Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Næste generations sekventeringsdiagnostik af bakteriæmi i sepsis (NextGeneSiS)

17. maj 2022 opdateret af: Thorsten Brenner, MD, University Hospital Heidelberg

Næste generations sekventeringsdiagnostik af bakteriæmi i sepsis (Næste GeneSiS-forsøg) - Undersøgelsesprotokol for et prospektivt, observationelt, ikke-interventionelt, multicenter, klinisk forsøg

Sepsis er fortsat en stor udfordring, selv i moderne intensivmedicin. Identifikationen af ​​det forårsagende patogen er afgørende for en tidlig optimering af det antimikrobielle behandlingsregime hos patienter med sepsis. I denne sammenhæng kan kulturbaserede diagnostiske procedurer (f.eks. blodkulturer) repræsenterer standarden for pleje, selvom de er forbundet med relevante begrænsninger. Derfor er kulturuafhængige metoder (f.eks. Next-Generation Sequencing (NGS)) ser ud til at være et attraktivt alternativ. Ved identifikation af cirkulerende cellefrit DNA i blodet og brugen af ​​den kvantitative sepsis-indikerende kvantifikator (SIQ) score, kan forårsagende patogener identificeres, og potentielle kontamineringer kan udelukkes.

Målet med det præsenterede studie er derfor at vurdere den diagnostiske ydeevne af en NGS-baseret tilgang til påvisning af relevante inficerende organismer i en stor kohorte af septiske patienter (n=500). Desuden vil plausibiliteten af ​​denne NGS-baserede tilgang blive estimeret af et panel af uafhængige kliniske specialister, der retrospektivt identificerer potentielle ændringer i patienters behandling baseret på NGS-resultater.

Studieoversigt

Status

Afsluttet

Betingelser

Intervention / Behandling

Detaljeret beskrivelse

Sepsis er fortsat en stor udfordring, selv i moderne intensivmedicin. Identifikationen af ​​det forårsagende patogen er afgørende for en tidlig optimering af det antimikrobielle behandlingsregime hos patienter med sepsis. I denne sammenhæng repræsenterer kulturbaserede diagnostiske procedurer (f.eks. blodkulturer) standarden for pleje, selvom de er forbundet med relevante begrænsninger. Følgelig kan kulturuafhængige molekylære diagnostiske procedurer være til hjælp til identifikation af det forårsagende patogen hos inficerede patienter. Især konceptet med en objektiv sekvensanalyse af cirkulerende cellefrit DNA (cfDNA) fra plasmaprøver fra septiske patienter ved hjælp af næste generations sekventering (NGS) er for nylig blevet identificeret som en lovende diagnostisk platform for kritisk syge patienter, der lider af blodbaneinfektioner. Selvom denne nye tilgang kan være mere følsom og specifik end kultur-baserede state-of-the-art teknologier, er yderligere kliniske forsøg nødvendige for nøjagtigt at definere ydeevnen såvel som den kliniske værdi af en NGS-baseret tilgang.

Next GeneSiS er en prospektiv, observationel, ikke-interventionel, multicenterundersøgelse til vurdering af den diagnostiske ydeevne af en NGS-baseret tilgang til påvisning af relevante inficerende organismer hos patienter med mistænkt eller påvist sepsis (i henhold til nyere sepsis-definitioner [sepsis-3] ) ved brug af den kvantitative sepsis-indikerende kvantifikator (SIQ) score sammenlignet med standard (kultur-baserede) mikrobiologiske tests. Desuden vil den kliniske værdi af denne NGS-baserede tilgang blive estimeret af et panel af uafhængige kliniske specialister, der retrospektivt identificerer potentielle ændringer i patienters behandling baseret på NGS-resultater. Yderligere undergruppeanalyser vil fokusere på den kliniske værdi, især for patienter, der lider af svigt af empirisk behandling inden for de første tre dage efter debut (vurderet ved (1.) patientens død eller manglende forbedring af patientens kliniske tilstand ( i form af et utilstrækkeligt fald i SOFA-score) eller (2.) vedvarende høje procalcitoninniveauer).

Dette prospektive, observationelle, ikke-interventionelle, multicenter studieforsøg undersøger for første gang ydeevnen såvel som den kliniske værdi af en NGS-baseret tilgang til påvisning af bakteriæmi hos patienter med sepsis og kan derfor være et afgørende skridt i retning af klinisk brug af NGS i denne indikation.

To sæt blodkulturer (2x aerobe / 2x anaerobe) vil blive indsamlet ved undersøgelsens inklusion (=Start) samt 72 timer derefter (=72 timer). Parallelt hermed skal plasmaprøver til NGS-baserede målinger opnås som beskrevet tidligere. Yderligere blodprøver til NGS-baserede målinger kan indsamles, når læger bestiller blodkulturer (2x aerobe / 2x anaerobe) på grund af den kliniske mistanke om en blodbaneinfektion (BSI) inden for de første 3 dage efter undersøgelsens inklusion. Resultater af mikrobiologisk rutinediagnostik i prøver, der er forskellige fra blod (f.eks. kropsvæske, væv, bronchoalveolær lavage, endotracheal aspirat) vil blive brugt til yderligere analyser, når de er opnået inden for en tidsramme på ≤72 timer før eller efter tidspunkterne for NGS-baserede målinger. Klinisk dataindsamling og (hvis muligt) PCT-målinger vil blive udført ved Onset såvel som 72 timer efter undersøgelsens inklusion. Den endelige udfaldsevaluering af patienter vil blive udført efter 28 dage.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Faktiske)

500

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiesteder

  • Tyskland
      • Aachen, Tyskland, 52074
        • RWTH Aachen University
      • Baden-Baden, Tyskland, 76532
        • Klinikum Mittelbaden Baden-Baden Balg
      • Berlin, Tyskland
        • Charité - Universitätsmedizin Berlin
      • Bielefeld, Tyskland, 33617
        • Evangelisches Krankenhaus Bethel gGmbH
      • Bonn, Tyskland
        • University Hospital Bonn
      • Bremerhaven, Tyskland, 27574
        • Klinikum Bremerhaven Reinkenheide gGmbH
      • Duesseldorf, Tyskland, 40225
        • Duesseldorf University Hospital
      • Essen, Tyskland, 45147
        • University Hospital Essen
      • Frankfurt, Tyskland, 60590
        • University Hospital Frankfurt
      • Göttingen, Tyskland, 37077
        • University Medical Center Göttingen
      • Hannover, Tyskland, 30625
        • Medical School Hannover
      • Heidelberg, Tyskland, 69120
        • University Hospital Heidelberg
      • Heidenheim, Tyskland
        • Kliniken Landkreis Heidenheim gGmbH
      • Köln, Tyskland
        • University Hospital Koln
      • Leipzig, Tyskland
        • University Hospital Leipzig
      • Luckau, Tyskland, 15926
        • Evangelisches Krankenhaus Luckau gGmbH
      • Munich, Tyskland, 81675
        • University Hospital Rechts der Isar
      • Regensburg, Tyskland, 93053
        • University Hospital of Regensburg
      • Rostock, Tyskland, 18057
        • University of Rostock
      • Tübingen, Tyskland, 72076
        • University Hospital Tübingen
      • Ulm, Tyskland, 89081
        • Ulm University Medical Center

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

18 år til 99 år (Voksen, Ældre voksen)

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Køn, der er berettiget til at studere

Alle

Prøveudtagningsmetode

Ikke-sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Patienter med sepsis eller septisk shock i henhold til de nye sepsis-definitioner (Sepsis-3) med en debut <24 timer er berettiget til undersøgelse.

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • Alder ≥18 år
  • Informeret samtykke
  • Sepsis (med indtræden ≤24 timer): Patienter med en livstruende organdysfunktion forårsaget af et dysreguleret værtsrespons på en formodet eller påvist infektion. Organdysfunktion kan identificeres som en akut ændring i den samlede SOFA-score ≥2 point som følge af infektionen. Patienter kan også straks identificeres ved sengekanten med qSOFA, dvs. ændring i mental status, systolisk blodtryk ≤100 mmHg eller respirationsfrekvens ≥22/min.
  • eller septisk shock (med indtræden ≤24 timer): Patienter med septisk shock kan identificeres med en klinisk konstruktion af sepsis med vedvarende hypotension, der kræver vasopressorer for at opretholde middelarterielt tryk (MAP) ≥65 mmHg og har et serumlaktatniveau >2mmol/L ( 18mg/dL) trods tilstrækkelig volumen genoplivning.

Ekskluderingskriterier:

  • Alder ≤18 år
  • Afvisning af samtykke
  • Patienten vil sandsynligvis blive udskrevet fra intensivafdelingen inden for de første 72 timer efter inklusion
  • Palliativ behandling hensigt
  • Klinikeren er ikke forpligtet til aggressiv behandling
  • Døden anses for nært forestående og uundgåelig
  • Patienter, der tidligere har været inkluderet, men genindlagt på intensivafdelingen under samme indlæggelse, vil ikke blive inkluderet anden gang.

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

  • Observationsmodeller: Kohorte
  • Tidsperspektiver: Fremadrettet

Kohorter og interventioner

Gruppe / kohorte
Intervention / Behandling
Sepsis gruppe
Patienter (n=500) med mistanke om eller påvist sepsis eller septisk shock (ifølge Sepsis-3 definitionerne).
Diagnostisk test: Næste generations sekvensering
Hos 500 patienter med mistanke om eller påvist sepsis eller septisk shock (ifølge Sepsis-3-definitionerne), vil patienternes karakteristika og rutinemæssige blodparametre blive bestemt ved sepsis-debut samt 72 timer efter. På samme tidspunkt vil der blive indsamlet 2 sæt blodkulturer og et blodrør til Next-Generation Sequencing (NGS)-diagnostik. En evaluering af resultatet vil blive udført 28 dage efter sepsis debut.

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Sensitivitet [%] (af den NGS-baserede SIQ-score sammenlignet med blodkulturdiagnostik, som guldstandarden for identifikation af det forårsagende patogen i sepsis)
Tidsramme: 2 år
Andel af positive, der er korrekt identificeret som sådan.
2 år
Specificitet [%] (af den NGS-baserede SIQ-score sammenlignet med blodkulturdiagnostik, som guldstandarden for identifikation af det forårsagende patogen i sepsis)
Tidsramme: 2 år
Andel af negativer, der er korrekt identificeret som sådan.
2 år
Positiv prædiktiv værdi [%] (af den NGS-baserede SIQ-score sammenlignet med blodkulturdiagnostik, som guldstandarden for identifikation af det forårsagende patogen i sepsis)
Tidsramme: 2 år
Andel af positive, der er sandt positive.
2 år
Negativ prædiktiv værdi [%] (af den NGS-baserede SIQ-score sammenlignet med blodkulturdiagnostik, som guldstandarden for identifikation af det forårsagende patogen i sepsis)
Tidsramme: 2 år
Andel af negative, der er sandt negative.
2 år
Cohens kappa-koefficient [ingen måleenhed; 0</=k</=1] (af den NGS-baserede SIQ-score i sammenligning med blodkulturdiagnostik, som guldstandarden for identifikation af det forårsagende patogen i sepsis)
Tidsramme: 2 år
Måling af interobservatør-aftalen mellem begge elementer.
2 år

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Plausibilitet [%] (af den NGS-baserede SIQ-score)
Tidsramme: 2,5 år
Ved at bruge en flertalsregel vil SIQ-score resultater blive evalueret for plausibilitet af et panel af tre uafhængige kliniske specialister, der ikke er tilknyttet undersøgelsesstedet. Derfor vil panelet blive forsynet med kliniske case-resuméer, NGS-resultater og standard-of-care-resultater fra alle testede prøver. Resultater af mikrobiologisk rutinediagnostik i prøver, der er forskellige fra blod (f.eks. kropsvæske, væv, bronchoalveolær lavage, endotracheal aspirat) vil blive inkluderet, når de er opnået inden for en tidsramme på ≤72 timer før eller efter tidspunkterne for NGS-baserede målinger.
2,5 år
Ændringer i behandlingen [%] (der kan være opstået, hvis den NGS-baserede SIQ-score havde været tilgængelig til klinisk brug)
Tidsramme: 2,5 år
Ved at bruge en flertalsregel vil den kliniske værdi af den NGS-baserede tilgang blive estimeret af et panel af tre uafhængige kliniske specialister, der ikke er tilknyttet undersøgelsesstedet, og retrospektivt identificere potentielle ændringer i patienters behandling baseret på NGS-resultater. Derfor vil panelet blive forsynet med kliniske case-resuméer, NGS-resultater og standard-of-care-resultater fra alle testede prøver. Resultater af mikrobiologisk rutinediagnostik i prøver, der er forskellige fra blod (f.eks. kropsvæske, væv, bronchoalveolær lavage, endotracheal aspirat) vil blive inkluderet, når de er opnået inden for en tidsramme på ≤72 timer før eller efter tidspunkterne for NGS-baserede målinger. For at identificere potentielle ændringer i antimikrobiel behandling, der kan være opstået, hvis resultaterne fra NGS-teknologien havde været tilgængelige til klinisk brug, vil panelet få udleveret et særligt spørgeskema.
2,5 år

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Sponsor

University Hospital Heidelberg

Samarbejdspartnere

Fraunhofer Institute for Interfacial Engineering and Biotechnology
Dietmar Hopp Stiftung GmbH

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: Thorsten Brenner, MD, University Hospital, Essen

Publikationer og nyttige links

Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.

Generelle publikationer

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

1. marts 2019

Primær færdiggørelse (Faktiske)

31. august 2021

Studieafslutning (Faktiske)

30. september 2021

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

19. november 2017

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

22. november 2017

Først opslået (Faktiske)

29. november 2017

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

18. maj 2022

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

17. maj 2022

Sidst verificeret

1. maj 2022

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Nøgleord

Yderligere relevante MeSH-vilkår

Andre undersøgelses-id-numre

  • S-084/2017

Plan for individuelle deltagerdata (IPD)

Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?

Ingen

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Sepsis

Kliniske forsøg med Næste generations sekvensering

Søg i lignende forsøg

Sponsorer og samarbejdspartnere

Medicinske tilstande

Narkotikainterventioner

CROs by country

CROs in Slovenia

Betingelser

Sjældne sygdomme

Narkotikainterventioner

Kosttilskud

Sponsor / samarbejdspartnere

Placeringer

Abonner