Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Секвенирование нового поколения для диагностики бактериемии при сепсисе (NextGeneSiS)

17 мая 2022 г. обновлено: Thorsten Brenner, MD, University Hospital Heidelberg

Секвенирование следующего поколения для диагностики бактериемии при сепсисе (Next GeneSiS-Trial) — протокол исследования для проспективного, обсервационного, неинтервенционного, многоцентрового, клинического исследования

Сепсис остается серьезной проблемой даже в современной интенсивной терапии. Идентификация возбудителя имеет решающее значение для ранней оптимизации режима антимикробной терапии больных с сепсисом. В этом контексте диагностические процедуры на основе культуры (например, посев крови) представляют собой стандарт медицинской помощи, хотя они связаны с соответствующими ограничениями. Таким образом, независимые от культуры методы (например, Секвенирование следующего поколения (NGS) кажется привлекательной альтернативой. Путем идентификации циркулирующей внеклеточной ДНК в крови и использования количественных показателей сепсиса, указывающих на количественный показатель (SIQ), можно идентифицировать вызывающие патогены и исключить потенциальное заражение.

Таким образом, цель представленного исследования состоит в том, чтобы оценить диагностическую эффективность подхода на основе NGS для обнаружения соответствующих инфекционных организмов в большой группе пациентов с сепсисом (n = 500). Кроме того, правдоподобие этого подхода на основе NGS будет оцениваться группой независимых клинических специалистов, ретроспективно определяющих потенциальные изменения в лечении пациентов на основе результатов NGS.

Обзор исследования

Статус

Завершенный

Условия

Вмешательство/лечение

Подробное описание

Сепсис остается серьезной проблемой даже в современной интенсивной терапии. Идентификация возбудителя имеет решающее значение для ранней оптимизации режима антимикробной терапии больных с сепсисом. В этом контексте диагностические процедуры на основе посева (например, посев крови) представляют собой стандарт медицинской помощи, хотя они связаны с соответствующими ограничениями. Соответственно, независимые от культуры методы молекулярной диагностики могут помочь в идентификации возбудителя у инфицированных пациентов. В частности, концепция беспристрастного анализа последовательности циркулирующей внеклеточной ДНК (вкДНК) из образцов плазмы пациентов с сепсисом с помощью секвенирования нового поколения (NGS) недавно была определена как многообещающая диагностическая платформа для пациентов в критическом состоянии, страдающих инфекциями кровотока. Хотя этот новый подход может быть более чувствительным и специфичным, чем современные технологии, основанные на культуре, необходимы дополнительные клинические испытания, чтобы точно определить эффективность, а также клиническую ценность подхода, основанного на NGS.

Next GeneSiS — это проспективное обсервационное неинтервенционное многоцентровое исследование для оценки диагностической эффективности подхода на основе NGS для обнаружения соответствующих инфекционных организмов у пациентов с подозрением или подтвержденным сепсисом (в соответствии с последними определениями сепсиса [сепсис-3]). ) с помощью количественного количественного показателя сепсиса (SIQ) по сравнению со стандартными (культуральными) микробиологическими тестами. Кроме того, клиническая ценность этого подхода на основе NGS будет оцениваться группой независимых клинических специалистов, ретроспективно определяющих потенциальные изменения в лечении пациентов на основе результатов NGS. Дальнейший анализ подгрупп будет сосредоточен на клинической ценности, особенно для пациентов, страдающих от неэффективности эмпирического лечения в течение первых трех дней после начала заболевания (по оценке (1.) смерти пациента или отсутствия улучшения клинического состояния пациента ( с точки зрения неадекватного снижения оценки по шкале SOFA) или (2.) стойкого высокого уровня прокальцитонина).

Это проспективное обсервационное неинтервенционное многоцентровое исследование впервые исследует эффективность, а также клиническую ценность метода NGS для выявления бактериемии у пациентов с сепсисом и, следовательно, может стать поворотным шагом на пути к клиническому применению. NGS в этом показании.

Два набора культур крови (2x аэробные / 2x анаэробные) будут собраны при включении исследования (= начало), а также через 72 часа после него (= 72 часа). Параллельно необходимо получить образцы плазмы для измерений на основе NGS, как описано ранее. Дополнительные образцы крови для измерений на основе NGS можно собирать каждый раз, когда врачи назначают посев крови (2x аэробный / 2x анаэробный) из-за клинического подозрения на инфекцию кровотока (BSI) в течение первых 3 дней после включения в исследование. Результаты рутинной микробиологической диагностики образцов, отличных от крови (например, жидкости организма, ткани, бронхоальвеолярный лаваж, эндотрахеальный аспират) будут использоваться для дальнейших анализов, если они будут получены в течение ≤72 часов до или после временных точек для измерений на основе NGS. Сбор клинических данных и (если возможно) измерения ПКТ будут проводиться в начале, а также через 72 часа после включения в исследование. Окончательная оценка результатов лечения пациентов будет проводиться через 28 дней.

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Действительный)

500

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Места учебы

  • Германия
      • Aachen, Германия, 52074
        • RWTH Aachen University
      • Baden-Baden, Германия, 76532
        • Klinikum Mittelbaden Baden-Baden Balg
      • Berlin, Германия
        • Charite - Universitätsmedizin Berlin
      • Bielefeld, Германия, 33617
        • Evangelisches Krankenhaus Bethel gGmbH
      • Bonn, Германия
        • University Hospital Bonn
      • Bremerhaven, Германия, 27574
        • Klinikum Bremerhaven Reinkenheide gGmbH
      • Duesseldorf, Германия, 40225
        • Duesseldorf University Hospital
      • Essen, Германия, 45147
        • University Hospital Essen
      • Frankfurt, Германия, 60590
        • University Hospital Frankfurt
      • Göttingen, Германия, 37077
        • University Medical Center Göttingen
      • Hannover, Германия, 30625
        • Medical School Hannover
      • Heidelberg, Германия, 69120
        • University Hospital Heidelberg
      • Heidenheim, Германия
        • Kliniken Landkreis Heidenheim gGmbH
      • Köln, Германия
        • University Hospital Köln
      • Leipzig, Германия
        • University Hospital Leipzig
      • Luckau, Германия, 15926
        • Evangelisches Krankenhaus Luckau gGmbH
      • Munich, Германия, 81675
        • University Hospital rechts der Isar
      • Regensburg, Германия, 93053
        • University Hospital of Regensburg
      • Rostock, Германия, 18057
        • University of Rostock
      • Tübingen, Германия, 72076
        • University Hospital Tübingen
      • Ulm, Германия, 89081
        • Ulm University Medical Center

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

От 18 лет до 99 лет (Взрослый, Пожилой взрослый)

Принимает здоровых добровольцев

Нет

Полы, имеющие право на обучение

Все

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

Пациенты с сепсисом или септическим шоком в соответствии с новыми определениями сепсиса (Сепсис-3) с началом менее 24 часов имеют право на включение в исследование.

Описание

Критерии включения:

  • Возраст ≥18 лет
  • Информированное согласие
  • Сепсис (с началом ≤24 ч): пациенты с угрожающей жизни органной дисфункцией, вызванной нерегулируемой реакцией хозяина на подозреваемую или подтвержденную инфекцию. Органная дисфункция может быть идентифицирована как острое изменение общего балла по шкале SOFA ≥2 баллов в результате инфекции. Пациенты также могут быть быстро идентифицированы у постели больного с qSOFA, т.е. изменением психического статуса, систолическим артериальным давлением ≤100 мм рт.ст. или частотой дыхания ≥22/мин.
  • или септический шок (с началом ≤24 ч): пациенты с септическим шоком могут быть идентифицированы с клинической конструкцией сепсиса с персистирующей гипотензией, требующей вазопрессоров для поддержания среднего артериального давления (САД) ≥65 мм рт.ст. и имеющих уровень лактата в сыворотке >2 ммоль/л ( 18 мг/дл), несмотря на адекватную реанимацию объема.

Критерий исключения:

  • Возраст ≤18 лет
  • Отказ дать согласие
  • Пациент, вероятно, будет выписан из отделения интенсивной терапии в течение первых 72 часов после включения.
  • Цель паллиативного лечения
  • Клиницист не стремится к агрессивному лечению
  • Смерть считается близкой и неизбежной
  • Пациенты, которые ранее были включены, но повторно госпитализированы в отделение интенсивной терапии во время той же госпитализации, не будут включены во второй раз.

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

  • Наблюдательные модели: Когорта
  • Временные перспективы: Перспективный

Когорты и вмешательства

Группа / когорта
Вмешательство/лечение
Группа Сепсис
Пациенты (n=500) с подозрением или подтвержденным сепсисом или септическим шоком (согласно определениям Сепсиса-3).
Диагностический тест: Секвенирование следующего поколения
У 500 пациентов с подозрением или подтвержденным сепсисом или септическим шоком (в соответствии с определениями Sepsis-3) характеристики пациентов и обычные параметры крови будут определены в начале сепсиса, а также через 72 часа после него. В то же время будут собраны 2 набора культур крови и одна пробирка крови для диагностики с помощью секвенирования следующего поколения (NGS). Оценка исхода будет проводиться через 28 дней после начала сепсиса.

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Чувствительность [%] (оценка SIQ на основе NGS по сравнению с диагностикой культуры крови, как золотой стандарт для идентификации возбудителя при сепсисе)
Временное ограничение: 2 года
Доля положительных результатов, которые правильно идентифицированы как таковые.
2 года
Специфичность [%] (оценка SIQ на основе NGS по сравнению с диагностикой культуры крови, как золотой стандарт для идентификации возбудителя при сепсисе)
Временное ограничение: 2 года
Доля отрицаний, которые правильно идентифицированы как таковые.
2 года
Положительное прогностическое значение [%] (показатель SIQ на основе NGS по сравнению с диагностикой культуры крови, как золотой стандарт для идентификации возбудителя при сепсисе)
Временное ограничение: 2 года
Доля положительных результатов, которые являются истинно положительными.
2 года
Отрицательная прогностическая ценность [%] (показатель SIQ на основе NGS по сравнению с диагностикой культуры крови, как золотой стандарт для идентификации возбудителя при сепсисе)
Временное ограничение: 2 года
Доля отрицательных результатов, которые являются истинно отрицательными.
2 года
Каппа-коэффициент Коэна [без единицы измерения; 0</=k</=1] (оценка SIQ на основе NGS по сравнению с диагностикой культуры крови, как золотой стандарт для идентификации возбудителя при сепсисе)
Временное ограничение: 2 года
Измерение согласия между наблюдателями между обоими элементами.
2 года

Вторичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Правдоподобие [%] (показатель SIQ на основе NGS)
Временное ограничение: 2,5 года
Используя правило большинства, правдоподобность результатов SIQ будет оцениваться группой из трех независимых клинических специалистов, не связанных с исследовательским центром. Таким образом, комиссии будут предоставлены резюме клинических случаев, результаты NGS и результаты стандарта лечения для всех протестированных образцов. Результаты рутинной микробиологической диагностики образцов, отличных от крови (например, жидкости организма, ткани, бронхоальвеолярный лаваж, эндотрахеальный аспират) будут включены, если они были получены в течение ≤72 часов до или после временных точек для измерений на основе NGS.
2,5 года
Изменения в терапии [%] (которые могли бы произойти, если бы оценка SIQ на основе NGS была доступна для клинического использования)
Временное ограничение: 2,5 года
Используя правило большинства, клиническая ценность подхода, основанного на NGS, будет оцениваться группой из трех независимых клинических специалистов, не связанных с исследовательским центром, ретроспективно определяющих потенциальные изменения в лечении пациентов на основе результатов NGS. Таким образом, комиссии будут предоставлены резюме клинических случаев, результаты NGS и результаты стандарта лечения для всех протестированных образцов. Результаты рутинной микробиологической диагностики образцов, отличных от крови (например, жидкости организма, ткани, бронхоальвеолярный лаваж, эндотрахеальный аспират) будут включены, если они были получены в течение ≤72 часов до или после временных точек для измерений на основе NGS. Для выявления потенциальных изменений в управлении противомикробными препаратами, которые могли бы произойти, если бы результаты технологии NGS были доступны для клинического использования, комиссии будет предоставлена ​​специальная анкета.
2,5 года

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

University Hospital Heidelberg

Соавторы

Fraunhofer Institute for Interfacial Engineering and Biotechnology
Dietmar Hopp Stiftung GmbH

Следователи

  • Главный следователь: Thorsten Brenner, MD, University Hospital, Essen

Публикации и полезные ссылки

Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.

Общие публикации

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Действительный)

1 марта 2019 г.

Первичное завершение (Действительный)

31 августа 2021 г.

Завершение исследования (Действительный)

30 сентября 2021 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

19 ноября 2017 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

22 ноября 2017 г.

Первый опубликованный (Действительный)

29 ноября 2017 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Действительный)

18 мая 2022 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

17 мая 2022 г.

Последняя проверка

1 мая 2022 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Ключевые слова

Дополнительные соответствующие термины MeSH

Другие идентификационные номера исследования

  • S-084/2017

Планирование данных отдельных участников (IPD)

Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?

Нет

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Клинические исследования Секвенирование следующего поколения

Искать похожие исследования

Спонсоры и соавторы

Заболевания

Медикаментозные вмешательства

CROs by country

CROs in United States

Заболевания

Редкие заболевания

Медикаментозные вмешательства

Пищевые добавки

Спонсор / Соавторы

Места

Подписаться