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Diagnóstico de secuenciación de próxima generación de bacteriemia en sepsis (NextGeneSiS)

17 de mayo de 2022 actualizado por: Thorsten Brenner, MD, University Hospital Heidelberg

Diagnóstico de secuenciación de próxima generación de bacteriemia en sepsis (Next GeneSiS-Trial): protocolo de estudio para un ensayo clínico prospectivo, observacional, no intervencionista, multicéntrico

La sepsis sigue siendo un desafío importante, incluso en la medicina moderna de cuidados intensivos. La identificación del patógeno causante es crucial para una optimización temprana del régimen de tratamiento antimicrobiano en pacientes con sepsis. En este contexto, los procedimientos de diagnóstico basados ​​en el cultivo (p. hemocultivos) representan el estándar de atención, aunque se asocian con importantes limitaciones. Por lo tanto, los métodos independientes de la cultura (p. La secuenciación de próxima generación (NGS) parece ser una alternativa atractiva. Mediante la identificación del ADN circulante libre de células en la sangre y el uso de la puntuación del cuantificador indicador de sepsis cuantitativa (SIQ), se pueden identificar los patógenos causantes y se pueden excluir posibles contaminaciones.

Por lo tanto, el objetivo del estudio presentado es evaluar el rendimiento diagnóstico de un enfoque basado en NGS para la detección de organismos infecciosos relevantes en una gran cohorte de pacientes sépticos (n = 500). Además, la plausibilidad de este enfoque basado en NGS será estimada por un panel de especialistas clínicos independientes, identificando retrospectivamente cambios potenciales en el manejo de los pacientes en función de los resultados de NGS.

Descripción general del estudio

Estado

Terminado

Condiciones

Intervención / Tratamiento

Descripción detallada

La sepsis sigue siendo un desafío importante, incluso en la medicina moderna de cuidados intensivos. La identificación del patógeno causante es crucial para una optimización temprana del régimen de tratamiento antimicrobiano en pacientes con sepsis. En este contexto, los procedimientos de diagnóstico basados ​​en cultivos (p. ej., hemocultivos) representan el estándar de atención, aunque se asocian con limitaciones importantes. En consecuencia, los procedimientos de diagnóstico molecular independientes del cultivo podrían ser de ayuda para la identificación del patógeno causante en pacientes infectados. Especialmente el concepto de un análisis de secuencia imparcial del ADN circulante libre de células (cfDNA) de muestras de plasma de pacientes sépticos por secuenciación de próxima generación (NGS) se ha identificado recientemente como una plataforma de diagnóstico prometedora para pacientes en estado crítico que sufren de infecciones del torrente sanguíneo. Aunque este nuevo enfoque podría ser más sensible y específico que las tecnologías de última generación basadas en cultivos, se necesitan ensayos clínicos adicionales para definir exactamente el rendimiento y el valor clínico de un enfoque basado en NGS.

Next GeneSiS es un estudio prospectivo, observacional, no intervencionista y multicéntrico para evaluar el rendimiento diagnóstico de un enfoque basado en NGS para la detección de organismos infecciosos relevantes en pacientes con sepsis presunta o comprobada (según las definiciones recientes de sepsis [sepsis-3] ) mediante el uso de la puntuación del cuantificador indicador de sepsis cuantitativa (SIQ) en comparación con las pruebas microbiológicas estándar (basadas en cultivos). Además, el valor clínico de este enfoque basado en NGS será estimado por un panel de especialistas clínicos independientes, identificando retrospectivamente los posibles cambios en el manejo de los pacientes en función de los resultados de NGS. Los análisis de subgrupos adicionales se centrarán en el valor clínico, especialmente para los pacientes que sufren un fracaso del tratamiento empírico dentro de los primeros tres días después del inicio (según lo evaluado por (1.) la muerte del paciente o la falta de mejoría de la condición clínica del paciente ( en términos de una disminución inadecuada de la puntuación SOFA) o (2.) niveles persistentemente altos de procalcitonina).

Este estudio prospectivo, observacional, no intervencionista y multicéntrico investiga por primera vez el rendimiento y el valor clínico de un enfoque basado en NGS para la detección de bacteriemia en pacientes con sepsis y, por lo tanto, puede ser un paso fundamental hacia el uso clínico. de NGS en esta indicación.

Se recolectarán dos conjuntos de hemocultivos (2x aeróbicos / 2x anaeróbicos) al momento de la inclusión en el estudio (=Inicio) y 72 horas después (=72h). Paralelamente, las muestras de plasma para mediciones basadas en NGS deben obtenerse como se describió anteriormente. Se pueden recolectar más muestras de sangre para mediciones basadas en NGS siempre que los médicos soliciten hemocultivos (2x aeróbicos / 2x anaeróbicos) debido a la sospecha clínica de una infección del torrente sanguíneo (BSI) dentro de los primeros 3 días posteriores a la inclusión en el estudio. Resultados de diagnósticos microbiológicos de rutina en muestras distintas de la sangre (p. líquido corporal, tejido, lavado broncoalveolar, aspirado endotraqueal) se utilizarán para análisis posteriores cuando se obtengan dentro de un período de tiempo de ≤72 horas antes o después de los puntos de tiempo para las mediciones basadas en NGS. La recopilación de datos clínicos y (si es posible) las mediciones de PCT se realizarán al inicio y 72 horas después de la inclusión en el estudio. La evaluación del resultado final de los pacientes se realizará a los 28 días.

Tipo de estudio

De observación

Inscripción (Actual)

500

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Ubicaciones de estudio

  • Alemania
      • Aachen, Alemania, 52074
        • RWTH Aachen University
      • Baden-Baden, Alemania, 76532
        • Klinikum Mittelbaden Baden-Baden Balg
      • Berlin, Alemania
        • Charité - Universitätsmedizin Berlin
      • Bielefeld, Alemania, 33617
        • Evangelisches Krankenhaus Bethel gGmbH
      • Bonn, Alemania
        • University Hospital Bonn
      • Bremerhaven, Alemania, 27574
        • Klinikum Bremerhaven Reinkenheide gGmbH
      • Duesseldorf, Alemania, 40225
        • Duesseldorf University Hospital
      • Essen, Alemania, 45147
        • University Hospital Essen
      • Frankfurt, Alemania, 60590
        • University Hospital Frankfurt
      • Göttingen, Alemania, 37077
        • University Medical Center Göttingen
      • Hannover, Alemania, 30625
        • Medical School Hannover
      • Heidelberg, Alemania, 69120
        • University Hospital Heidelberg
      • Heidenheim, Alemania
        • Kliniken Landkreis Heidenheim gGmbH
      • Köln, Alemania
        • University Hospital Koln
      • Leipzig, Alemania
        • University Hospital Leipzig
      • Luckau, Alemania, 15926
        • Evangelisches Krankenhaus Luckau gGmbH
      • Munich, Alemania, 81675
        • University Hospital Rechts der Isar
      • Regensburg, Alemania, 93053
        • University Hospital of Regensburg
      • Rostock, Alemania, 18057
        • University of Rostock
      • Tübingen, Alemania, 72076
        • University Hospital Tübingen
      • Ulm, Alemania, 89081
        • Ulm University Medical Center

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

18 años a 99 años (Adulto, Adulto Mayor)

Acepta Voluntarios Saludables

No

Géneros elegibles para el estudio

Todos

Método de muestreo

Muestra no probabilística

Población de estudio

Los pacientes con sepsis o shock séptico según las nuevas definiciones de sepsis (Sepsis-3) con un inicio <24 horas son elegibles para la inclusión en el estudio.

Descripción

Criterios de inclusión:

  • Edad ≥18 años
  • Consentimiento informado
  • Sepsis (con un inicio ≤24h): Pacientes con una disfunción orgánica potencialmente mortal causada por una respuesta desregulada del huésped a una infección sospechada o comprobada. La disfunción orgánica se puede identificar como un cambio agudo en la puntuación SOFA total ≥2 puntos como consecuencia de la infección. Los pacientes también pueden identificarse rápidamente al lado de la cama con qSOFA, es decir, alteración del estado mental, presión arterial sistólica ≤100 mmHg o frecuencia respiratoria ≥22/min.
  • o Choque séptico (con un inicio ≤24h): Los pacientes con choque séptico pueden identificarse con un constructo clínico de sepsis con hipotensión persistente que requiere vasopresores para mantener la presión arterial media (PAM) ≥65 mmHg y con un nivel de lactato sérico >2mmol/L ( 18 mg/dl) a pesar de la reanimación con volumen adecuado.

Criterio de exclusión:

  • Edad ≤18 años
  • Negativa a dar el consentimiento
  • Es probable que el paciente sea dado de alta de la UCI dentro de las primeras 72 h posteriores a la inclusión
  • Intención de tratamiento paliativo
  • El médico no está comprometido con un tratamiento agresivo.
  • La muerte se considera inminente e inevitable.
  • Los pacientes que habían sido incluidos previamente, pero que son reingresados ​​en la UCI durante la misma hospitalización, no serán incluidos por segunda vez.

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

  • Modelos observacionales: Grupo
  • Perspectivas temporales: Futuro

Cohortes e Intervenciones

Grupo / Cohorte
Intervención / Tratamiento
Grupo de sepsis
Pacientes (n=500) con sospecha o comprobación de sepsis o shock séptico (según las definiciones de Sepsis-3).
Prueba de diagnóstico: Secuenciación de próxima generación
En 500 pacientes con sospecha o confirmación de sepsis o shock séptico (según las definiciones de Sepsis-3), se determinarán las características de los pacientes y los parámetros sanguíneos de rutina al inicio de la sepsis y 72 horas después. En los mismos puntos de tiempo, se recolectarán 2 conjuntos de hemocultivos y un tubo de sangre para diagnósticos de secuenciación de próxima generación (NGS). Se realizará una evaluación del resultado 28 días después del inicio de la sepsis.

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Sensibilidad [%] (de la puntuación SIQ basada en NGS en comparación con el diagnóstico de hemocultivo, como estándar de referencia para la identificación del patógeno causante de la sepsis)
Periodo de tiempo: 2 años
Proporción de positivos que están correctamente identificados como tales.
2 años
Especificidad [%] (de la puntuación SIQ basada en NGS en comparación con el diagnóstico de hemocultivo, como estándar de oro para la identificación del patógeno causante de la sepsis)
Periodo de tiempo: 2 años
Proporción de negativos que están correctamente identificados como tales.
2 años
Valor predictivo positivo [%] (de la puntuación SIQ basada en NGS en comparación con el diagnóstico de hemocultivo, como estándar de oro para la identificación del patógeno causante de la sepsis)
Periodo de tiempo: 2 años
Proporción de positivos que son verdaderos positivos.
2 años
Valor predictivo negativo [%] (de la puntuación SIQ basada en NGS en comparación con el diagnóstico de hemocultivo, como estándar de referencia para la identificación del patógeno causante de la sepsis)
Periodo de tiempo: 2 años
Proporción de negativos que son verdaderos negativos.
2 años
Coeficiente kappa de Cohen [sin unidad de medida; 0</=k</=1] (de la puntuación SIQ basada en NGS en comparación con el diagnóstico de hemocultivo, como estándar de referencia para la identificación del patógeno causante de la sepsis)
Periodo de tiempo: 2 años
Medida de la concordancia interobservador entre ambos ítems.
2 años

Medidas de resultado secundarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Plausibilidad [%] (de la puntuación SIQ basada en NGS)
Periodo de tiempo: 2,5 años
Usando una regla de mayoría, los resultados de la puntuación SIQ serán evaluados por plausibilidad por un panel de tres especialistas clínicos independientes no asociados con el sitio de estudio. Por lo tanto, el panel recibirá resúmenes de casos clínicos, resultados de NGS y resultados de atención estándar de todas las muestras analizadas. Resultados de diagnósticos microbiológicos de rutina en muestras distintas de la sangre (p. líquido corporal, tejido, lavado broncoalveolar, aspirado endotraqueal) se incluirán cuando se hayan obtenido dentro de un período de tiempo de ≤72 horas antes o después de los puntos de tiempo para las mediciones basadas en NGS.
2,5 años
Cambios en la terapia [%] (que pueden haber ocurrido si la puntuación SIQ basada en NGS hubiera estado disponible para uso clínico)
Periodo de tiempo: 2,5 años
Usando una regla mayoritaria, el valor clínico del enfoque basado en NGS será estimado por un panel de tres especialistas clínicos independientes no asociados con el sitio de estudio, identificando retrospectivamente los cambios potenciales en el manejo de los pacientes con base en los resultados de NGS. Por lo tanto, el panel recibirá resúmenes de casos clínicos, resultados de NGS y resultados de atención estándar de todas las muestras analizadas. Resultados de diagnósticos microbiológicos de rutina en muestras distintas de la sangre (p. líquido corporal, tejido, lavado broncoalveolar, aspirado endotraqueal) se incluirán cuando se hayan obtenido dentro de un período de tiempo de ≤72 horas antes o después de los puntos de tiempo para las mediciones basadas en NGS. Para identificar posibles cambios en el manejo de antimicrobianos que podrían haber ocurrido si los resultados de la tecnología NGS hubieran estado disponibles para uso clínico, se proporcionará al panel un cuestionario especial.
2,5 años

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Patrocinador

University Hospital Heidelberg

Colaboradores

Fraunhofer Institute for Interfacial Engineering and Biotechnology
Dietmar Hopp Stiftung GmbH

Investigadores

  • Investigador principal: Thorsten Brenner, MD, University Hospital, Essen

Publicaciones y enlaces útiles

La persona responsable de ingresar información sobre el estudio proporciona voluntariamente estas publicaciones. Estos pueden ser sobre cualquier cosa relacionada con el estudio.

Publicaciones Generales

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Actual)

1 de marzo de 2019

Finalización primaria (Actual)

31 de agosto de 2021

Finalización del estudio (Actual)

30 de septiembre de 2021

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

19 de noviembre de 2017

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

22 de noviembre de 2017

Publicado por primera vez (Actual)

29 de noviembre de 2017

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Actual)

18 de mayo de 2022

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

17 de mayo de 2022

Última verificación

1 de mayo de 2022

Más información

Términos relacionados con este estudio

Palabras clave

Términos MeSH relevantes adicionales

Otros números de identificación del estudio

  • S-084/2017

Plan de datos de participantes individuales (IPD)

¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?

No

Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio

Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.

No

Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.

No

Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .

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