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阿拉伯联合酋长国人口中新型单基因疾病的描述

2020年2月11日 更新者:Imperial College London Diabetes Centre

阿拉伯联合酋长国新型单基因疾病的描述

该研究旨在通过阿拉伯联合酋长国 (UAE) 的家庭中的基因测序(Sanger 和/或下一代测序 - Panel/WES/WGS)方法从特定谱系中识别新的单基因表型并发现潜在的因果遗传变异。

研究概览

详细说明

单基因疾病由单个缺陷基因引起,并根据孟德尔定律(孟德尔疾病)遗传。 这种基因缺陷是由遗传或自发发生的突变引起的;两者都可能在没有家族病史的情况下发生。 遗传突变可以是显性或隐性的,也可以是常染色体或性连锁的。 据世卫组织称,尽管个体罕见,但集体单基因疾病影响着全世界数百万人。 目前,估计有超过 10,000 种人类疾病是单基因疾病。 直到最近,由于通过连锁分析鉴定致病突变的科学挑战,鉴定遗传原因,尤其是极其罕见的表型,是不可能的或成本效益高的。 具有成本效益的下一代测序的出现现在促进了整个基因组中所有稀有变异的识别,反过来允许在小家庭中识别突变,如果从头开始,甚至在单个病例中也是如此。

单基因测序的临床应用可能为患者提供切实的好处,告知诊断和预后,并可能指导治疗选择。 下一代测序 (NGS) panel 对多个基因进行并行测序,现在正进入临床领域。 对于遗传异质性的病症,例如癫痫,NGS 比单基因测序具有显着优势。 然而,随着 NGS panel 中包含更多基因,偶然发现的可能性显着增加,结果解释也面临相关挑战。 由于许多条件具有表型和遗传异质性,因此获取详细的表型信息对于有意义地解释 NGS 结果至关重要。

单基因(孟德尔)疾病在历史上提供了阐明人类基因功能的最清晰的方法。 罕见 DNA 变异与改变的蛋白质功能或剂量与离散表型的联系对基础生物学、单基因疾病发病机制、复杂性状、诊断和治疗具有重要意义。 通过代表人类遗传学中最容易解释的组成部分来定义由单个基因功能改变引起的清晰、高外显率的表型,单基因疾病的研究可以确定新的或现有表型的遗传基础,并提供对非冗余表型的见解可能为特定罕见变异和常见疾病的治疗靶向提供信息的生物学途径。 因此,该计划的主要目的是通过阿联酋家庭的基因测序来识别新的单基因表型并发现潜在的因果遗传变异。

研究类型

观察性的

注册 (预期的)

150

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。

学习地点

      • Abu Dhabi、阿拉伯联合酋长国、48338
        • 招聘中
        • Imperial College London Diabetes Centre

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

  • 孩子
  • 成人
  • 年长者

接受健康志愿者

有资格学习的性别

全部

取样方法

概率样本

研究人群

参与者将表现出提示潜在的新型单基因疾病的临床表型,有/没有表型的家族复发和/或父母血缘关系。

特别感兴趣的谱系(按优先顺序排列)将包括:

  • 近亲家庭,最好是一名或多名家庭成员受到影响
  • 基于 De novo - 即先证者和父母双方的三重奏,其中只有先证者表现出表型
  • 常染色体隐性
  • 常染色体显性遗传,尽管有很大的亲缘关系(例如 最好是 2-3 代中有 6-8 名受影响的成员)

描述

纳入标准:

  • 特定表型 - 提示潜在的新型遗传疾病的感兴趣表型:

    1. 常见疾病的异常表现,例如具有明确定义的综合征/畸形特征*。
    2. 极端表型表现。
    3. 完全新颖的、以前未定义的表型。
  • 家族史/系谱——怀疑是由于单一基因突变(新发或遗传)引起的表型,如果有的话,基于以下任何一项:

    1. 存在综合征/畸形特征。
    2. 其他亲属有类似表现的家族史。
    3. 继承模式。
    4. 父母血亲。
  • 临床解释 - 在可用的情况下(即 不是强制性的,但会增加对适用性的信心),临床和/或调查结果的存在与新的遗传/单基因疾病一致:

    1. 排除非遗传性获得性原因——例如 那些有可能的环境原因的明确历史的人。
    2. 导致疾病/表型的已知基因的基因型呈阴性。
  • 同意 - 参与者(或父母/法定监护人,如果未满 18 岁)愿意并能够以先证者(男性/女性)、三人组的父母或大家庭成员的身份就参与研究给予知情同意。

排除标准:

  • 参与者或其法定监护人/法定代表人不愿意或不能给予知情同意。 如果潜在儿童参与者有能力同意但拒绝参与,将尊重儿童的意愿。
  • 已经接受基因分型/面板/实验室测试(例如已知的先天性代谢错误)并具有确定/诊断的遗传病症的参与者。

学习计划

本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的?

设计细节

  • 观测模型:队列
  • 时间观点:横截面

队列和干预

团体/队列
干预/治疗
单基因疾病
将包括表现出提示潜在的新型单基因疾病的临床表型的参与者,有/没有表型的家族复发和/或父母血缘关系。 Sanger 和/或下一代测序 (NGS) - Panel/WES/WGS 方法将用于促进识别儿童/先证者中的新生/遗传变异。
NGS panel,全外显子组/基因组测序(WES/WGS)

研究衡量的是什么?

主要结果指标

结果测量
措施说明
大体时间
新表型和基因发现
大体时间:通过学习完成,平均 2 年

从特定谱系中鉴定和表征新的单基因表型。

通过将基因测序方法应用于新的或已建立的表型,公正地鉴定新的、罕见的致病基因。

通过学习完成,平均 2 年

次要结果测量

结果测量
措施说明
大体时间
产生新的生物学见解
大体时间:通过学习完成,平均 2 年
除了有关生理基因功能的基本见解外,深入了解单基因疾病和更广泛的常见/复杂疾病的病理机制(已知或新的下游疾病途径)。
通过学习完成,平均 2 年
单基因疾病的修饰基因
大体时间:通过学习完成,平均 2 年
识别单基因疾病的修饰基因 - 以帮助理解孟德尔疾病的表型异质性。
通过学习完成,平均 2 年
潜在的新治疗靶点
大体时间:通过学习完成,平均 2 年
识别潜在的新治疗靶点——利用这些见解来识别强大的、基因定义的潜在分子和细胞药物靶点(与主要基因和/或修饰基因相关),用于治疗罕见(孤儿)和/或常见疾病。
通过学习完成,平均 2 年
基因功能和目标验证
大体时间:通过学习完成,平均 2 年
在可行的情况下,通过使用临床前(体外/体内)和/或早期人体实验研究,确定已识别致病变异的功能影响并验证基于疾病机制的目标。
通过学习完成,平均 2 年

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

调查人员

  • 首席研究员:Houman Ashrafian, DPhil FRCP、University of Oxford

出版物和有用的链接

负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (实际的)

2018年1月1日

初级完成 (预期的)

2021年1月1日

研究完成 (预期的)

2021年1月1日

研究注册日期

首次提交

2018年7月2日

首先提交符合 QC 标准的

2018年7月16日

首次发布 (实际的)

2018年7月17日

研究记录更新

最后更新发布 (实际的)

2020年2月12日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2020年2月11日

最后验证

2020年2月1日

更多信息

与本研究相关的术语

其他相关的 MeSH 术语

其他研究编号

  • IREC038

药物和器械信息、研究文件

研究美国 FDA 监管的药品

研究美国 FDA 监管的设备产品

在美国制造并从美国出口的产品

此信息直接从 clinicaltrials.gov 网站检索,没有任何更改。如果您有任何更改、删除或更新研究详细信息的请求,请联系 register@clinicaltrials.gov. clinicaltrials.gov 上实施更改,我们的网站上也会自动更新.

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