkuna: 2,5 vuotta
Enemmistösääntöä käyttäen kolmen riippumattoman kliinisen asiantuntijan paneeli, jotka eivät liity tutkimuspaikkaan, arvioi SIQ-pisteiden tulosten uskottavuuden. Siksi paneelille toimitetaan kliiniset tapausyhteenvedot, NGS-tulokset ja hoidon standarditulokset kaikista testatuista näytteistä. Mikrobiologisen rutiinidiagnostiikan tulokset eri näytteistä (esim. ruumiinneste, kudos, bronkoalveolaarinen huuhtelu, endotrakeaalinen aspiraatti) otetaan mukaan, kun ne on saatu ≤72 tunnin kuluessa ennen tai jälkeen NGS-pohjaisten mittausten aikapisteitä.
2,5 vuotta
Muutokset hoidossa [%] (tämä on saattanut tapahtua, jos NGS-pohjainen SIQ-piste olisi ollut saatavilla kliiniseen käyttöön)
Aikaikkuna: 2,5 vuotta
Enemmistösäännön mukaisesti NGS-pohjaisen lähestymistavan kliinisen arvon arvioi kolmen riippumattoman kliinisen asiantuntijan paneeli, jotka eivät liity tutkimuspaikkaan ja tunnistavat takautuvasti mahdolliset muutokset potilaiden hoidossa NGS-tulosten perusteella. Siksi paneelille toimitetaan kliiniset tapausyhteenvedot, NGS-tulokset ja hoidon standarditulokset kaikista testatuista näytteistä. Mikrobiologisen rutiinidiagnostiikan tulokset eri näytteistä (esim. ruumiinneste, kudos, bronkoalveolaarinen huuhtelu, endotrakeaalinen aspiraatti) otetaan mukaan, kun ne on saatu ≤72 tunnin kuluessa ennen tai jälkeen NGS-pohjaisten mittausten aikapisteitä. Paneelille toimitetaan erityinen kyselylomake mahdollisten muutosten tunnistamiseksi mikrobilääkkeiden hallinnassa, jos NGS-teknologian tulokset olisivat olleet saatavilla kliiniseen käyttöön.
2,5 vuotta

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Sponsori

University Hospital Heidelberg

Yhteistyökumppanit

Fraunhofer Institute for Interfacial Engineering and Biotechnology
Dietmar Hopp Stiftung GmbH

Tutkijat

  • Päätutkija: Thorsten Brenner, MD, University Hospital, Essen

Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä

Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.

Yleiset julkaisut

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan ​​julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus (Todellinen)

Perjantai 1. maaliskuuta 2019

Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)

Tiistai 31. elokuuta 2021

Opintojen valmistuminen (Todellinen)

Torstai 30. syyskuuta 2021

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Sunnuntai 19. marraskuuta 2017

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Keskiviikko 22. marraskuuta 2017

Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)

Keskiviikko 29. marraskuuta 2017

Tutkimustietojen päivitykset

Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)

Keskiviikko 18. toukokuuta 2022

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Tiistai 17. toukokuuta 2022

Viimeksi vahvistettu

Sunnuntai 1. toukokuuta 2022

Lisää tietoa

Tähän tutkimukseen liittyvät termit

Avainsanat

Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja

Muut tutkimustunnusnumerot

  • S-084/2017

Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)

Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?

Ei

Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta

Ei

Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta

Ei

Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .

Kliiniset tutkimukset Sepsis

Kliiniset tutkimukset Seuraavan sukupolven sekvensointi

Hae vastaavia kokeiluja

Sponsorit ja yhteistyökumppanit

Sairaudet

Huumeiden interventiot

CROs by country

CROs in Brazil

Ehdot

Harvinaiset sairaudet

Huumeiden interventiot

Ravintolisät

Sponsori / yhteistyökumppanit

Sijainnit

Tilaa