Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

Diagnostyka sekwencjonowania nowej generacji w bakteriemii w sepsie (NextGeneSiS)

17 maja 2022 zaktualizowane przez: Thorsten Brenner, MD, University Hospital Heidelberg

Diagnostyka sekwencjonowania nowej generacji bakteremii w sepsie (Next GeneSiS-Trial) — Protokół badania do prospektywnego, obserwacyjnego, nieinterwencyjnego, wieloośrodkowego badania klinicznego

Sepsa pozostaje poważnym wyzwaniem, nawet we współczesnej medycynie intensywnej terapii. Identyfikacja patogenu sprawczego ma kluczowe znaczenie dla wczesnej optymalizacji schematu leczenia przeciwdrobnoustrojowego u pacjentów z sepsą. W tym kontekście procedury diagnostyczne oparte na hodowli (np. posiewy krwi) stanowią standard postępowania, choć wiążą się z istotnymi ograniczeniami. Dlatego niezależne od kultury metody (np. Sekwencjonowanie nowej generacji (NGS) wydaje się być atrakcyjną alternatywą. Dzięki identyfikacji krążącego wolnego od komórek DNA we krwi i zastosowaniu ilościowego kwantyfikatora wskazującego sepsę (SIQ), można zidentyfikować patogeny i wykluczyć potencjalne zanieczyszczenia.

Celem prezentowanego badania jest zatem ocena skuteczności diagnostycznej podejścia opartego na NGS do wykrywania odpowiednich organizmów infekujących w dużej kohorcie pacjentów z sepsą (n=500). Ponadto wiarygodność tego podejścia opartego na NGS zostanie oceniona przez panel niezależnych specjalistów klinicznych, retrospektywnie identyfikujących potencjalne zmiany w leczeniu pacjentów na podstawie wyników NGS.

Przegląd badań

Szczegółowy opis

Sepsa pozostaje poważnym wyzwaniem, nawet we współczesnej medycynie intensywnej terapii. Identyfikacja patogenu sprawczego ma kluczowe znaczenie dla wczesnej optymalizacji schematu leczenia przeciwdrobnoustrojowego u pacjentów z sepsą. W tym kontekście procedury diagnostyczne oparte na posiewach (np. posiewy krwi) stanowią standard opieki, chociaż wiążą się z istotnymi ograniczeniami. W związku z tym niezależne od kultury procedury diagnostyki molekularnej mogą być pomocne w identyfikacji patogenu sprawczego u zakażonych pacjentów. Zwłaszcza koncepcja bezstronnej analizy sekwencji krążącego wolnego od komórek DNA (cfDNA) z próbek osocza pacjentów z posocznicą za pomocą sekwencjonowania nowej generacji (NGS) została ostatnio zidentyfikowana jako obiecująca platforma diagnostyczna dla krytycznie chorych pacjentów cierpiących na infekcje krwi. Chociaż to nowe podejście może być bardziej czułe i specyficzne niż najnowocześniejsze technologie oparte na kulturze, potrzebne są dodatkowe badania kliniczne, aby dokładnie określić wydajność, a także wartość kliniczną podejścia opartego na NGS.

Next GeneSiS to prospektywne, obserwacyjne, nieinterwencyjne, wieloośrodkowe badanie mające na celu ocenę wydajności diagnostycznej podejścia opartego na NGS do wykrywania odpowiednich organizmów zakaźnych u pacjentów z podejrzeniem lub potwierdzoną sepsą (zgodnie z najnowszymi definicjami sepsy [sepsis-3] ) przy użyciu ilościowego kwantyfikatora wskazującego sepsę (SIQ) w porównaniu ze standardowymi (opartymi na hodowli) testami mikrobiologicznymi. Ponadto wartość kliniczna tego podejścia opartego na NGS zostanie oszacowana przez panel niezależnych specjalistów klinicznych, retrospektywnie identyfikujących potencjalne zmiany w postępowaniu z pacjentami w oparciu o wyniki NGS. Dalsze analizy podgrup skupią się na wartości klinicznej, zwłaszcza dla pacjentów cierpiących na niepowodzenie leczenia empirycznego w ciągu pierwszych trzech dni od wystąpienia (ocenianego jako (1.) śmierć pacjenta lub brak poprawy stanu klinicznego pacjenta ( w postaci niewystarczającego obniżenia wyniku SOFA) lub (2.) utrzymującego się wysokiego poziomu prokalcytoniny).

Ta prospektywna, obserwacyjna, nieinterwencyjna, wieloośrodkowa próba badawcza po raz pierwszy bada wydajność, a także wartość kliniczną podejścia opartego na NGS do wykrywania bakteriemii u pacjentów z posocznicą i dlatego może być kluczowym krokiem w kierunku zastosowania klinicznego NGS w tym wskazaniu.

Dwa zestawy posiewów krwi (2x tlenowe / 2x beztlenowe) zostaną pobrane w momencie włączenia do badania (= początek), jak również 72 godziny później (= 72 godz.). Równolegle należy pobrać próbki osocza do pomiarów opartych na NGS, jak opisano wcześniej. Dalsze próbki krwi do pomiarów opartych na NGS można pobrać zawsze, gdy lekarze zlecą posiew krwi (2x tlenowe / 2x beztlenowe) z powodu klinicznego podejrzenia zakażenia krwi (BSI) w ciągu pierwszych 3 dni po włączeniu do badania. Wyniki rutynowej diagnostyki mikrobiologicznej w próbkach innych niż krew (np. płyn ustrojowy, tkanka, popłuczyny oskrzelowo-pęcherzykowe, aspirat z tchawicy) zostaną wykorzystane do dalszych analiz, jeżeli zostaną uzyskane w przedziale czasowym ≤72 godzin przed lub po punktach czasowych dla pomiarów opartych na NGS. Gromadzenie danych klinicznych i (jeśli to możliwe) pomiary PCT zostaną przeprowadzone na początku, jak również po 72 godzinach od włączenia do badania. Ostateczna ocena wyników pacjentów zostanie przeprowadzona po 28 dniach.

Typ studiów

Obserwacyjny

Zapisy (Rzeczywisty)

500

Kontakty i lokalizacje

Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.

Lokalizacje studiów

      • Aachen, Niemcy, 52074
        • RWTH Aachen University
      • Baden-Baden, Niemcy, 76532
        • Klinikum Mittelbaden Baden-Baden Balg
      • Berlin, Niemcy
        • Charité - Universitätsmedizin Berlin
      • Bielefeld, Niemcy, 33617
        • Evangelisches Krankenhaus Bethel gGmbH
      • Bonn, Niemcy
        • University Hospital Bonn
      • Bremerhaven, Niemcy, 27574
        • Klinikum Bremerhaven Reinkenheide gGmbH
      • Duesseldorf, Niemcy, 40225
        • Duesseldorf University Hospital
      • Essen, Niemcy, 45147
        • University Hospital Essen
      • Frankfurt, Niemcy, 60590
        • University Hospital Frankfurt
      • Göttingen, Niemcy, 37077
        • University Medical Center Göttingen
      • Hannover, Niemcy, 30625
        • Medical School Hannover
      • Heidelberg, Niemcy, 69120
        • University Hospital Heidelberg
      • Heidenheim, Niemcy
        • Kliniken Landkreis Heidenheim gGmbH
      • Köln, Niemcy
        • University Hospital Koln
      • Leipzig, Niemcy
        • University Hospital Leipzig
      • Luckau, Niemcy, 15926
        • Evangelisches Krankenhaus Luckau gGmbH
      • Munich, Niemcy, 81675
        • University Hospital Rechts der Isar
      • Regensburg, Niemcy, 93053
        • University Hospital of Regensburg
      • Rostock, Niemcy, 18057
        • University of Rostock
      • Tübingen, Niemcy, 72076
        • University Hospital Tübingen
      • Ulm, Niemcy, 89081
        • Ulm University Medical Center

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

18 lat do 99 lat (Dorosły, Starszy dorosły)

Akceptuje zdrowych ochotników

Nie

Płeć kwalifikująca się do nauki

Wszystko

Metoda próbkowania

Próbka bez prawdopodobieństwa

Badana populacja

Pacjenci z posocznicą lub wstrząsem septycznym zgodnie z nowymi definicjami sepsy (Sepsis-3) z początkiem <24 godzin kwalifikują się do włączenia do badania.

Opis

Kryteria przyjęcia:

  • Wiek ≥18 lat
  • Świadoma zgoda
  • Sepsa (z początkiem ≤24h): Pacjenci z zagrażającą życiu dysfunkcją narządów spowodowaną rozregulowaną odpowiedzią gospodarza na podejrzewaną lub potwierdzoną infekcję. Dysfunkcję narządu można zidentyfikować jako ostrą zmianę całkowitego wyniku SOFA ≥2 punkty w następstwie zakażenia. Pacjentów można również szybko zidentyfikować przy łóżku pacjenta za pomocą qSOFA, tj. zmiany stanu psychicznego, skurczowego ciśnienia krwi ≤100 mmHg lub częstości oddechów ≥22/min.
  • lub Wstrząs septyczny (rozpoczynający się ≤24h): Pacjentów ze wstrząsem septycznym można zidentyfikować jako kliniczną postać posocznicy z utrzymującym się niedociśnieniem wymagającym podania leków wazopresyjnych w celu utrzymania średniego ciśnienia tętniczego (MAP) ≥65 mmHg i ze stężeniem mleczanów w surowicy >2 mmol/l ( 18 mg/dl) pomimo odpowiedniej resuscytacji objętościowej.

Kryteria wyłączenia:

  • Wiek ≤18 lat
  • Odmowa wyrażenia zgody
  • Pacjent prawdopodobnie zostanie wypisany z OIOM w ciągu pierwszych 72 godzin po włączeniu
  • Intencja leczenia paliatywnego
  • Klinicysta nie jest zobowiązana do agresywnego leczenia
  • Śmierć uważana jest za nieuchronną i nieuniknioną
  • Pacjenci, którzy byli wcześniej włączeni, ale są ponownie przyjmowani na OIT podczas tej samej hospitalizacji, nie będą włączani po raz drugi.

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

  • Modele obserwacyjne: Kohorta
  • Perspektywy czasowe: Spodziewany

Kohorty i interwencje

Grupa / Kohorta
Interwencja / Leczenie
Grupa Sepsa
Pacjenci (n=500) z podejrzeniem lub potwierdzoną sepsą lub wstrząsem septycznym (zgodnie z definicjami Sepsis-3).
U 500 pacjentów z podejrzeniem lub potwierdzoną posocznicą lub wstrząsem septycznym (zgodnie z definicjami Sepsis-3) charakterystyka pacjentów i rutynowe parametry krwi zostaną określone na początku sepsy, jak również 72 godziny po jej zakończeniu. W tych samych punktach czasowych zostaną pobrane 2 zestawy posiewów krwi i jedna probówka do diagnostyki sekwencjonowania nowej generacji (NGS). Ocena wyniku zostanie przeprowadzona 28 dni po wystąpieniu sepsy.

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Czułość [%] (wskaźnika SIQ opartego na NGS w porównaniu z diagnostyką posiewów krwi, jako złoty standard identyfikacji patogenu wywołującego sepsę)
Ramy czasowe: 2 lata
Odsetek pozytywów, które zostały prawidłowo zidentyfikowane jako takie.
2 lata
Swoistość [%] (wynik SIQ oparty na NGS w porównaniu z diagnostyką posiewów krwi, jako złoty standard identyfikacji patogenu sprawczego w sepsie)
Ramy czasowe: 2 lata
Odsetek negatywów, które zostały poprawnie zidentyfikowane jako takie.
2 lata
Dodatnia wartość predykcyjna [%] (wynik SIQ oparty na NGS w porównaniu z diagnostyką posiewu krwi, jako złoty standard identyfikacji patogenu wywołującego sepsę)
Ramy czasowe: 2 lata
Odsetek wyników dodatnich, które są prawdziwie dodatnie.
2 lata
Ujemna wartość predykcyjna [%] (wskaźnika SIQ opartego na NGS w porównaniu z diagnostyką posiewów krwi, jako złoty standard identyfikacji patogenu wywołującego sepsę)
Ramy czasowe: 2 lata
Odsetek negatywów, które są prawdziwie ujemne.
2 lata
Współczynnik kappa Cohena [brak jednostki miary; 0</=k</=1] (wynik SIQ oparty na NGS w porównaniu z diagnostyką posiewów krwi, jako złoty standard identyfikacji patogenu wywołującego sepsę)
Ramy czasowe: 2 lata
Pomiar zgodności między obserwatorami między obiema pozycjami.
2 lata

Miary wyników drugorzędnych

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Wiarygodność [%] (wyniku SIQ opartego na NGS)
Ramy czasowe: 2,5 roku
Stosując zasadę większości, wyniki SIQ-score zostaną ocenione pod kątem wiarygodności przez zespół trzech niezależnych specjalistów klinicznych niezwiązanych z ośrodkiem badawczym. W związku z tym panel otrzyma podsumowania przypadków klinicznych, wyniki NGS i wyniki standardowej opieki ze wszystkich badanych próbek. Wyniki rutynowej diagnostyki mikrobiologicznej w próbkach innych niż krew (np. płyn ustrojowy, tkanka, popłuczyny oskrzelowo-pęcherzykowe, aspirat z tchawicy) zostaną uwzględnione, jeżeli zostały uzyskane w przedziale czasowym ≤72 godzin przed lub po punktach czasowych dla pomiarów opartych na NGS.
2,5 roku
Zmiany w terapii [%] (które mogły wystąpić, gdyby wynik SIQ oparty na NGS był dostępny do użytku klinicznego)
Ramy czasowe: 2,5 roku
Stosując zasadę większości, kliniczna wartość podejścia opartego na NGS zostanie oszacowana przez zespół trzech niezależnych specjalistów klinicznych niezwiązanych z ośrodkiem badawczym, retrospektywnie identyfikujących potencjalne zmiany w leczeniu pacjentów na podstawie wyników NGS. W związku z tym panel otrzyma podsumowania przypadków klinicznych, wyniki NGS i wyniki standardowej opieki ze wszystkich badanych próbek. Wyniki rutynowej diagnostyki mikrobiologicznej w próbkach innych niż krew (np. płyn ustrojowy, tkanka, popłuczyny oskrzelowo-pęcherzykowe, aspirat z tchawicy) zostaną uwzględnione, jeżeli zostały uzyskane w przedziale czasowym ≤72 godzin przed lub po punktach czasowych dla pomiarów opartych na NGS. Aby zidentyfikować potencjalne zmiany w postępowaniu przeciwdrobnoustrojowym, które mogłyby zajść, gdyby wyniki technologii NGS były dostępne do użytku klinicznego, panel otrzyma specjalny kwestionariusz.
2,5 roku

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Śledczy

  • Główny śledczy: Thorsten Brenner, MD, University Hospital, Essen

Publikacje i pomocne linki

Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)

1 marca 2019

Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)

31 sierpnia 2021

Ukończenie studiów (Rzeczywisty)

30 września 2021

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

19 listopada 2017

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

22 listopada 2017

Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)

29 listopada 2017

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)

18 maja 2022

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

17 maja 2022

Ostatnia weryfikacja

1 maja 2022

Więcej informacji

Terminy związane z tym badaniem

Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)

Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?

Nie

Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze

Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

Badania kliniczne na Posocznica

Badania kliniczne na Sekwencjonowanie nowej generacji

Subskrybuj