Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Avgränsning av nya monogena sjukdomar i befolkningen i Förenade Arabemiraten

11 februari 2020 uppdaterad av: Imperial College London Diabetes Centre

Avgränsning av nya monogena sjukdomar i Förenade Arabemiraten

Studien syftar till att identifiera nya monogena fenotyper från specifika stamtavlor och upptäcka den bakomliggande kausala genetiska varianten med hjälp av genetisk sekvensering (Sanger och/eller Next Generation Sequencing - Panel/WES/WGS) metoder i familjer över Förenade Arabemiraten (UAE).

Studieöversikt

Detaljerad beskrivning

Monogena störningar härrör från en enda defekt gen och ärvs enligt Mendels lagar (mendelska störningar). Sådana gendefekter uppstår från en mutation som antingen kan ärvas eller uppstå spontant; båda kan inträffa i frånvaro av en tidigare familjehistoria. Ärvda mutationer kan vara dominanta eller recessiva och autosomala eller könsbundna. Enligt WHO, även om de är individuellt sällsynta, drabbar kollektivt monogena sjukdomar miljontals människor över hela världen. För närvarande uppskattas över 10 000 mänskliga sjukdomar vara monogena. Fram till nyligen har identifieringen av de genetiska orsakerna, särskilt av extremt sällsynta fenotyper, inte varit möjlig eller kostnadseffektiv på grund av de vetenskapliga utmaningarna med att identifiera orsaksmutationer genom länkanalys. Tillkomsten av kostnadseffektiv nästa generations sekvensering underlättar nu identifieringen av alla sällsynta varianter över hela genomet, vilket i sin tur tillåter mutationsidentifiering i små familjer och, om de novo, även i enstaka fall.

Den kliniska tillämpningen av enstaka gensekvensering ger potentiellt påtagliga fördelar för patienter, informerar diagnos och prognos, och kan vägleda behandlingsval. Nästa generations sekvenseringspaneler (NGS) sekvenserar flera gener parallellt och går nu in i den kliniska domänen. NGS ger betydande fördelar jämfört med enkel gensekvensering för tillstånd som är genetiskt heterogena, såsom epilepsi. Men eftersom fler gener ingår i en NGS-panel, ökar möjligheten för tillfälliga fynd avsevärt, med tillhörande utmaningar i resultattolkningen. Eftersom många tillstånd är fenotypiskt såväl som genetiskt heterogena, är förvärv av detaljerad fenotypisk information väsentligt för meningsfull tolkning av NGS-resultat.

Monogena (mendelska) störningar har historiskt sett tillhandahållit det tydligaste sättet att belysa mänskliga genfunktioner. Kopplingen av en sällsynt DNA-variant till förändrad proteinfunktion eller dos till diskret fenotyp har viktiga implikationer för fundamental biologi, monogen sjukdomspatogenes, komplexa egenskaper, diagnostik och terapi. Genom att representera den mest lätttolkbara komponenten av mänsklig genetik för att definiera en tydlig fenotyp med hög penetrans som uppstår från förändring i funktion av en enskild gen, kan studier av monogena sjukdomar identifiera den genetiska grunden för nya eller existerande fenotyper och ge insikter i icke-redundanta biologiska vägar som kan informera om terapeutisk målinriktning för både den specifika sällsynta varianten och vanliga sjukdomar. Följaktligen är det primära syftet med detta program att identifiera nya monogena fenotyper och upptäcka underliggande kausala genetiska varianter genom genetisk sekvensering i familjer över hela UAE.

Studietyp

Observationell

Inskrivning (Förväntat)

150

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studieorter

      • Abu Dhabi, Förenade arabemiraten, 48338
        • Rekrytering
        • Imperial College London Diabetes Centre

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

  • Barn
  • Vuxen
  • Äldre vuxen

Tar emot friska volontärer

Nej

Kön som är behöriga för studier

Allt

Testmetod

Sannolikhetsprov

Studera befolkning

Deltagarna kommer att uppvisa kliniska fenotyper som tyder på en underliggande ny monogen sjukdom, med/utan närvaro av familjärt återfall av fenotypen och/eller förälders släktskap.

Stamtavlor av särskilt intresse (i prioritetsordning) kommer att inkludera:

  • Släktsläkter, helst där en eller flera familjemedlemmar är drabbade
  • De novo baserad - dvs trios av proband och båda föräldrar, där endast probanden uppvisar fenotypen
  • Autosomal recessiv
  • Autosomal dominant, om än med en stor släkt (t.ex. helst 6-8 drabbade medlemmar i 2-3 generationer)

Beskrivning

Inklusionskriterier:

  • Specifik fenotyp - Fenotyper av intresse som tyder på en underliggande ny genetisk störning:

    1. Ovanliga presentationer av vanliga störningar, t.ex. med tydligt definierade syndrom/dysmorfa drag*.
    2. Extrema fenotypiska presentationer.
    3. Helt nya, tidigare odefinierade fenotyper.
  • Familjehistoria/stamtavla - Fenotyp som misstänks bero på en enskild genetisk mutation (de novo eller ärvd) baserad, där tillgänglig, på någon av:

    1. Förekomst av syndromiska/dysmorfa egenskaper.
    2. Familjehistoria av liknande presentationer hos andra släktingar.
    3. Mönster för arv.
    4. Förälders släktskap.
  • Klinisk tolkning – där tillgänglig (dvs. inte obligatoriskt men kommer att öka förtroendet för lämplighet), förekomsten av kliniska och/eller undersökningsresultat som överensstämmer med en ny ärftlig/monogen sjukdom:

    1. Uteslutning av icke-genetiska förvärvade orsaker – t.ex. de med en tydlig historia av trolig miljöorsak.
    2. Genotyp negativ för kända gener som ligger bakom störningen/fenotypen.
  • Samtycke - Deltagare (eller förälder/vårdnadshavare om den är under 18 år) som vill och kan ge informerat samtycke för deltagande i studien som proband (man/kvinna), förälder i en trio eller utökad familjemedlem.

Exklusions kriterier:

  • Deltagaren eller deras vårdnadshavare/rättsliga ombud är ovillig eller oförmögen att ge informerat samtycke. I de fall där en potentiell barndeltagare har förmåga att samtycka men vägrar att delta, kommer barnets vilja att respekteras.
  • Deltagare som redan har genomgått genotypning/panel/laboratorietester (t.ex. för kända medfödda metabolismfel) och har ett definierat/diagnostiserat genetiskt tillstånd.

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

  • Observationsmodeller: Kohort
  • Tidsperspektiv: Tvärsnitt

Kohorter och interventioner

Grupp / Kohort
Intervention / Behandling
Monogen sjukdom
Deltagare som uppvisar kliniska fenotyper som tyder på en underliggande ny monogen sjukdom, med/utan närvaro av familjärt återfall av fenotypen och/eller förälders släktskap kommer att inkluderas. Sanger och/eller Next generation Sequencing (NGS) - Panel/WES/WGS-metoder kommer att användas för att underlätta identifiering av de novo/ärvda varianter i barnet/probbandet.
NGS-panel, hel exom/genomsekvensering (WES/WGS)

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Ny fenotyp och genupptäckt
Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år

Identifiering och karakterisering av nya monogena fenotyper från specifika stamtavlor.

Opartisk identifiering av nya, sällsynta sjukdomsframkallande gener genom tillämpning av genetiska sekvenseringsmetoder på nya eller etablerade fenotyper.

genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år

Sekundära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Generera nya biologiska insikter
Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
Få insikter i de patologiska mekanismerna (kända eller nya nedströms sjukdomsvägar) bakom monogen sjukdom och mer allmänt till vanliga/komplexa sjukdomar, förutom grundläggande insikter om fysiologisk genfunktion.
genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
Modifierande gener av monogena sjukdomar
Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
Identifiera modifierande gener för monogena sjukdomar - för att hjälpa förståelsen av fenotypisk heterogenitet av mendelska sjukdomar.
genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
Potentiella nya terapeutiska mål
Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
Identifiera potentiella nya terapeutiska mål - utnyttja dessa insikter för att identifiera robusta, genetiskt definierade potentiella molekylära och cellulära läkemedelsmål (relaterade till den primära genen och/eller modifierande generna) för behandling av sällsynta (föräldralösa) och/eller vanliga sjukdomar.
genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
Genfunktion och målvalidering
Tidsram: genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år
Om det är möjligt, bestäm den funktionella effekten av identifierade patogena varianter och validera sjukdomsmekanismbaserade mål genom användning av prekliniska (in vitro/in vivo) och/eller tidiga experimentella studier på människa.
genom avslutad studie, i genomsnitt 2 år

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Utredare

  • Huvudutredare: Houman Ashrafian, DPhil FRCP, University of Oxford

Publikationer och användbara länkar

Den som ansvarar för att lägga in information om studien tillhandahåller frivilligt dessa publikationer. Dessa kan handla om allt som har med studien att göra.

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

1 januari 2018

Primärt slutförande (Förväntat)

1 januari 2021

Avslutad studie (Förväntat)

1 januari 2021

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

2 juli 2018

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

16 juli 2018

Första postat (Faktisk)

17 juli 2018

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

12 februari 2020

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

11 februari 2020

Senast verifierad

1 februari 2020

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument

Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt

Nej

Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt

Nej

produkt tillverkad i och exporterad från U.S.A.

Nej

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

Prenumerera