- ICH GCP
- Rejestr badań klinicznych w USA
- Badanie kliniczne NCT03356249
Diagnostyka sekwencjonowania nowej generacji w bakteriemii w sepsie (NextGeneSiS)
Diagnostyka sekwencjonowania nowej generacji bakteremii w sepsie (Next GeneSiS-Trial) — Protokół badania do prospektywnego, obserwacyjnego, nieinterwencyjnego, wieloośrodkowego badania klinicznego
Sepsa pozostaje poważnym wyzwaniem, nawet we współczesnej medycynie intensywnej terapii. Identyfikacja patogenu sprawczego ma kluczowe znaczenie dla wczesnej optymalizacji schematu leczenia przeciwdrobnoustrojowego u pacjentów z sepsą. W tym kontekście procedury diagnostyczne oparte na hodowli (np. posiewy krwi) stanowią standard postępowania, choć wiążą się z istotnymi ograniczeniami. Dlatego niezależne od kultury metody (np. Sekwencjonowanie nowej generacji (NGS) wydaje się być atrakcyjną alternatywą. Dzięki identyfikacji krążącego wolnego od komórek DNA we krwi i zastosowaniu ilościowego kwantyfikatora wskazującego sepsę (SIQ), można zidentyfikować patogeny i wykluczyć potencjalne zanieczyszczenia.
Celem prezentowanego badania jest zatem ocena skuteczności diagnostycznej podejścia opartego na NGS do wykrywania odpowiednich organizmów infekujących w dużej kohorcie pacjentów z sepsą (n=500). Ponadto wiarygodność tego podejścia opartego na NGS zostanie oceniona przez panel niezależnych specjalistów klinicznych, retrospektywnie identyfikujących potencjalne zmiany w leczeniu pacjentów na podstawie wyników NGS.
Przegląd badań
Status
Warunki
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Sepsa pozostaje poważnym wyzwaniem, nawet we współczesnej medycynie intensywnej terapii. Identyfikacja patogenu sprawczego ma kluczowe znaczenie dla wczesnej optymalizacji schematu leczenia przeciwdrobnoustrojowego u pacjentów z sepsą. W tym kontekście procedury diagnostyczne oparte na posiewach (np. posiewy krwi) stanowią standard opieki, chociaż wiążą się z istotnymi ograniczeniami. W związku z tym niezależne od kultury procedury diagnostyki molekularnej mogą być pomocne w identyfikacji patogenu sprawczego u zakażonych pacjentów. Zwłaszcza koncepcja bezstronnej analizy sekwencji krążącego wolnego od komórek DNA (cfDNA) z próbek osocza pacjentów z posocznicą za pomocą sekwencjonowania nowej generacji (NGS) została ostatnio zidentyfikowana jako obiecująca platforma diagnostyczna dla krytycznie chorych pacjentów cierpiących na infekcje krwi. Chociaż to nowe podejście może być bardziej czułe i specyficzne niż najnowocześniejsze technologie oparte na kulturze, potrzebne są dodatkowe badania kliniczne, aby dokładnie określić wydajność, a także wartość kliniczną podejścia opartego na NGS.
Next GeneSiS to prospektywne, obserwacyjne, nieinterwencyjne, wieloośrodkowe badanie mające na celu ocenę wydajności diagnostycznej podejścia opartego na NGS do wykrywania odpowiednich organizmów zakaźnych u pacjentów z podejrzeniem lub potwierdzoną sepsą (zgodnie z najnowszymi definicjami sepsy [sepsis-3] ) przy użyciu ilościowego kwantyfikatora wskazującego sepsę (SIQ) w porównaniu ze standardowymi (opartymi na hodowli) testami mikrobiologicznymi. Ponadto wartość kliniczna tego podejścia opartego na NGS zostanie oszacowana przez panel niezależnych specjalistów klinicznych, retrospektywnie identyfikujących potencjalne zmiany w postępowaniu z pacjentami w oparciu o wyniki NGS. Dalsze analizy podgrup skupią się na wartości klinicznej, zwłaszcza dla pacjentów cierpiących na niepowodzenie leczenia empirycznego w ciągu pierwszych trzech dni od wystąpienia (ocenianego jako (1.) śmierć pacjenta lub brak poprawy stanu klinicznego pacjenta ( w postaci niewystarczającego obniżenia wyniku SOFA) lub (2.) utrzymującego się wysokiego poziomu prokalcytoniny).
Ta prospektywna, obserwacyjna, nieinterwencyjna, wieloośrodkowa próba badawcza po raz pierwszy bada wydajność, a także wartość kliniczną podejścia opartego na NGS do wykrywania bakteriemii u pacjentów z posocznicą i dlatego może być kluczowym krokiem w kierunku zastosowania klinicznego NGS w tym wskazaniu.
Dwa zestawy posiewów krwi (2x tlenowe / 2x beztlenowe) zostaną pobrane w momencie włączenia do badania (= początek), jak również 72 godziny później (= 72 godz.). Równolegle należy pobrać próbki osocza do pomiarów opartych na NGS, jak opisano wcześniej. Dalsze próbki krwi do pomiarów opartych na NGS można pobrać zawsze, gdy lekarze zlecą posiew krwi (2x tlenowe / 2x beztlenowe) z powodu klinicznego podejrzenia zakażenia krwi (BSI) w ciągu pierwszych 3 dni po włączeniu do badania. Wyniki rutynowej diagnostyki mikrobiologicznej w próbkach innych niż krew (np. płyn ustrojowy, tkanka, popłuczyny oskrzelowo-pęcherzykowe, aspirat z tchawicy) zostaną wykorzystane do dalszych analiz, jeżeli zostaną uzyskane w przedziale czasowym ≤72 godzin przed lub po punktach czasowych dla pomiarów opartych na NGS. Gromadzenie danych klinicznych i (jeśli to możliwe) pomiary PCT zostaną przeprowadzone na początku, jak również po 72 godzinach od włączenia do badania. Ostateczna ocena wyników pacjentów zostanie przeprowadzona po 28 dniach.
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
-
Aachen, Niemcy, 52074
- RWTH Aachen University
-
Baden-Baden, Niemcy, 76532
- Klinikum Mittelbaden Baden-Baden Balg
-
Berlin, Niemcy
- Charité - Universitätsmedizin Berlin
-
Bielefeld, Niemcy, 33617
- Evangelisches Krankenhaus Bethel gGmbH
-
Bonn, Niemcy
- University Hospital Bonn
-
Bremerhaven, Niemcy, 27574
- Klinikum Bremerhaven Reinkenheide gGmbH
-
Duesseldorf, Niemcy, 40225
- Duesseldorf University Hospital
-
Essen, Niemcy, 45147
- University Hospital Essen
-
Frankfurt, Niemcy, 60590
- University Hospital Frankfurt
-
Göttingen, Niemcy, 37077
- University Medical Center Göttingen
-
Hannover, Niemcy, 30625
- Medical School Hannover
-
Heidelberg, Niemcy, 69120
- University Hospital Heidelberg
-
Heidenheim, Niemcy
- Kliniken Landkreis Heidenheim gGmbH
-
Köln, Niemcy
- University Hospital Koln
-
Leipzig, Niemcy
- University Hospital Leipzig
-
Luckau, Niemcy, 15926
- Evangelisches Krankenhaus Luckau gGmbH
-
Munich, Niemcy, 81675
- University Hospital Rechts der Isar
-
Regensburg, Niemcy, 93053
- University Hospital of Regensburg
-
Rostock, Niemcy, 18057
- University of Rostock
-
Tübingen, Niemcy, 72076
- University Hospital Tübingen
-
Ulm, Niemcy, 89081
- Ulm University Medical Center
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Płeć kwalifikująca się do nauki
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Wiek ≥18 lat
- Świadoma zgoda
- Sepsa (z początkiem ≤24h): Pacjenci z zagrażającą życiu dysfunkcją narządów spowodowaną rozregulowaną odpowiedzią gospodarza na podejrzewaną lub potwierdzoną infekcję. Dysfunkcję narządu można zidentyfikować jako ostrą zmianę całkowitego wyniku SOFA ≥2 punkty w następstwie zakażenia. Pacjentów można również szybko zidentyfikować przy łóżku pacjenta za pomocą qSOFA, tj. zmiany stanu psychicznego, skurczowego ciśnienia krwi ≤100 mmHg lub częstości oddechów ≥22/min.
- lub Wstrząs septyczny (rozpoczynający się ≤24h): Pacjentów ze wstrząsem septycznym można zidentyfikować jako kliniczną postać posocznicy z utrzymującym się niedociśnieniem wymagającym podania leków wazopresyjnych w celu utrzymania średniego ciśnienia tętniczego (MAP) ≥65 mmHg i ze stężeniem mleczanów w surowicy >2 mmol/l ( 18 mg/dl) pomimo odpowiedniej resuscytacji objętościowej.
Kryteria wyłączenia:
- Wiek ≤18 lat
- Odmowa wyrażenia zgody
- Pacjent prawdopodobnie zostanie wypisany z OIOM w ciągu pierwszych 72 godzin po włączeniu
- Intencja leczenia paliatywnego
- Klinicysta nie jest zobowiązana do agresywnego leczenia
- Śmierć uważana jest za nieuchronną i nieuniknioną
- Pacjenci, którzy byli wcześniej włączeni, ale są ponownie przyjmowani na OIT podczas tej samej hospitalizacji, nie będą włączani po raz drugi.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Modele obserwacyjne: Kohorta
- Perspektywy czasowe: Spodziewany
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Grupa Sepsa
Pacjenci (n=500) z podejrzeniem lub potwierdzoną sepsą lub wstrząsem septycznym (zgodnie z definicjami Sepsis-3).
|
U 500 pacjentów z podejrzeniem lub potwierdzoną posocznicą lub wstrząsem septycznym (zgodnie z definicjami Sepsis-3) charakterystyka pacjentów i rutynowe parametry krwi zostaną określone na początku sepsy, jak również 72 godziny po jej zakończeniu.
W tych samych punktach czasowych zostaną pobrane 2 zestawy posiewów krwi i jedna probówka do diagnostyki sekwencjonowania nowej generacji (NGS).
Ocena wyniku zostanie przeprowadzona 28 dni po wystąpieniu sepsy.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Czułość [%] (wskaźnika SIQ opartego na NGS w porównaniu z diagnostyką posiewów krwi, jako złoty standard identyfikacji patogenu wywołującego sepsę)
Ramy czasowe: 2 lata
|
Odsetek pozytywów, które zostały prawidłowo zidentyfikowane jako takie.
|
2 lata
|
|
Swoistość [%] (wynik SIQ oparty na NGS w porównaniu z diagnostyką posiewów krwi, jako złoty standard identyfikacji patogenu sprawczego w sepsie)
Ramy czasowe: 2 lata
|
Odsetek negatywów, które zostały poprawnie zidentyfikowane jako takie.
|
2 lata
|
|
Dodatnia wartość predykcyjna [%] (wynik SIQ oparty na NGS w porównaniu z diagnostyką posiewu krwi, jako złoty standard identyfikacji patogenu wywołującego sepsę)
Ramy czasowe: 2 lata
|
Odsetek wyników dodatnich, które są prawdziwie dodatnie.
|
2 lata
|
|
Ujemna wartość predykcyjna [%] (wskaźnika SIQ opartego na NGS w porównaniu z diagnostyką posiewów krwi, jako złoty standard identyfikacji patogenu wywołującego sepsę)
Ramy czasowe: 2 lata
|
Odsetek negatywów, które są prawdziwie ujemne.
|
2 lata
|
|
Współczynnik kappa Cohena [brak jednostki miary; 0</=k</=1] (wynik SIQ oparty na NGS w porównaniu z diagnostyką posiewów krwi, jako złoty standard identyfikacji patogenu wywołującego sepsę)
Ramy czasowe: 2 lata
|
Pomiar zgodności między obserwatorami między obiema pozycjami.
|
2 lata
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Wiarygodność [%] (wyniku SIQ opartego na NGS)
Ramy czasowe: 2,5 roku
|
Stosując zasadę większości, wyniki SIQ-score zostaną ocenione pod kątem wiarygodności przez zespół trzech niezależnych specjalistów klinicznych niezwiązanych z ośrodkiem badawczym.
W związku z tym panel otrzyma podsumowania przypadków klinicznych, wyniki NGS i wyniki standardowej opieki ze wszystkich badanych próbek.
Wyniki rutynowej diagnostyki mikrobiologicznej w próbkach innych niż krew (np.
płyn ustrojowy, tkanka, popłuczyny oskrzelowo-pęcherzykowe, aspirat z tchawicy) zostaną uwzględnione, jeżeli zostały uzyskane w przedziale czasowym ≤72 godzin przed lub po punktach czasowych dla pomiarów opartych na NGS.
|
2,5 roku
|
|
Zmiany w terapii [%] (które mogły wystąpić, gdyby wynik SIQ oparty na NGS był dostępny do użytku klinicznego)
Ramy czasowe: 2,5 roku
|
Stosując zasadę większości, kliniczna wartość podejścia opartego na NGS zostanie oszacowana przez zespół trzech niezależnych specjalistów klinicznych niezwiązanych z ośrodkiem badawczym, retrospektywnie identyfikujących potencjalne zmiany w leczeniu pacjentów na podstawie wyników NGS.
W związku z tym panel otrzyma podsumowania przypadków klinicznych, wyniki NGS i wyniki standardowej opieki ze wszystkich badanych próbek.
Wyniki rutynowej diagnostyki mikrobiologicznej w próbkach innych niż krew (np.
płyn ustrojowy, tkanka, popłuczyny oskrzelowo-pęcherzykowe, aspirat z tchawicy) zostaną uwzględnione, jeżeli zostały uzyskane w przedziale czasowym ≤72 godzin przed lub po punktach czasowych dla pomiarów opartych na NGS.
Aby zidentyfikować potencjalne zmiany w postępowaniu przeciwdrobnoustrojowym, które mogłyby zajść, gdyby wyniki technologii NGS były dostępne do użytku klinicznego, panel otrzyma specjalny kwestionariusz.
|
2,5 roku
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Współpracownicy
Śledczy
- Główny śledczy: Thorsten Brenner, MD, University Hospital, Essen
Publikacje i pomocne linki
Publikacje ogólne
- Decker SO, Sigl A, Grumaz C, Stevens P, Vainshtein Y, Zimmermann S, Weigand MA, Hofer S, Sohn K, Brenner T. Immune-Response Patterns and Next Generation Sequencing Diagnostics for the Detection of Mycoses in Patients with Septic Shock-Results of a Combined Clinical and Experimental Investigation. Int J Mol Sci. 2017 Aug 18;18(8):1796. doi: 10.3390/ijms18081796.
- Grumaz S, Stevens P, Grumaz C, Decker SO, Weigand MA, Hofer S, Brenner T, von Haeseler A, Sohn K. Next-generation sequencing diagnostics of bacteremia in septic patients. Genome Med. 2016 Jul 1;8(1):73. doi: 10.1186/s13073-016-0326-8.
- Brenner T, Decker SO, Grumaz S, Stevens P, Bruckner T, Schmoch T, Pletz MW, Bracht H, Hofer S, Marx G, Weigand MA, Sohn K; TIFOnet Critical Care Trials Group. Next-generation sequencing diagnostics of bacteremia in sepsis (Next GeneSiS-Trial): Study protocol of a prospective, observational, noninterventional, multicenter, clinical trial. Medicine (Baltimore). 2018 Feb;97(6):e9868. doi: 10.1097/MD.0000000000009868.
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- S-084/2017
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .
Badania kliniczne na Posocznica
-
Drugs for Neglected DiseasesUniversiteit Antwerpen; PENTA Foundation; St George's, University of LondonZakończonySEPSIS noworodkówBangladesz, Uganda, Tajlandia, Afryka Południowa, Włochy, Grecja, Indie, Brazylia, Chiny, Kenia, Wietnam
-
Assiut UniversityNieznany
-
Assiut UniversityNieznany
-
London School of Hygiene and Tropical MedicineZakończonySEPSIS noworodkówBurkina Faso, Gambia
-
Stephanie BjerrumRigshospitalet, Denmark; University of Copenhagen; University of Ghana; Korle-Bu...Zakończony
-
Drugs for Neglected DiseasesUniversity of Oxford; KEMRI-Wellcome Trust Collaborative Research ProgramZakończonySEPSIS noworodkówKenia
-
Gehad AbdelnaserAssiut UniversityNieznany
-
Ahmed Mahmoud Ali Ali YoussefZakończony
-
Assiut UniversityNieznany
-
Franciscus GasthuisErasmus Medical CenterZakończonyZakażenie noworodków | SEPSIS noworodkówHolandia
Badania kliniczne na Sekwencjonowanie nowej generacji
-
Gedea Biotech ABZakończonyKandydoza sromu i pochwySzwecja
-
Ascensia Diabetes CareZakończony
-
Ascensia Diabetes CareZakończonyCukrzycaStany Zjednoczone
-
Bionos Biotech S.L.Aktywny, nie rekrutującyKobieta Wzór Wypadanie Włosów | Wypadanie włosów | Pielęgnacja włosówHiszpania
-
Smith & Nephew, Inc.ZakończonyArtretyzm | Reumatyzm | Martwica jałowa | Wspólna niestabilność | Pęknięcie | Ból, ramię | Artretyzm, Zwyrodnienie | Pourazowa choroba zwyrodnieniowa innych stawów, okolica barku | Zespół stożka rotatorów barku i zaburzenia pokrewne | Uraz stawów | Zwichnięcie, ramięStany Zjednoczone
-
Baylor Research InstituteZakończonyCukrzyca | Cukrzyca | Glukoza, Niski poziom krwi | Glukoza, Wysoka KrewStany Zjednoczone
-
Becton, Dickinson and CompanyZakończonyCukrzyca typu 2 | Cukrzyca typu 1Stany Zjednoczone, Kanada
-
Next Science TMDoctors Research Network; Tissue Analytics; NTS VenturesNieznanyGrzybica paznokciStany Zjednoczone
-
University of NottinghamAstraZenecaRekrutacyjnyPrzewlekła obturacyjna choroba płuc | AstmaZjednoczone Królestwo
-
Centre Hospitalier National d'Ophtalmologie des...APHP; Fondation ARSEPNieznanyStwardnienie rozsiane | Zapalenie nerwu wzrokowegoFrancja