Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Neste generasjons sekvenseringsdiagnostikk av bakteriemi i sepsis (NextGeneSiS)

17. mai 2022 oppdatert av: Thorsten Brenner, MD, University Hospital Heidelberg

Neste generasjons sekvenseringsdiagnostikk av bakteriemi i sepsis (Neste GeneSiS-forsøk) - Studieprotokoll for en prospektiv, observasjons-, ikke-intervensjonell, multisenter, klinisk studie

Sepsis er fortsatt en stor utfordring, selv i moderne intensivmedisin. Identifiseringen av det forårsakende patogenet er avgjørende for en tidlig optimalisering av det antimikrobielle behandlingsregimet hos pasienter med sepsis. I denne sammenheng kan kulturbaserte diagnostiske prosedyrer (f.eks. blodkulturer) representerer standarden for omsorg, selv om de er forbundet med relevante begrensninger. Derfor kan kulturuavhengige metoder (f.eks. Next-Generation Sequencing (NGS)) ser ut til å være et attraktivt alternativ. Ved identifisering av sirkulerende cellefritt DNA i blodet og bruk av den kvantitative sepsisindikerende kvantifiseringsscore (SIQ), kan forårsakende patogener identifiseres og potensielle forurensninger kan utelukkes.

Målet med den presenterte studien er derfor å vurdere den diagnostiske ytelsen til en NGS-basert tilnærming for påvisning av relevante smittende organismer i en stor kohort av septiske pasienter (n=500). Dessuten vil plausibiliteten til denne NGS-baserte tilnærmingen bli estimert av et panel av uavhengige kliniske spesialister, som retrospektivt identifiserer potensielle endringer i pasientbehandling basert på NGS-resultater.

Studieoversikt

Status

Fullført

Forhold

Intervensjon / Behandling

Detaljert beskrivelse

Sepsis er fortsatt en stor utfordring, selv i moderne intensivmedisin. Identifiseringen av det forårsakende patogenet er avgjørende for en tidlig optimalisering av det antimikrobielle behandlingsregimet hos pasienter med sepsis. I denne sammenheng representerer kulturbaserte diagnostiske prosedyrer (f.eks. blodkulturer) standarden for omsorg, selv om de er forbundet med relevante begrensninger. Følgelig kan kulturuavhengige molekylære diagnostiske prosedyrer være til hjelp for identifisering av det forårsakende patogenet hos infiserte pasienter. Spesielt konseptet med en objektiv sekvensanalyse av sirkulerende cellefritt DNA (cfDNA) fra plasmaprøver av septiske pasienter ved hjelp av neste generasjons sekvensering (NGS) har nylig blitt identifisert for å være en lovende diagnostisk plattform for kritisk syke pasienter som lider av blodbaneinfeksjoner. Selv om denne nye tilnærmingen kan være mer sensitiv og spesifikk enn kulturbaserte toppmoderne teknologier, er ytterligere kliniske studier nødvendig for å nøyaktig definere ytelsen så vel som den kliniske verdien av en NGS-basert tilnærming.

Next GeneSiS er en prospektiv, observasjons, ikke-intervensjonell, multisenterstudie for å vurdere den diagnostiske ytelsen til en NGS-basert tilnærming for påvisning av relevante infiseringsorganismer hos pasienter med mistenkt eller påvist sepsis (i henhold til nyere sepsisdefinisjoner [sepsis-3] ) ved bruk av den kvantitative sepsis-indikerende kvantifikator-score (SIQ) sammenlignet med standard (kulturbaserte) mikrobiologiske tester. I tillegg vil den kliniske verdien av denne NGS-baserte tilnærmingen bli estimert av et panel av uavhengige kliniske spesialister, som retrospektivt identifiserer potensielle endringer i pasientbehandling basert på NGS-resultater. Ytterligere undergruppeanalyser vil fokusere på den kliniske verdien, spesielt for pasienter som lider av svikt i empirisk behandling innen de første tre dagene etter oppstart (vurdert ved (1.) pasientens død eller mangel på bedring av pasientens kliniske tilstand ( i form av en utilstrekkelig reduksjon av SOFA-score) eller (2.) vedvarende høye prokalsitoninnivåer).

Denne prospektive, observerende, ikke-intervensjonelle, multisenterstudiestudien undersøker for første gang ytelsen så vel som den kliniske verdien av en NGS-basert tilnærming for påvisning av bakteriemi hos pasienter med sepsis og kan derfor være et sentralt skritt mot klinisk bruk av NGS i denne indikasjonen.

To sett med blodkulturer (2x aerob / 2x anaerob) vil bli samlet ved studieinkludering (=Start) samt 72 timer etterpå (=72 timer). Parallelt må plasmaprøver for NGS-baserte målinger innhentes som beskrevet tidligere. Ytterligere blodprøver for NGS-baserte målinger kan tas når leger bestiller blodkulturer (2x aerobic / 2x anaerobic) på grunn av den kliniske mistanken om en blodbaneinfeksjon (BSI) innen de første 3 dagene etter studieinkludering. Resultater av mikrobiologisk rutinediagnostikk i prøver som er forskjellige fra blod (f.eks. kroppsvæske, vev, bronkoalveolær lavage, endotrakealt aspirat) vil bli brukt til videre analyser når de er oppnådd innen en tidsramme på ≤72 timer før eller etter tidspunktene for NGS-baserte målinger. Klinisk datainnsamling og (hvis mulig) PCT-målinger vil bli utført ved Onset så vel som 72 timer etter studieinkludering. Den endelige utfallsevalueringen av pasientene vil bli utført etter 28 dager.

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Faktiske)

500

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiesteder

  • Tyskland
      • Aachen, Tyskland, 52074
        • RWTH Aachen University
      • Baden-Baden, Tyskland, 76532
        • Klinikum Mittelbaden Baden-Baden Balg
      • Berlin, Tyskland
        • Charité - Universitätsmedizin Berlin
      • Bielefeld, Tyskland, 33617
        • Evangelisches Krankenhaus Bethel gGmbH
      • Bonn, Tyskland
        • University Hospital Bonn
      • Bremerhaven, Tyskland, 27574
        • Klinikum Bremerhaven Reinkenheide gGmbH
      • Duesseldorf, Tyskland, 40225
        • Duesseldorf University Hospital
      • Essen, Tyskland, 45147
        • University Hospital Essen
      • Frankfurt, Tyskland, 60590
        • University Hospital Frankfurt
      • Göttingen, Tyskland, 37077
        • University Medical Center Göttingen
      • Hannover, Tyskland, 30625
        • Medical School Hannover
      • Heidelberg, Tyskland, 69120
        • University Hospital Heidelberg
      • Heidenheim, Tyskland
        • Kliniken Landkreis Heidenheim gGmbH
      • Köln, Tyskland
        • University Hospital Koln
      • Leipzig, Tyskland
        • University Hospital Leipzig
      • Luckau, Tyskland, 15926
        • Evangelisches Krankenhaus Luckau gGmbH
      • Munich, Tyskland, 81675
        • University Hospital Rechts der Isar
      • Regensburg, Tyskland, 93053
        • University Hospital of Regensburg
      • Rostock, Tyskland, 18057
        • University of Rostock
      • Tübingen, Tyskland, 72076
        • University Hospital Tübingen
      • Ulm, Tyskland, 89081
        • Ulm University Medical Center

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

18 år til 99 år (Voksen, Eldre voksen)

Tar imot friske frivillige

Nei

Kjønn som er kvalifisert for studier

Alle

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Pasienter med sepsis eller septisk sjokk i henhold til de nye sepsisdefinisjonene (Sepsis-3) med debut <24 timer er kvalifisert for studieinkludering.

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

  • Alder ≥18 år
  • Informert samtykke
  • Sepsis (med innsettende ≤24 timer): Pasienter med livstruende organdysfunksjon forårsaket av en dysregulert vertsrespons på en mistenkt eller påvist infeksjon. Organdysfunksjon kan identifiseres som en akutt endring i total SOFA-score ≥2 poeng som følge av infeksjonen. Pasienter kan også umiddelbart identifiseres ved sengekanten med qSOFA, dvs. endring i mental status, systolisk blodtrykk ≤100 mmHg eller respirasjonsfrekvens ≥22/min.
  • eller septisk sjokk (med innsettende ≤24 timer): Pasienter med septisk sjokk kan identifiseres med en klinisk konstruksjon av sepsis med vedvarende hypotensjon som krever vasopressorer for å opprettholde gjennomsnittlig arterielt trykk (MAP) ≥65 mmHg og har et serumlaktatnivå >2mmol/L ( 18 mg/dL) til tross for tilstrekkelig volumgjenoppliving.

Ekskluderingskriterier:

  • Alder ≤18 år
  • Nekter å gi samtykke
  • Pasienten vil sannsynligvis bli utskrevet fra intensivavdelingen innen de første 72 timer etter inkludering
  • Hensikt med lindrende behandling
  • Legen er ikke forpliktet til aggressiv behandling
  • Døden anses forestående og uunngåelig
  • Pasienter som tidligere har vært inkludert, men blir reinnlagt på intensivavdelingen under samme innleggelse, vil ikke bli inkludert en gang til.

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

  • Observasjonsmodeller: Kohort
  • Tidsperspektiver: Potensielle

Kohorter og intervensjoner

Gruppe / Kohort
Intervensjon / Behandling
Sepsis gruppe
Pasienter (n=500) med mistenkt eller påvist sepsis eller septisk sjokk (i henhold til Sepsis-3-definisjonene).
Diagnostisk test: Neste generasjons sekvensering
Hos 500 pasienter med mistenkt eller påvist sepsis eller septisk sjokk (i henhold til Sepsis-3-definisjonene), vil pasientens karakteristika og rutinemessige blodparametere bli bestemt ved sepsisstart samt 72 timer etterpå. På samme tidspunkt vil 2 sett med blodkulturer og ett blodrør for neste generasjons sekvensering (NGS)-diagnostikk bli samlet inn. En evaluering av utfallet vil bli utført 28 dager etter sepsis debut.

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Sensitivitet [%] (av den NGS-baserte SIQ-skåren sammenlignet med blodkulturdiagnostikk, som gullstandarden for identifisering av det forårsakende patogenet i sepsis)
Tidsramme: 2 år
Andel positive som er korrekt identifisert som sådan.
2 år
Spesifisitet [%] (av den NGS-baserte SIQ-skåren sammenlignet med blodkulturdiagnostikk, som gullstandarden for identifisering av det forårsakende patogenet i sepsis)
Tidsramme: 2 år
Andel negativer som er korrekt identifisert som sådan.
2 år
Positiv prediktiv verdi [%] (av den NGS-baserte SIQ-skåren sammenlignet med blodkulturdiagnostikk, som gullstandarden for identifisering av det forårsakende patogenet i sepsis)
Tidsramme: 2 år
Andel positive som er sanne positive.
2 år
Negativ prediktiv verdi [%] (av den NGS-baserte SIQ-skåren sammenlignet med blodkulturdiagnostikk, som gullstandarden for identifisering av det forårsakende patogenet i sepsis)
Tidsramme: 2 år
Andel negative som er sanne negative.
2 år
Cohens kappa-koeffisient [ingen måleenhet; 0</=k</=1] (av den NGS-baserte SIQ-skåren sammenlignet med blodkulturdiagnostikk, som gullstandarden for identifisering av det forårsakende patogenet i sepsis)
Tidsramme: 2 år
Måling av interobservatøravtalen mellom begge elementene.
2 år

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Plausibilitet [%] (av den NGS-baserte SIQ-poengsummen)
Tidsramme: 2,5 år
Ved å bruke en majoritetsregel vil SIQ-score-resultater bli evaluert for plausibilitet av et panel av tre uavhengige kliniske spesialister som ikke er tilknyttet studiestedet. Derfor vil panelet få kliniske saksoppsummeringer, NGS-resultater og standard-of-care-resultater fra alle testede prøver. Resultater av mikrobiologisk rutinediagnostikk i prøver som er forskjellige fra blod (f.eks. kroppsvæske, vev, bronkoalveolær lavage, endotrakealt aspirat) vil inkluderes når de er oppnådd innen en tidsramme på ≤72 timer før eller etter tidspunktene for NGS-baserte målinger.
2,5 år
Endringer i terapi [%] (som kan ha skjedd hvis den NGS-baserte SIQ-skåren hadde vært tilgjengelig for klinisk bruk)
Tidsramme: 2,5 år
Ved å bruke en flertallsregel vil den kliniske verdien av den NGS-baserte tilnærmingen bli estimert av et panel av tre uavhengige kliniske spesialister som ikke er tilknyttet studiestedet, og retrospektivt identifisere potensielle endringer i pasientbehandling basert på NGS-resultater. Derfor vil panelet få kliniske saksoppsummeringer, NGS-resultater og standard-of-care-resultater fra alle testede prøver. Resultater av mikrobiologisk rutinediagnostikk i prøver som er forskjellige fra blod (f.eks. kroppsvæske, vev, bronkoalveolær lavage, endotrakealt aspirat) vil inkluderes når de er oppnådd innen en tidsramme på ≤72 timer før eller etter tidspunktene for NGS-baserte målinger. For å identifisere potensielle endringer i antimikrobiell behandling som kan ha skjedd dersom resultatene fra NGS-teknologien hadde vært tilgjengelig for klinisk bruk, vil panelet få et spesielt spørreskjema.
2,5 år

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Sponsor

University Hospital Heidelberg

Samarbeidspartnere

Fraunhofer Institute for Interfacial Engineering and Biotechnology
Dietmar Hopp Stiftung GmbH

Etterforskere

  • Hovedetterforsker: Thorsten Brenner, MD, University Hospital, Essen

Publikasjoner og nyttige lenker

Den som er ansvarlig for å legge inn informasjon om studien leverer frivillig disse publikasjonene. Disse kan handle om alt relatert til studiet.

Generelle publikasjoner

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

1. mars 2019

Primær fullføring (Faktiske)

31. august 2021

Studiet fullført (Faktiske)

30. september 2021

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

19. november 2017

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

22. november 2017

Først lagt ut (Faktiske)

29. november 2017

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

18. mai 2022

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

17. mai 2022

Sist bekreftet

1. mai 2022

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Nøkkelord

Ytterligere relevante MeSH-vilkår

Andre studie-ID-numre

  • S-084/2017

Plan for individuelle deltakerdata (IPD)

Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?

Nei

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Kliniske studier på Sepsis

Kliniske studier på Neste generasjons sekvensering

Søk i lignende forsøk

Sponsorer og samarbeidspartnere

Medisinsk tilstand

Legemiddelintervensjoner

CROs by country

CROs in Finland

Forhold

Sjeldne sykdommer

Legemiddelintervensjoner

Kosttilskudd

Sponsor / samarbeidspartnere

Steder

Abonnere