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Délimitation des nouveaux troubles monogéniques dans la population des Émirats arabes unis

11 février 2020 mis à jour par: Imperial College London Diabetes Centre

Délimitation des nouveaux troubles monogéniques aux Émirats arabes unis

L'étude vise à identifier de nouveaux phénotypes monogéniques à partir de pedigrees spécifiques et à découvrir la variante génétique causale sous-jacente à l'aide de méthodologies de séquençage génétique (Sanger et/ou séquençage de nouvelle génération - Panel/WES/WGS) dans des familles des Émirats arabes unis (EAU).

Aperçu de l'étude

Description détaillée

Les troubles monogéniques résultent d'un seul gène défectueux et sont hérités selon les lois de Mendel (troubles mendéliens). De tels défauts génétiques résultent d'une mutation qui peut être héréditaire ou se produire spontanément ; les deux peuvent survenir en l'absence d'antécédents familiaux. Les mutations héréditaires peuvent être dominantes ou récessives, autosomiques ou liées au sexe. Selon l'OMS, bien qu'individuellement rares, les maladies collectivement monogéniques affectent des millions de personnes dans le monde. Actuellement, plus de 10 000 maladies humaines sont estimées être monogéniques. Jusqu'à récemment, l'identification des causes génétiques, en particulier des phénotypes extrêmement rares, n'a pas été possible ou rentable en raison des défis scientifiques liés à l'identification des mutations causales par l'analyse de liaison. L'avènement du séquençage de nouvelle génération rentable facilite désormais l'identification de toutes les variantes rares sur l'ensemble du génome, permettant à son tour l'identification des mutations dans de petites familles et, si de novo, même dans des cas isolés.

L'application clinique du séquençage d'un seul gène offre potentiellement des avantages tangibles aux patients, en éclairant le diagnostic et le pronostic, et peut guider le choix du traitement. Les panels de séquençage de nouvelle génération (NGS) séquencent plusieurs gènes en parallèle et entrent maintenant dans le domaine clinique. Le NGS offre des avantages significatifs par rapport au séquençage d'un seul gène pour des conditions génétiquement hétérogènes, telles que les épilepsies. Cependant, à mesure que davantage de gènes sont inclus dans un panel NGS, la possibilité de découvertes fortuites augmente considérablement, avec des défis associés dans l'interprétation des résultats. Étant donné que de nombreuses conditions sont phénotypiquement et génétiquement hétérogènes, l'acquisition d'informations phénotypiques détaillées est essentielle pour une interprétation significative des résultats NGS.

Les troubles monogéniques (mendéliens) ont historiquement fourni le moyen le plus clair d'élucider la fonction des gènes humains. Le lien entre une variante rare de l'ADN et une fonction protéique altérée ou une dose à un phénotype discret a des implications importantes pour la biologie fondamentale, la pathogenèse de la maladie monogénique, les traits complexes, le diagnostic et la thérapie. En représentant le composant le plus facilement interprétable de la génétique humaine dans la définition d'un phénotype clair et à haute pénétrance résultant de l'altération de la fonction d'un seul gène, l'étude des troubles monogéniques peut identifier la base génétique de phénotypes nouveaux ou existants et fournir des informations sur les phénotypes non redondants. voies biologiques qui peuvent éclairer le ciblage thérapeutique pour la variante rare spécifique et les maladies courantes. En conséquence, l'objectif principal de ce programme est d'identifier de nouveaux phénotypes monogéniques et de découvrir des variantes génétiques causales sous-jacentes par séquençage génétique dans des familles à travers les Émirats arabes unis.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Anticipé)

150

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

      • Abu Dhabi, Emirats Arabes Unis, 48338
        • Recrutement
        • Imperial College London Diabetes Centre

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

  • Enfant
  • Adulte
  • Adulte plus âgé

Accepte les volontaires sains

Non

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

Méthode d'échantillonnage

Échantillon de probabilité

Population étudiée

Les participants présenteront des phénotypes cliniques évocateurs d'un nouveau trouble monogénique sous-jacent, avec/sans la présence d'une récidive familiale du phénotype et/ou de la consanguinité parentale.

Les pedigrees d'intérêt particulier (par ordre de préférence) comprendront :

  • Familles consanguines, idéalement où un ou plusieurs membres de la famille sont touchés
  • De novo - c'est-à-dire des trios de proposants et des deux parents, où seul le proposant présente le phénotype
  • Autosomique récessif
  • Autosomique dominant, mais avec une grande parenté (par ex. idéalement 6-8 membres affectés sur 2-3 générations)

La description

Critère d'intégration:

  • Phénotype spécifique - Phénotypes d'intérêt suggérant une nouvelle maladie génétique sous-jacente :

    1. Présentations inhabituelles de troubles courants, par ex. avec des caractéristiques syndromiques/dysmorphiques clairement définies*.
    2. Présentations phénotypiques extrêmes.
    3. Des phénotypes entièrement nouveaux, jusqu'alors indéfinis.
  • Antécédents familiaux / pedigree - Phénotype suspecté d'être dû à une seule mutation génétique (de novo ou héréditaire) basée, le cas échéant, sur l'un des éléments suivants :

    1. Présence de caractéristiques syndromiques/dysmorphiques.
    2. Antécédents familiaux de présentations similaires chez d'autres parents.
    3. Modèle d'héritage.
    4. Consanguinité parentale.
  • Interprétation clinique - Si disponible (c.-à-d. non obligatoire mais augmentera la confiance dans l'adéquation), la présence de résultats cliniques et/ou d'investigation compatibles avec un nouveau trouble héréditaire/monogène :

    1. Exclusion des causes acquises non génétiques - par ex. ceux qui ont des antécédents clairs de cause environnementale probable.
    2. Génotype négatif pour les gènes connus sous-jacents au trouble/phénotype.
  • Consentement - Participant (ou parent/tuteur légal s'il est âgé de moins de 18 ans) désireux et capable de donner son consentement éclairé pour participer à l'étude en tant que proposant (homme/femme), parent d'un trio ou membre de la famille élargie.

Critère d'exclusion:

  • Le participant ou son tuteur légal/représentant légal ne veut pas ou ne peut pas donner son consentement éclairé. Dans les cas où un enfant participant potentiel a la capacité de consentir mais refuse de participer, la volonté de l'enfant sera respectée.
  • Participant qui a déjà subi un génotypage/un panel/un test de laboratoire (par exemple pour des erreurs innées connues du métabolisme) et qui a une condition génétique définie/diagnostiquée.

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Modèles d'observation: Cohorte
  • Perspectives temporelles: Transversale

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
Trouble monogénique
Les participants présentant des phénotypes cliniques évocateurs d'un nouveau trouble monogénique sous-jacent, avec/sans la présence d'une récidive familiale du phénotype et/ou de la consanguinité parentale seront inclus. Séquençage Sanger et/ou nouvelle génération (NGS) - Des approches Panel/WES/WGS seront utilisées pour faciliter l'identification des variants de novo/hérités chez l'enfant/proband.
Panel NGS, séquençage exome entier / génome (WES/WGS)

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Nouveau phénotype et découverte de gènes
Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans

Identification et caractérisation de nouveaux phénotypes monogéniques à partir de pedigrees spécifiques.

Identification impartiale de nouveaux gènes rares à l'origine de maladies grâce à l'application de méthodologies de séquençage génétique à des phénotypes nouveaux ou établis.

jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Générer de nouvelles connaissances biologiques
Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
Obtenez des informations sur les mécanismes pathologiques (voies pathologiques connues ou nouvelles en aval) sous-jacents à la maladie monogénique et plus largement aux maladies courantes/complexes, en plus des connaissances fondamentales concernant la fonction physiologique des gènes.
jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
Gènes modificateurs des maladies monogéniques
Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
Identifier les gènes modificateurs des troubles monogéniques - pour aider à comprendre l'hétérogénéité phénotypique des troubles mendéliens.
jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
Nouvelles cibles thérapeutiques potentielles
Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
Identifier de nouvelles cibles thérapeutiques potentielles - tirer parti de ces connaissances pour identifier des cibles médicamenteuses moléculaires et cellulaires potentielles robustes et génétiquement définies (liées au gène primaire et/ou aux gènes modificateurs) pour le traitement de maladies rares (orphelines) et/ou courantes.
jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
Fonction du gène et validation de la cible
Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
Dans la mesure du possible, déterminer l'impact fonctionnel des variantes pathogènes identifiées et valider les cibles basées sur le mécanisme de la maladie grâce à l'utilisation d'études précliniques (in vitro/in vivo) et/ou expérimentales humaines précoces.
jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Houman Ashrafian, DPhil FRCP, University of Oxford

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

1 janvier 2018

Achèvement primaire (Anticipé)

1 janvier 2021

Achèvement de l'étude (Anticipé)

1 janvier 2021

Dates d'inscription aux études

Première soumission

2 juillet 2018

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

16 juillet 2018

Première publication (Réel)

17 juillet 2018

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

12 février 2020

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

11 février 2020

Dernière vérification

1 février 2020

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

produit fabriqué et exporté des États-Unis.

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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