Nästa generations sekvensering Detektion av borrelia

Next Generation Sequencing kan sekvensera miljontals små DNA-strängar från ett enda blodprov, vilket potentiellt kan förbättra dess känslighet jämfört med PCR-testning, som bara upptäcker förutbestämda större DNA-strängar. Vi kommer att testa förmågan hos NGS att upptäcka Borrelia burgdorferi DNA i blodet hos pediatriska patienter med borrelia. Vi kommer att genomföra en observationsstudie av NGS-testning på pediatriska patienter i alla stadier av borrelia. Studieinblandning kommer att kräva ett enda studiebesök för insamling av klinisk data och blodtagning. Vi kommer att registrera patienter i alla faser av misstänkt borrelia, samla in kliniskt relevant information och testa för borrelia med hjälp av Next Generation Sequencing och standard borrelia-serologiska tester. Om patienten har flera erythema migrans, borrelia-meningit, ansiktsnervspares, artrit eller kardit, skickas också en B. burgdorferi serum-PCR. Inskrivning och nästa generations sekvensering av blodtagning kommer att ske före eller upp till 24 timmar efter att den första dosen av antibiotika har administrerats. Vi kommer också att studera antibiotikas inverkan på NGS-testning genom att köra testet 6-24 timmar efter att antibiotika påbörjats bland en liten delmängd av patienter med multipelt erythema migrans-utslag. Insamlad data kommer att analyseras med grundläggande beskrivande statistik.