- ICH GCP
- Amerikanska kliniska prövningsregistret
- Klinisk prövning NCT03589079
Avgränsning av nya monogena sjukdomar i befolkningen i Förenade Arabemiraten
Avgränsning av nya monogena sjukdomar i Förenade Arabemiraten
Studieöversikt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljerad beskrivning
Monogena störningar härrör från en enda defekt gen och ärvs enligt Mendels lagar (mendelska störningar). Sådana gendefekter uppstår från en mutation som antingen kan ärvas eller uppstå spontant; båda kan inträffa i frånvaro av en tidigare familjehistoria. Ärvda mutationer kan vara dominanta eller recessiva och autosomala eller könsbundna. Enligt WHO, även om de är individuellt sällsynta, drabbar kollektivt monogena sjukdomar miljontals människor över hela världen. För närvarande uppskattas över 10 000 mänskliga sjukdomar vara monogena. Fram till nyligen har identifieringen av de genetiska orsakerna, särskilt av extremt sällsynta fenotyper, inte varit möjlig eller kostnadseffektiv på grund av de vetenskapliga utmaningarna med att identifiera orsaksmutationer genom länkanalys. Tillkomsten av kostnadseffektiv nästa generations sekvensering underlättar nu identifieringen av alla sällsynta varianter över hela genomet, vilket i sin tur tillåter mutationsidentifiering i små familjer och, om de novo, även i enstaka fall.
Den kliniska tillämpningen av enstaka gensekvensering ger potentiellt påtagliga fördelar för patienter, informerar diagnos och prognos, och kan vägleda behandlingsval. Nästa generations sekvenseringspaneler (NGS) sekvenserar flera gener parallellt och går nu in i den kliniska domänen. NGS ger betydande fördelar jämfört med enkel gensekvensering för tillstånd som är genetiskt heterogena, såsom epilepsi. Men eftersom fler gener ingår i en NGS-panel, ökar möjligheten för tillfälliga fynd avsevärt, med tillhörande utmaningar i resultattolkningen. Eftersom många tillstånd är fenotypiskt såväl som genetiskt heterogena, är förvärv av detaljerad fenotypisk information väsentligt för meningsfull tolkning av NGS-resultat.
Monogena (mendelska) störningar har historiskt sett tillhandahållit det tydligaste sättet att belysa mänskliga genfunktioner. Kopplingen av en sällsynt DNA-variant till förändrad proteinfunktion eller dos till diskret fenotyp har viktiga implikationer för fundamental biologi, monogen sjukdomspatogenes, komplexa egenskaper, diagnostik och terapi. Genom att representera den mest lätttolkbara komponenten av mänsklig genetik för att definiera en tydlig fenotyp med hög penetrans som uppstår från förändring i funktion av en enskild gen, kan studier av monogena sjukdomar identifiera den genetiska grunden för nya eller existerande fenotyper och ge insikter i icke-redundanta biologiska vägar som kan informera om terapeutisk målinriktning för både den specifika sällsynta varianten och vanliga sjukdomar. Följaktligen är det primära syftet med detta program att identifiera nya monogena fenotyper och upptäcka underliggande kausala genetiska varianter genom genetisk sekvensering i familjer över hela UAE.
Studietyp
Inskrivning (Förväntat)
Kontakter och platser
Studieorter
-
-
-
Abu Dhabi, Förenade arabemiraten, 48338
- Rekrytering
- Imperial College London Diabetes Centre
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
- Barn
- Vuxen
- Äldre vuxen
Tar emot friska volontärer
Kön som är behöriga för studier
Testmetod
Studera befolkning
Deltagarna kommer att uppvisa kliniska fenotyper som tyder på en underliggande ny monogen sjukdom, med/utan närvaro av familjärt återfall av fenotypen och/eller förälders släktskap.
Stamtavlor av särskilt intresse (i prioritetsordning) kommer att inkludera:
- Släktsläkter, helst där en eller flera familjemedlemmar är drabbade
- De novo baserad - dvs trios av proband och båda föräldrar, där endast probanden uppvisar fenotypen
- Autosomal recessiv
- Autosomal dominant, om än med en stor släkt (t.ex. helst 6-8 drabbade medlemmar i 2-3 generationer)
Beskrivning
Inklusionskriterier:
Specifik fenotyp - Fenotyper av intresse som tyder på en underliggande ny genetisk störning:
- Ovanliga presentationer av vanliga störningar, t.ex. med tydligt definierade syndrom/dysmorfa drag*.
- Extrema fenotypiska presentationer.
- Helt nya, tidigare odefinierade fenotyper.
Familjehistoria/stamtavla - Fenotyp som misstänks bero på en enskild genetisk mutation (de novo eller ärvd) baserad, där tillgänglig, på någon av:
- Förekomst av syndromiska/dysmorfa egenskaper.
- Familjehistoria av liknande presentationer hos andra släktingar.
- Mönster för arv.
- Förälders släktskap.
Klinisk tolkning – där tillgänglig (dvs. inte obligatoriskt men kommer att öka förtroendet för lämplighet), förekomsten av kliniska och/eller undersökningsresultat som överensstämmer med en ny ärftlig/monogen sjukdom:
- Uteslutning av icke-genetiska förvärvade orsaker – t.ex. de med en tydlig historia av trolig miljöorsak.
- Genotyp negativ för kända gener som ligger bakom störningen/fenotypen.
- Samtycke - Deltagare (eller förälder/vårdnadshavare om den är under 18 år) som vill och kan ge informerat samtycke för deltagande i studien som proband (man/kvinna), förälder i en trio eller utökad familjemedlem.
Exklusions kriterier:
- Deltagaren eller deras vårdnadshavare/rättsliga ombud är ovillig eller oförmögen att ge informerat samtycke. I de fall där en potentiell barndeltagare har förmåga att samtycka men vägrar att delta, kommer barnets vilja att respekteras.
- Deltagare som redan har genomgått genotypning/panel/laboratorietester (t.ex. för kända medfödda metabolismfel) och har ett definierat/diagnostiserat genetiskt tillstånd.
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
- Observationsmodeller: Kohort
- Tidsperspektiv: Tvärsnitt
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Monogen sjukdom
Deltagare som uppvisar kliniska fenotyper som tyder på en underliggande ny monogen sjukdom, med/utan närvaro av familjärt återfall av fenotypen och/eller förälders släktskap kommer att inkluderas.
Sanger och/eller Next generation Sequencing (NGS) - Panel/WES/WGS-metoder kommer att användas för att underlätta identifiering av de novo/ärvda varianter i barnet/probbandet.
|
NGS-panel, hel exom/genomsekvensering (WES/WGS)
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Ny fenotyp och genupptäckt
Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
|
Identifiering och karakterisering av nya monogena fenotyper från specifika stamtavlor. Opartisk identifiering av nya, sällsynta sjukdomsframkallande gener genom tillämpning av genetiska sekvenseringsmetoder på nya eller etablerade fenotyper. |
genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Generera nya biologiska insikter
Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
|
Få insikter i de patologiska mekanismerna (kända eller nya nedströms sjukdomsvägar) bakom monogen sjukdom och mer allmänt till vanliga/komplexa sjukdomar, förutom grundläggande insikter om fysiologisk genfunktion.
|
genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
|
|
Modifierande gener av monogena sjukdomar
Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
|
Identifiera modifierande gener för monogena sjukdomar - för att hjälpa förståelsen av fenotypisk heterogenitet av mendelska sjukdomar.
|
genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
|
|
Potentiella nya terapeutiska mål
Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
|
Identifiera potentiella nya terapeutiska mål - utnyttja dessa insikter för att identifiera robusta, genetiskt definierade potentiella molekylära och cellulära läkemedelsmål (relaterade till den primära genen och/eller modifierande generna) för behandling av sällsynta (föräldralösa) och/eller vanliga sjukdomar.
|
genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
|
|
Genfunktion och målvalidering
Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
|
Om det är möjligt, bestäm den funktionella effekten av identifierade patogena varianter och validera sjukdomsmekanismbaserade mål genom användning av prekliniska (in vitro/in vivo) och/eller tidiga experimentella studier på människa.
|
genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
|
Samarbetspartners och utredare
Utredare
- Huvudutredare: Houman Ashrafian, DPhil FRCP, University of Oxford
Publikationer och användbara länkar
Allmänna publikationer
- 1- Chial H. Rare Genetic Disorders: Learning About Genetic Disease Through Gene Mapping, SNPs, and Microarray Data. Nature Education 2008;1(1):192.
- 2- Genes and human disease. World Heath Organization 2017. Retrieved from http://www.who.int/genomics/public/geneticdiseases/en/index2.html
- Ku CS, Cooper DN, Patrinos GP. The Rise and Rise of Exome Sequencing. Public Health Genomics. 2016;19(6):315-324. doi: 10.1159/000450991. Epub 2016 Nov 30.
- Mefford HC. Clinical Genetic Testing in Epilepsy. Epilepsy Curr. 2015 Jul-Aug;15(4):197-201. doi: 10.5698/1535-7511-15.4.197.
- de Ligt J, Willemsen MH, van Bon BW, Kleefstra T, Yntema HG, Kroes T, Vulto-van Silfhout AT, Koolen DA, de Vries P, Gilissen C, del Rosario M, Hoischen A, Scheffer H, de Vries BB, Brunner HG, Veltman JA, Vissers LE. Diagnostic exome sequencing in persons with severe intellectual disability. N Engl J Med. 2012 Nov 15;367(20):1921-9. doi: 10.1056/NEJMoa1206524. Epub 2012 Oct 3.
- Della Mina E, Ciccone R, Brustia F, Bayindir B, Limongelli I, Vetro A, Iascone M, Pezzoli L, Bellazzi R, Perotti G, De Giorgis V, Lunghi S, Coppola G, Orcesi S, Merli P, Savasta S, Veggiotti P, Zuffardi O. Improving molecular diagnosis in epilepsy by a dedicated high-throughput sequencing platform. Eur J Hum Genet. 2015 Mar;23(3):354-62. doi: 10.1038/ejhg.2014.92. Epub 2014 May 21.
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
Primärt slutförande (Förväntat)
Avslutad studie (Förväntat)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (Faktisk)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Nyckelord
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- IREC038
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
produkt tillverkad i och exporterad från U.S.A.
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .