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Diagnostica di sequenziamento di nuova generazione della batteriemia nella sepsi (NextGeneSiS)

17 maggio 2022 aggiornato da: Thorsten Brenner, MD, University Hospital Heidelberg

Diagnostica di sequenziamento di nuova generazione della batteriemia nella sepsi (Next GeneSiS-Trial) - Protocollo di studio per uno studio clinico prospettico, osservazionale, non interventistico, multicentrico

La sepsi rimane una sfida importante, anche nella moderna medicina di terapia intensiva. L'identificazione del patogeno causale è fondamentale per un'ottimizzazione precoce del regime di trattamento antimicrobico nei pazienti con sepsi. In questo contesto, le procedure diagnostiche basate sulla cultura (ad es. emocolture) rappresentano lo standard di cura, sebbene siano associate a limitazioni rilevanti. Pertanto, i metodi indipendenti dalla cultura (ad es. Next-Generation Sequencing (NGS)) sembrano essere un'alternativa interessante. Mediante l'identificazione del DNA privo di cellule circolanti nel sangue e l'uso del punteggio quantitativo di sepsi che indica il quantificatore (SIQ), è possibile identificare i patogeni che causano ed escludere potenziali contaminazioni.

L'obiettivo dello studio presentato è quindi quello di valutare le prestazioni diagnostiche di un approccio basato su NGS per il rilevamento di organismi infettanti rilevanti in un'ampia coorte di pazienti settici (n=500). Inoltre, la plausibilità di questo approccio basato su NGS sarà stimata da un gruppo di specialisti clinici indipendenti, identificando retrospettivamente potenziali cambiamenti nella gestione dei pazienti sulla base dei risultati NGS.

Panoramica dello studio

Stato

Completato

Condizioni

Intervento / Trattamento

Descrizione dettagliata

La sepsi rimane una sfida importante, anche nella moderna medicina di terapia intensiva. L'identificazione del patogeno causale è fondamentale per un'ottimizzazione precoce del regime di trattamento antimicrobico nei pazienti con sepsi. In questo contesto, le procedure diagnostiche basate sulla coltura (ad esempio, emocolture) rappresentano lo standard di cura, sebbene siano associate a limitazioni rilevanti. Di conseguenza, le procedure diagnostiche molecolari indipendenti dalla coltura potrebbero essere di aiuto per l'identificazione del patogeno causativo nei pazienti infetti. In particolare, il concetto di un'analisi di sequenza imparziale del DNA libero circolante (cfDNA) da campioni di plasma di pazienti settici mediante sequenziamento di nuova generazione (NGS) è stato recentemente identificato come una piattaforma diagnostica promettente per i pazienti critici affetti da infezioni del flusso sanguigno. Sebbene questo nuovo approccio possa essere più sensibile e specifico delle tecnologie all'avanguardia basate sulla cultura, sono necessari ulteriori studi clinici per definire esattamente le prestazioni e il valore clinico di un approccio basato su NGS.

Next GeneSiS è uno studio prospettico, osservazionale, non interventistico e multicentrico per valutare le prestazioni diagnostiche di un approccio basato su NGS per il rilevamento di organismi infettanti rilevanti in pazienti con sospetta o accertata sepsi (secondo le recenti definizioni di sepsi [sepsis-3] ) mediante l'uso della sepsi quantitativa che indica il punteggio del quantificatore (SIQ) rispetto ai test microbiologici standard (basati sulla coltura). Inoltre, il valore clinico di questo approccio basato su NGS sarà stimato da un gruppo di specialisti clinici indipendenti, identificando retrospettivamente potenziali cambiamenti nella gestione dei pazienti sulla base dei risultati NGS. Ulteriori analisi di sottogruppi si concentreranno sul valore clinico in particolare per i pazienti che soffrono di un fallimento del trattamento empirico entro i primi tre giorni dall'esordio (come valutato da (1.) morte del paziente o mancanza di miglioramento delle condizioni cliniche del paziente ( in termini di diminuzione inadeguata del punteggio SOFA) o (2.) livelli elevati persistenti di procalcitonina).

Questo studio prospettico, osservazionale, non interventistico e multicentrico per la prima volta indaga le prestazioni e il valore clinico di un approccio basato su NGS per il rilevamento della batteriemia nei pazienti con sepsi e può quindi essere un passo fondamentale verso l'uso clinico di NGS in questa indicazione.

Verranno raccolte due serie di emocolture (2x aerobiche / 2x anaerobiche) all'inclusione nello studio (=Insorgenza) e 72 ore dopo (=72 ore). Parallelamente, i campioni di plasma per le misurazioni basate su NGS devono essere ottenuti come descritto in precedenza. Ulteriori campioni di sangue per le misurazioni basate su NGS possono essere raccolti ogni volta che i medici prescrivono emocolture (2x aerobico / 2x anaerobico) a causa del sospetto clinico di un'infezione del flusso sanguigno (BSI) entro i primi 3 giorni dopo l'inclusione nello studio. Risultati della diagnostica microbiologica di routine in campioni diversi dal sangue (ad es. fluido corporeo, tessuto, lavaggio broncoalveolare, aspirato endotracheale) saranno utilizzati per ulteriori analisi quando saranno ottenuti entro un lasso di tempo di ≤72 ore prima o dopo i punti temporali per le misurazioni basate su NGS. La raccolta dei dati clinici e (se possibile) le misurazioni della PCT saranno eseguite all'esordio e 72 ore dopo l'inclusione nello studio. La valutazione dell'esito finale dei pazienti verrà eseguita a 28 giorni.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Effettivo)

500

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Luoghi di studio

  • Germania
      • Aachen, Germania, 52074
        • RWTH Aachen University
      • Baden-Baden, Germania, 76532
        • Klinikum Mittelbaden Baden-Baden Balg
      • Berlin, Germania
        • Charité - Universitätsmedizin Berlin
      • Bielefeld, Germania, 33617
        • Evangelisches Krankenhaus Bethel gGmbH
      • Bonn, Germania
        • University Hospital Bonn
      • Bremerhaven, Germania, 27574
        • Klinikum Bremerhaven Reinkenheide gGmbH
      • Duesseldorf, Germania, 40225
        • Duesseldorf University Hospital
      • Essen, Germania, 45147
        • University Hospital Essen
      • Frankfurt, Germania, 60590
        • University Hospital Frankfurt
      • Göttingen, Germania, 37077
        • University Medical Center Göttingen
      • Hannover, Germania, 30625
        • Medical School Hannover
      • Heidelberg, Germania, 69120
        • University Hospital Heidelberg
      • Heidenheim, Germania
        • Kliniken Landkreis Heidenheim gGmbH
      • Köln, Germania
        • University Hospital Koln
      • Leipzig, Germania
        • University Hospital Leipzig
      • Luckau, Germania, 15926
        • Evangelisches Krankenhaus Luckau gGmbH
      • Munich, Germania, 81675
        • University Hospital Rechts der Isar
      • Regensburg, Germania, 93053
        • University Hospital of Regensburg
      • Rostock, Germania, 18057
        • University of Rostock
      • Tübingen, Germania, 72076
        • University Hospital Tübingen
      • Ulm, Germania, 89081
        • Ulm University Medical Center

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

Da 18 anni a 99 anni (Adulto, Adulto più anziano)

Accetta volontari sani

No

Sessi ammissibili allo studio

Tutto

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

I pazienti con sepsi o shock settico secondo le nuove definizioni di sepsi (Sepsis-3) con un esordio <24 ore sono eleggibili per l'inclusione nello studio.

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • Età ≥18 anni
  • Consenso informato
  • Sepsi (con insorgenza ≤24 ore): pazienti con disfunzione d'organo pericolosa per la vita causata da una risposta dell'ospite disregolata a un'infezione sospetta o accertata. La disfunzione d'organo può essere identificata come un cambiamento acuto nel punteggio SOFA totale ≥2 punti conseguente all'infezione. I pazienti possono anche essere prontamente identificati al letto del paziente con qSOFA, cioè alterazione dello stato mentale, pressione arteriosa sistolica ≤100mmHg o frequenza respiratoria ≥22/min.
  • o Shock settico (con insorgenza ≤24 ore): i pazienti con shock settico possono essere identificati con un costrutto clinico di sepsi con ipotensione persistente che richiede vasopressori per mantenere la pressione arteriosa media (MAP) ≥65 mmHg e con un livello di lattato sierico > 2mmol/L ( 18mg/dL) nonostante un'adeguata rianimazione del volume.

Criteri di esclusione:

  • Età ≤18 anni
  • Rifiuto di prestare il consenso
  • Il paziente sarà probabilmente dimesso dall'ICU entro le prime 72 ore successive all'inclusione
  • Intento terapeutico palliativo
  • Il medico non è impegnato in un trattamento aggressivo
  • La morte è ritenuta imminente e inevitabile
  • I pazienti che erano stati inseriti in precedenza, ma vengono riammessi in terapia intensiva durante lo stesso ricovero, non verranno inseriti una seconda volta.

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

  • Modelli osservazionali: Coorte
  • Prospettive temporali: Prospettiva

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
Gruppo sepsi
Pazienti (n=500) con sospetta o comprovata sepsi o shock settico (secondo le definizioni di Sepsis-3).
Test diagnostico: Sequenziamento di nuova generazione
In 500 pazienti con sepsi sospetta o provata o shock settico (secondo le definizioni di Sepsis-3), le caratteristiche dei pazienti e i parametri ematici di routine saranno determinati all'inizio della sepsi e 72 ore dopo. Allo stesso tempo, verranno raccolti 2 set di emocolture e una provetta di sangue per la diagnostica di Next-Generation Sequencing (NGS). Una valutazione dell'esito verrà eseguita a 28 giorni dall'insorgenza della sepsi.

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Sensibilità [%] (del punteggio SIQ basato su NGS rispetto alla diagnostica dell'emocoltura, come gold standard per l'identificazione del patogeno causale nella sepsi)
Lasso di tempo: 2 anni
Proporzione di positivi correttamente identificati come tali.
2 anni
Specificità [%] (del punteggio SIQ basato su NGS rispetto alla diagnostica dell'emocoltura, come gold standard per l'identificazione del patogeno causale nella sepsi)
Lasso di tempo: 2 anni
Percentuale di negativi correttamente identificati come tali.
2 anni
Valore predittivo positivo [%] (del punteggio SIQ basato su NGS rispetto alla diagnostica dell'emocoltura, come gold standard per l'identificazione del patogeno causale nella sepsi)
Lasso di tempo: 2 anni
Proporzione di positivi che sono veri positivi.
2 anni
Valore predittivo negativo [%] (del punteggio SIQ basato su NGS rispetto alla diagnostica dell'emocoltura, come gold standard per l'identificazione del patogeno causale nella sepsi)
Lasso di tempo: 2 anni
Proporzione di negativi che sono veri negativi.
2 anni
Coefficiente kappa di Cohen [nessuna unità di misura; 0</=k</=1] (del punteggio SIQ basato su NGS rispetto alla diagnostica dell'emocoltura, come standard di riferimento per l'identificazione del patogeno responsabile della sepsi)
Lasso di tempo: 2 anni
Misurazione dell'accordo interosservatore tra i due elementi.
2 anni

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Plausibilità [%] (del punteggio SIQ basato su NGS)
Lasso di tempo: 2,5 anni
Utilizzando una regola di maggioranza, i risultati del punteggio SIQ saranno valutati per la plausibilità da un gruppo di tre specialisti clinici indipendenti non associati al sito dello studio. Pertanto, al pannello verranno forniti i riepiloghi dei casi clinici, i risultati NGS e i risultati dello standard di cura di tutti i campioni testati. Risultati della diagnostica microbiologica di routine in campioni diversi dal sangue (ad es. fluido corporeo, tessuto, lavaggio broncoalveolare, aspirato endotracheale) saranno inclusi quando sono stati ottenuti entro un periodo di tempo di ≤72 ore prima o dopo i punti temporali per le misurazioni basate su NGS.
2,5 anni
Cambiamenti nella terapia [%] (che potrebbero essersi verificati se il punteggio SIQ basato su NGS fosse stato disponibile per l'uso clinico)
Lasso di tempo: 2,5 anni
Utilizzando una regola di maggioranza, il valore clinico dell'approccio basato su NGS sarà stimato da un panel di tre specialisti clinici indipendenti non associati al sito dello studio, identificando retrospettivamente potenziali cambiamenti nella gestione dei pazienti sulla base dei risultati NGS. Pertanto, al pannello verranno forniti i riepiloghi dei casi clinici, i risultati NGS e i risultati dello standard di cura di tutti i campioni testati. Risultati della diagnostica microbiologica di routine in campioni diversi dal sangue (ad es. fluido corporeo, tessuto, lavaggio broncoalveolare, aspirato endotracheale) saranno inclusi quando sono stati ottenuti entro un periodo di tempo di ≤72 ore prima o dopo i punti temporali per le misurazioni basate su NGS. Per identificare potenziali cambiamenti nella gestione antimicrobica che potrebbero essersi verificati se i risultati della tecnologia NGS fossero stati disponibili per l'uso clinico, al panel verrà fornito un questionario speciale.
2,5 anni

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Sponsor

University Hospital Heidelberg

Collaboratori

Fraunhofer Institute for Interfacial Engineering and Biotechnology
Dietmar Hopp Stiftung GmbH

Investigatori

  • Investigatore principale: Thorsten Brenner, MD, University Hospital, Essen

Pubblicazioni e link utili

La persona responsabile dell'inserimento delle informazioni sullo studio fornisce volontariamente queste pubblicazioni. Questi possono riguardare qualsiasi cosa relativa allo studio.

Pubblicazioni generali

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

1 marzo 2019

Completamento primario (Effettivo)

31 agosto 2021

Completamento dello studio (Effettivo)

30 settembre 2021

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

19 novembre 2017

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

22 novembre 2017

Primo Inserito (Effettivo)

29 novembre 2017

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

18 maggio 2022

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

17 maggio 2022

Ultimo verificato

1 maggio 2022

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Parole chiave

Termini MeSH pertinenti aggiuntivi

Altri numeri di identificazione dello studio

  • S-084/2017

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

No

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

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