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Diagnóstico de Sequenciamento de Próxima Geração de Bacteremia na Sepse (NextGeneSiS)

17 de maio de 2022 atualizado por: Thorsten Brenner, MD, University Hospital Heidelberg

Diagnóstico de Sequenciamento de Próxima Geração de Bacteremia na Sepse (Next GeneSiS-Trial) - Protocolo de Estudo para um Estudo Clínico Prospectivo, Observacional, Não Intervencionista, Multicêntrico

A sepse continua sendo um grande desafio, mesmo na medicina intensiva moderna. A identificação do patógeno causador é crucial para uma otimização precoce do regime de tratamento antimicrobiano em pacientes com sepse. Neste contexto, procedimentos de diagnóstico baseados em cultura (por exemplo, hemoculturas) representam o padrão de atendimento, embora estejam associadas a limitações relevantes. Portanto, métodos independentes de cultura (por exemplo, Next-Generation Sequencing (NGS)) parecem ser uma alternativa atraente. Pela identificação de DNA livre de células circulantes no sangue e pelo uso da pontuação do quantificador indicativo de sepse quantitativa (SIQ), os patógenos causadores podem ser identificados e possíveis contaminações podem ser excluídas.

O objetivo do estudo apresentado é, portanto, avaliar o desempenho diagnóstico de uma abordagem baseada em NGS para a detecção de organismos infecciosos relevantes em uma grande coorte de pacientes sépticos (n = 500). Além disso, a plausibilidade desta abordagem baseada em NGS será estimada por um painel de especialistas clínicos independentes, identificando retrospectivamente possíveis mudanças no manejo dos pacientes com base nos resultados do NGS.

Visão geral do estudo

Status

Concluído

Condições

Descrição detalhada

A sepse continua sendo um grande desafio, mesmo na medicina intensiva moderna. A identificação do patógeno causador é crucial para uma otimização precoce do regime de tratamento antimicrobiano em pacientes com sepse. Nesse contexto, procedimentos diagnósticos baseados em cultura (por exemplo, hemoculturas) representam o padrão de atendimento, embora estejam associados a limitações relevantes. Consequentemente, procedimentos de diagnóstico molecular independentes de cultura podem ajudar na identificação do patógeno causador em pacientes infectados. Especialmente o conceito de uma análise de sequência imparcial de DNA livre de células circulantes (cfDNA) de amostras de plasma de pacientes sépticos por sequenciamento de próxima geração (NGS) foi recentemente identificado como uma plataforma de diagnóstico promissora para pacientes gravemente enfermos que sofrem de infecções da corrente sanguínea. Embora essa nova abordagem possa ser mais sensível e específica do que as tecnologias de ponta baseadas em cultura, são necessários ensaios clínicos adicionais para definir exatamente o desempenho, bem como o valor clínico de uma abordagem baseada em NGS.

O Next GeneSiS é um estudo prospectivo, observacional, não intervencional e multicêntrico para avaliar o desempenho diagnóstico de uma abordagem baseada em NGS para a detecção de organismos infecciosos relevantes em pacientes com sepse suspeita ou comprovada (de acordo com as definições recentes de sepse [sepsis-3] ) pelo uso da pontuação do quantificador indicativo de sepse quantitativa (SIQ) em comparação com testes microbiológicos padrão (baseados em cultura). Além disso, o valor clínico desta abordagem baseada em NGS será estimado por um painel de especialistas clínicos independentes, identificando retrospectivamente possíveis mudanças no manejo dos pacientes com base nos resultados do NGS. Outras análises de subgrupos se concentrarão no valor clínico, especialmente para pacientes que sofrem de falha do tratamento empírico nos primeiros três dias após o início (conforme avaliado por (1.) morte do paciente ou falta de melhora da condição clínica do paciente ( em termos de uma diminuição inadequada da pontuação SOFA) ou (2.) níveis elevados persistentes de procalcitonina).

Este estudo prospectivo, observacional, não intervencional e multicêntrico pela primeira vez investiga o desempenho, bem como o valor clínico de uma abordagem baseada em NGS para a detecção de bacteremia em pacientes com sepse e pode, portanto, ser um passo fundamental para o uso clínico de NGS nesta indicação.

Dois conjuntos de hemoculturas (2x aeróbicas / 2x anaeróbicas) serão coletados na inclusão do estudo (=Início), bem como 72 horas depois (=72h). Em paralelo, amostras de plasma para medições baseadas em NGS precisam ser obtidas conforme descrito anteriormente. Outras amostras de sangue para medições baseadas em NGS podem ser coletadas sempre que os médicos solicitarem hemoculturas (2x aeróbicas / 2x anaeróbicas) devido à suspeita clínica de uma infecção da corrente sanguínea (BSI) nos primeiros 3 dias após a inclusão no estudo. Resultados de diagnósticos microbiológicos de rotina em amostras diferentes do sangue (p. fluido corporal, tecido, lavagem broncoalveolar, aspirado endotraqueal) serão usados ​​para análises adicionais quando forem obtidos dentro de um período de ≤ 72 horas antes ou depois dos pontos de tempo para medições baseadas em NGS. A coleta de dados clínicos e (se possível) as medições de PCT serão realizadas no início, bem como 72h após a inclusão no estudo. A avaliação final do resultado dos pacientes será realizada em 28 dias.

Tipo de estudo

Observacional

Inscrição (Real)

500

Contactos e Locais

Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.

Locais de estudo

      • Aachen, Alemanha, 52074
        • RWTH Aachen University
      • Baden-Baden, Alemanha, 76532
        • Klinikum Mittelbaden Baden-Baden Balg
      • Berlin, Alemanha
        • Charité - Universitätsmedizin Berlin
      • Bielefeld, Alemanha, 33617
        • Evangelisches Krankenhaus Bethel gGmbH
      • Bonn, Alemanha
        • University Hospital Bonn
      • Bremerhaven, Alemanha, 27574
        • Klinikum Bremerhaven Reinkenheide gGmbH
      • Duesseldorf, Alemanha, 40225
        • Duesseldorf University Hospital
      • Essen, Alemanha, 45147
        • University Hospital Essen
      • Frankfurt, Alemanha, 60590
        • University Hospital Frankfurt
      • Göttingen, Alemanha, 37077
        • University Medical Center Göttingen
      • Hannover, Alemanha, 30625
        • Medical School Hannover
      • Heidelberg, Alemanha, 69120
        • University Hospital Heidelberg
      • Heidenheim, Alemanha
        • Kliniken Landkreis Heidenheim gGmbH
      • Köln, Alemanha
        • University Hospital Köln
      • Leipzig, Alemanha
        • University Hospital Leipzig
      • Luckau, Alemanha, 15926
        • Evangelisches Krankenhaus Luckau gGmbH
      • Munich, Alemanha, 81675
        • University Hospital Rechts der Isar
      • Regensburg, Alemanha, 93053
        • University Hospital of Regensburg
      • Rostock, Alemanha, 18057
        • University of Rostock
      • Tübingen, Alemanha, 72076
        • University Hospital Tübingen
      • Ulm, Alemanha, 89081
        • Ulm University Medical Center

Critérios de participação

Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.

Critérios de elegibilidade

Idades elegíveis para estudo

18 anos a 99 anos (Adulto, Adulto mais velho)

Aceita Voluntários Saudáveis

Não

Gêneros Elegíveis para o Estudo

Tudo

Método de amostragem

Amostra Não Probabilística

População do estudo

Pacientes com sepse ou choque séptico de acordo com as novas definições de sepse (Sepsis-3) com início <24h são elegíveis para inclusão no estudo.

Descrição

Critério de inclusão:

  • Idade ≥18 anos
  • Consentimento informado
  • Sepse (com início ≤24h): Pacientes com disfunção orgânica com risco de vida causada por uma resposta desregulada do hospedeiro a uma infecção suspeita ou comprovada. A disfunção orgânica pode ser identificada como uma alteração aguda no escore SOFA total ≥2 pontos consequente à infecção. Os pacientes também podem ser prontamente identificados à beira do leito com qSOFA, ou seja, alteração do estado mental, pressão arterial sistólica ≤100mmHg ou frequência respiratória ≥22/min.
  • ou Choque séptico (com início ≤24h): Pacientes com choque séptico podem ser identificados com uma construção clínica de sepse com hipotensão persistente que requer vasopressores para manter a pressão arterial média (PAM) ≥65mmHg e com nível de lactato sérico >2mmol/L ( 18mg/dL) apesar da ressuscitação volêmica adequada.

Critério de exclusão:

  • Idade ≤18 anos
  • Recusa em dar consentimento
  • O paciente provavelmente terá alta da UTI nas primeiras 72h após a inclusão
  • Intenção de tratamento paliativo
  • O clínico não está comprometido com o tratamento agressivo
  • A morte é considerada iminente e inevitável
  • Pacientes que já foram incluídos anteriormente, mas são reinternados na UTI durante a mesma internação, não serão incluídos uma segunda vez.

Plano de estudo

Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.

Como o estudo é projetado?

Detalhes do projeto

  • Modelos de observação: Coorte
  • Perspectivas de Tempo: Prospectivo

Coortes e Intervenções

Grupo / Coorte
Intervenção / Tratamento
Grupo Sepse
Pacientes (n=500) com suspeita ou comprovação de sepse ou choque séptico (de acordo com as definições Sepsis-3).
Em 500 pacientes com suspeita ou comprovação de sepse ou choque séptico (de acordo com as definições Sepsis-3), as características dos pacientes e os parâmetros sanguíneos de rotina serão determinados no início da sepse e 72 horas depois. Ao mesmo tempo, serão coletados 2 conjuntos de hemoculturas e um tubo de sangue para diagnóstico de Next-Generation Sequencing (NGS). Uma avaliação do resultado será realizada 28 dias após o início da sepse.

O que o estudo está medindo?

Medidas de resultados primários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Sensibilidade [%] (do escore SIQ baseado em NGS em comparação com o diagnóstico de hemocultura, como padrão-ouro para a identificação do patógeno causador da sepse)
Prazo: 2 anos
Proporção de positivos que são corretamente identificados como tal.
2 anos
Especificidade [%] (do escore SIQ baseado em NGS em comparação com o diagnóstico de hemocultura, como padrão-ouro para a identificação do patógeno causador da sepse)
Prazo: 2 anos
Proporção de negativos corretamente identificados como tal.
2 anos
Valor preditivo positivo [%] (do escore SIQ baseado em NGS em comparação com o diagnóstico de hemocultura, como padrão-ouro para a identificação do patógeno causador da sepse)
Prazo: 2 anos
Proporção de positivos que são verdadeiros positivos.
2 anos
Valor preditivo negativo [%] (do escore SIQ baseado em NGS em comparação com o diagnóstico de hemocultura, como padrão-ouro para a identificação do patógeno causador da sepse)
Prazo: 2 anos
Proporção de negativos que são verdadeiros negativos.
2 anos
Coeficiente kappa de Cohen [sem unidade de medida; 0</=k</=1] (do escore SIQ baseado em NGS em comparação com o diagnóstico de hemocultura, como padrão-ouro para a identificação do patógeno causador da sepse)
Prazo: 2 anos
Medida da concordância interobservador entre ambos os itens.
2 anos

Medidas de resultados secundários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Plausibilidade [%] (da pontuação SIQ baseada em NGS)
Prazo: 2,5 anos
Usando uma regra de maioria, os resultados do SIQ-score serão avaliados quanto à plausibilidade por um painel de três especialistas clínicos independentes não associados ao centro de estudo. Portanto, o painel receberá resumos de casos clínicos, resultados de NGS e resultados de atendimento padrão de todas as amostras testadas. Resultados de diagnósticos microbiológicos de rotina em amostras diferentes do sangue (p. fluido corporal, tecido, lavagem broncoalveolar, aspirado endotraqueal) serão incluídos quando forem obtidos dentro de um período de tempo ≤72 horas antes ou depois dos pontos de tempo para medições baseadas em NGS.
2,5 anos
Alterações na terapia [%] (que podem ter ocorrido se o escore SIQ baseado em NGS estivesse disponível para uso clínico)
Prazo: 2,5 anos
Usando uma regra de maioria, o valor clínico da abordagem baseada em NGS será estimado por um painel de três especialistas clínicos independentes não associados ao centro de estudo, identificando retrospectivamente possíveis mudanças no manejo dos pacientes com base nos resultados de NGS. Portanto, o painel receberá resumos de casos clínicos, resultados de NGS e resultados de atendimento padrão de todas as amostras testadas. Resultados de diagnósticos microbiológicos de rotina em amostras diferentes do sangue (p. fluido corporal, tecido, lavagem broncoalveolar, aspirado endotraqueal) serão incluídos quando forem obtidos dentro de um período de tempo ≤72 horas antes ou depois dos pontos de tempo para medições baseadas em NGS. Para identificar possíveis mudanças no manejo antimicrobiano que poderiam ter ocorrido se os resultados da tecnologia NGS estivessem disponíveis para uso clínico, o painel receberá um questionário especial.
2,5 anos

Colaboradores e Investigadores

É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.

Investigadores

  • Investigador principal: Thorsten Brenner, MD, University Hospital, Essen

Publicações e links úteis

A pessoa responsável por inserir informações sobre o estudo fornece voluntariamente essas publicações. Estes podem ser sobre qualquer coisa relacionada ao estudo.

Datas de registro do estudo

Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados ​​pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.

Datas Principais do Estudo

Início do estudo (Real)

1 de março de 2019

Conclusão Primária (Real)

31 de agosto de 2021

Conclusão do estudo (Real)

30 de setembro de 2021

Datas de inscrição no estudo

Enviado pela primeira vez

19 de novembro de 2017

Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ

22 de novembro de 2017

Primeira postagem (Real)

29 de novembro de 2017

Atualizações de registro de estudo

Última Atualização Postada (Real)

18 de maio de 2022

Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade

17 de maio de 2022

Última verificação

1 de maio de 2022

Mais Informações

Termos relacionados a este estudo

Plano para dados de participantes individuais (IPD)

Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?

Não

Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo

Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Essas informações foram obtidas diretamente do site clinicaltrials.gov sem nenhuma alteração. Se você tiver alguma solicitação para alterar, remover ou atualizar os detalhes do seu estudo, entre em contato com register@clinicaltrials.gov. Assim que uma alteração for implementada em clinicaltrials.gov, ela também será atualizada automaticamente em nosso site .

Ensaios clínicos em Sequenciamento de próxima geração

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