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Diagnostics de séquençage de nouvelle génération de la bactériémie dans le sepsis (NextGeneSiS)

17 mai 2022 mis à jour par: Thorsten Brenner, MD, University Hospital Heidelberg

Diagnostics de séquençage de nouvelle génération de la bactériémie dans le sepsis (prochain essai GeneSiS) - Protocole d'étude pour un essai clinique prospectif, observationnel, non interventionnel et multicentrique

La septicémie reste un défi majeur, même dans la médecine moderne des soins intensifs. L'identification de l'agent pathogène responsable est cruciale pour une optimisation précoce du régime de traitement antimicrobien chez les patients atteints de septicémie. Dans ce contexte, les procédures de diagnostic basées sur la culture (par ex. hémocultures) représentent la norme de soins, bien qu'ils soient associés à des limites pertinentes. Par conséquent, les méthodes indépendantes de la culture (par ex. Le séquençage de nouvelle génération (NGS)) semble être une alternative intéressante. Grâce à l'identification de l'ADN acellulaire circulant dans le sang et à l'utilisation du score quantitatif indiquant la septicémie (SIQ), les agents pathogènes responsables peuvent être identifiés et les contaminations potentielles peuvent être exclues.

L'objectif de l'étude présentée est donc d'évaluer les performances diagnostiques d'une approche basée sur le NGS pour la détection d'organismes infectieux pertinents dans une grande cohorte de patients septiques (n = 500). De plus, la plausibilité de cette approche basée sur le NGS sera estimée par un panel de spécialistes cliniques indépendants, identifiant rétrospectivement les changements potentiels dans la prise en charge des patients sur la base des résultats du NGS.

Aperçu de l'étude

Statut

Complété

Les conditions

Intervention / Traitement

Description détaillée

La septicémie reste un défi majeur, même dans la médecine moderne des soins intensifs. L'identification de l'agent pathogène responsable est cruciale pour une optimisation précoce du régime de traitement antimicrobien chez les patients atteints de septicémie. Dans ce contexte, les procédures de diagnostic basées sur la culture (par exemple, les hémocultures) représentent la norme de soins, bien qu'elles soient associées à des limitations pertinentes. En conséquence, les procédures de diagnostic moléculaire indépendantes de la culture pourraient être utiles pour l'identification de l'agent pathogène responsable chez les patients infectés. En particulier, le concept d'une analyse de séquence impartiale de l'ADN acellulaire circulant (cfDNA) à partir d'échantillons de plasma de patients septiques par séquençage de nouvelle génération (NGS) a récemment été identifié comme une plate-forme de diagnostic prometteuse pour les patients gravement malades souffrant d'infections du sang. Bien que cette nouvelle approche puisse être plus sensible et spécifique que les technologies de pointe basées sur la culture, des essais cliniques supplémentaires sont nécessaires pour définir exactement les performances ainsi que la valeur clinique d'une approche basée sur le NGS.

Next GeneSiS est une étude prospective, observationnelle, non interventionnelle et multicentrique visant à évaluer les performances diagnostiques d'une approche basée sur le NGS pour la détection d'organismes infectieux pertinents chez les patients atteints de sepsis suspecté ou avéré (selon les définitions récentes du sepsis [sepsis-3] ) en utilisant le score SIQ (Quantitative Sepsis Indicator Quantifier) ​​par rapport aux tests microbiologiques standard (basés sur la culture). De plus, la valeur clinique de cette approche basée sur le NGS sera estimée par un panel de spécialistes cliniques indépendants, identifiant rétrospectivement les changements potentiels dans la prise en charge des patients sur la base des résultats du NGS. D'autres analyses de sous-groupes se concentreront sur la valeur clinique, en particulier pour les patients souffrant d'un échec du traitement empirique dans les trois premiers jours après le début (tel qu'évalué par (1.) le décès du patient ou l'absence d'amélioration de l'état clinique du patient ( en termes de diminution inadéquate du score SOFA) ou (2.) niveaux élevés persistants de procalcitonine).

Cette étude prospective, observationnelle, non interventionnelle et multicentrique étudie pour la première fois les performances ainsi que la valeur clinique d'une approche basée sur le NGS pour la détection de la bactériémie chez les patients atteints de septicémie et peut donc constituer une étape cruciale vers l'utilisation clinique de NGS dans cette indication.

Deux séries d'hémocultures (2 x aérobies / 2 x anaérobies) seront prélevées à l'inclusion dans l'étude (= début) ainsi que 72 heures après (= 72 h). En parallèle, des échantillons de plasma pour les mesures basées sur NGS doivent être obtenus comme décrit précédemment. D'autres échantillons de sang pour les mesures basées sur le NGS peuvent être prélevés chaque fois que les médecins ordonnent des hémocultures (2x aérobies / 2x anaérobies) en raison de la suspicion clinique d'une infection du sang (BSI) dans les 3 premiers jours après l'inclusion à l'étude. Les résultats des diagnostics microbiologiques de routine dans des échantillons différents du sang (par ex. liquide corporel, tissu, lavage bronchoalvéolaire, aspiration endotrachéale) seront utilisés pour des analyses supplémentaires lorsqu'ils sont obtenus dans un délai de ≤ 72 heures avant ou après les points temporels pour les mesures basées sur NGS. La collecte des données cliniques et (si possible) les mesures PCT seront effectuées au début ainsi que 72 h après l'inclusion dans l'étude. L'évaluation finale des résultats des patients sera effectuée à 28 jours.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Réel)

500

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

  • Allemagne
      • Aachen, Allemagne, 52074
        • RWTH Aachen University
      • Baden-Baden, Allemagne, 76532
        • Klinikum Mittelbaden Baden-Baden Balg
      • Berlin, Allemagne
        • Charité - Universitätsmedizin Berlin
      • Bielefeld, Allemagne, 33617
        • Evangelisches Krankenhaus Bethel gGmbH
      • Bonn, Allemagne
        • University Hospital Bonn
      • Bremerhaven, Allemagne, 27574
        • Klinikum Bremerhaven Reinkenheide gGmbH
      • Duesseldorf, Allemagne, 40225
        • Duesseldorf University Hospital
      • Essen, Allemagne, 45147
        • University Hospital Essen
      • Frankfurt, Allemagne, 60590
        • University Hospital Frankfurt
      • Göttingen, Allemagne, 37077
        • University Medical Center Göttingen
      • Hannover, Allemagne, 30625
        • Medical School Hannover
      • Heidelberg, Allemagne, 69120
        • University Hospital Heidelberg
      • Heidenheim, Allemagne
        • Kliniken Landkreis Heidenheim gGmbH
      • Köln, Allemagne
        • University Hospital Koln
      • Leipzig, Allemagne
        • University Hospital Leipzig
      • Luckau, Allemagne, 15926
        • Evangelisches Krankenhaus Luckau gGmbH
      • Munich, Allemagne, 81675
        • University Hospital Rechts der Isar
      • Regensburg, Allemagne, 93053
        • University Hospital of Regensburg
      • Rostock, Allemagne, 18057
        • University of Rostock
      • Tübingen, Allemagne, 72076
        • University Hospital Tübingen
      • Ulm, Allemagne, 89081
        • Ulm University Medical Center

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

18 ans à 99 ans (Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Non

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Les patients atteints de sepsis ou de choc septique selon les nouvelles définitions du sepsis (Sepsis-3) avec un début <24h sont éligibles pour l'inclusion dans l'étude.

La description

Critère d'intégration:

  • Âge ≥18 ans
  • Consentement éclairé
  • Septicémie (d'apparition ≤ 24 h) : patients présentant un dysfonctionnement organique menaçant le pronostic vital causé par une réponse dérégulée de l'hôte à une infection suspectée ou avérée. Le dysfonctionnement d'organe peut être identifié comme un changement aigu du score SOFA total ≥ 2 points consécutif à l'infection. Les patients peuvent également être rapidement identifiés au chevet du patient avec qSOFA, c'est-à-dire une altération de l'état mental, une pression artérielle systolique ≤ 100 mmHg ou une fréquence respiratoire ≥ 22/min.
  • ou Choc septique (d'apparition ≤ 24 h) : les patients présentant un choc septique peuvent être identifiés par une construction clinique de septicémie avec hypotension persistante nécessitant des vasopresseurs pour maintenir la pression artérielle moyenne (PAM) ≥ 65 mmHg et ayant un taux de lactate sérique > 2 mmol/L ( 18 mg/dL) malgré une réanimation volumique adéquate.

Critère d'exclusion:

  • Âge ≤18 ans
  • Refus de donner son consentement
  • Le patient sortira probablement de l'unité de soins intensifs dans les 72 premières heures suivant l'inclusion
  • Intention de traitement palliatif
  • Le clinicien n'est pas engagé dans un traitement agressif
  • La mort est jugée imminente et inévitable
  • Les patients précédemment inclus, mais réadmis en réanimation au cours de la même hospitalisation, ne seront pas inclus une seconde fois.

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Modèles d'observation: Cohorte
  • Perspectives temporelles: Éventuel

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
Groupe Septicémie
Patients (n = 500) présentant une septicémie ou un choc septique suspecté ou avéré (selon les définitions de Sepsis-3).
Test diagnostique: Séquençage de nouvelle génération
Chez 500 patients suspectés ou avérés de sepsis ou de choc septique (selon les définitions de Sepsis-3), les caractéristiques des patients et les paramètres sanguins de routine seront déterminés au début du sepsis ainsi que 72 heures après. Au même moment, 2 séries d'hémocultures et un tube de sang pour le diagnostic de séquençage de nouvelle génération (NGS) seront collectés. Une évaluation des résultats sera effectuée 28 jours après le début de la septicémie.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Sensibilité [%] (du score SIQ basé sur le NGS par rapport au diagnostic d'hémoculture, comme référence pour l'identification de l'agent pathogène responsable de la septicémie)
Délai: 2 années
Proportion de positifs correctement identifiés comme tels.
2 années
Spécificité [%] (du score SIQ basé sur le NGS par rapport aux diagnostics d'hémoculture, comme référence pour l'identification de l'agent pathogène responsable de la septicémie)
Délai: 2 années
Proportion de négatifs correctement identifiés comme tels.
2 années
Valeur prédictive positive [%] (du score SIQ basé sur le NGS par rapport au diagnostic d'hémoculture, comme référence pour l'identification de l'agent pathogène responsable de la septicémie)
Délai: 2 années
Proportion de positifs qui sont de vrais positifs.
2 années
Valeur prédictive négative [%] (du score SIQ basé sur le NGS par rapport au diagnostic d'hémoculture, comme référence pour l'identification de l'agent pathogène responsable du sepsis)
Délai: 2 années
Proportion de négatifs qui sont de vrais négatifs.
2 années
Coefficient kappa de Cohen [pas d'unité de mesure ; 0</=k</=1] (du score SIQ basé sur le NGS par rapport au diagnostic d'hémoculture, en tant qu'étalon-or pour l'identification de l'agent pathogène responsable de la septicémie)
Délai: 2 années
Mesure de l'accord interobservateur entre les deux items.
2 années

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Plausibilité [%] (du score SIQ basé sur NGS)
Délai: 2,5 ans
En utilisant une règle de majorité, les résultats du score SIQ seront évalués pour leur plausibilité par un panel de trois spécialistes cliniques indépendants non associés au site d'étude. Par conséquent, le panel recevra des résumés de cas cliniques, des résultats NGS et des résultats de soins standard de tous les échantillons testés. Les résultats des diagnostics microbiologiques de routine dans des échantillons différents du sang (par ex. liquide corporel, tissu, lavage broncho-alvéolaire, aspiration endotrachéale) seront inclus lorsqu'ils auront été obtenus dans un délai de ≤ 72 heures avant ou après les points temporels des mesures basées sur l'END.
2,5 ans
Changements de traitement [%] (qui auraient pu se produire si le score SIQ basé sur le NGS avait été disponible pour une utilisation clinique)
Délai: 2,5 ans
En utilisant une règle majoritaire, la valeur clinique de l'approche basée sur le NGS sera estimée par un panel de trois spécialistes cliniques indépendants non associés au site d'étude, identifiant rétrospectivement les changements potentiels dans la prise en charge des patients sur la base des résultats du NGS. Par conséquent, le panel recevra des résumés de cas cliniques, des résultats NGS et des résultats de soins standard de tous les échantillons testés. Les résultats des diagnostics microbiologiques de routine dans des échantillons différents du sang (par ex. liquide corporel, tissu, lavage broncho-alvéolaire, aspiration endotrachéale) seront inclus lorsqu'ils auront été obtenus dans un délai de ≤ 72 heures avant ou après les points temporels des mesures basées sur l'END. Pour identifier les changements potentiels dans la gestion des antimicrobiens qui auraient pu se produire si les résultats de la technologie NGS avaient été disponibles pour une utilisation clinique, le panel recevra un questionnaire spécial.
2,5 ans

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

University Hospital Heidelberg

Collaborateurs

Fraunhofer Institute for Interfacial Engineering and Biotechnology
Dietmar Hopp Stiftung GmbH

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Thorsten Brenner, MD, University Hospital, Essen

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Publications générales

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

1 mars 2019

Achèvement primaire (Réel)

31 août 2021

Achèvement de l'étude (Réel)

30 septembre 2021

Dates d'inscription aux études

Première soumission

19 novembre 2017

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

22 novembre 2017

Première publication (Réel)

29 novembre 2017

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

18 mai 2022

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

17 mai 2022

Dernière vérification

1 mai 2022

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Mots clés

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • S-084/2017

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

Non

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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