- ICH GCP
- Registre américain des essais cliniques
- Essai clinique NCT03589079
Délimitation des nouveaux troubles monogéniques dans la population des Émirats arabes unis
Délimitation des nouveaux troubles monogéniques aux Émirats arabes unis
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Intervention / Traitement
Description détaillée
Les troubles monogéniques résultent d'un seul gène défectueux et sont hérités selon les lois de Mendel (troubles mendéliens). De tels défauts génétiques résultent d'une mutation qui peut être héréditaire ou se produire spontanément ; les deux peuvent survenir en l'absence d'antécédents familiaux. Les mutations héréditaires peuvent être dominantes ou récessives, autosomiques ou liées au sexe. Selon l'OMS, bien qu'individuellement rares, les maladies collectivement monogéniques affectent des millions de personnes dans le monde. Actuellement, plus de 10 000 maladies humaines sont estimées être monogéniques. Jusqu'à récemment, l'identification des causes génétiques, en particulier des phénotypes extrêmement rares, n'a pas été possible ou rentable en raison des défis scientifiques liés à l'identification des mutations causales par l'analyse de liaison. L'avènement du séquençage de nouvelle génération rentable facilite désormais l'identification de toutes les variantes rares sur l'ensemble du génome, permettant à son tour l'identification des mutations dans de petites familles et, si de novo, même dans des cas isolés.
L'application clinique du séquençage d'un seul gène offre potentiellement des avantages tangibles aux patients, en éclairant le diagnostic et le pronostic, et peut guider le choix du traitement. Les panels de séquençage de nouvelle génération (NGS) séquencent plusieurs gènes en parallèle et entrent maintenant dans le domaine clinique. Le NGS offre des avantages significatifs par rapport au séquençage d'un seul gène pour des conditions génétiquement hétérogènes, telles que les épilepsies. Cependant, à mesure que davantage de gènes sont inclus dans un panel NGS, la possibilité de découvertes fortuites augmente considérablement, avec des défis associés dans l'interprétation des résultats. Étant donné que de nombreuses conditions sont phénotypiquement et génétiquement hétérogènes, l'acquisition d'informations phénotypiques détaillées est essentielle pour une interprétation significative des résultats NGS.
Les troubles monogéniques (mendéliens) ont historiquement fourni le moyen le plus clair d'élucider la fonction des gènes humains. Le lien entre une variante rare de l'ADN et une fonction protéique altérée ou une dose à un phénotype discret a des implications importantes pour la biologie fondamentale, la pathogenèse de la maladie monogénique, les traits complexes, le diagnostic et la thérapie. En représentant le composant le plus facilement interprétable de la génétique humaine dans la définition d'un phénotype clair et à haute pénétrance résultant de l'altération de la fonction d'un seul gène, l'étude des troubles monogéniques peut identifier la base génétique de phénotypes nouveaux ou existants et fournir des informations sur les phénotypes non redondants. voies biologiques qui peuvent éclairer le ciblage thérapeutique pour la variante rare spécifique et les maladies courantes. En conséquence, l'objectif principal de ce programme est d'identifier de nouveaux phénotypes monogéniques et de découvrir des variantes génétiques causales sous-jacentes par séquençage génétique dans des familles à travers les Émirats arabes unis.
Type d'étude
Inscription (Anticipé)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
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Abu Dhabi, Emirats Arabes Unis, 48338
- Recrutement
- Imperial College London Diabetes Centre
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
- Enfant
- Adulte
- Adulte plus âgé
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
Les participants présenteront des phénotypes cliniques évocateurs d'un nouveau trouble monogénique sous-jacent, avec/sans la présence d'une récidive familiale du phénotype et/ou de la consanguinité parentale.
Les pedigrees d'intérêt particulier (par ordre de préférence) comprendront :
- Familles consanguines, idéalement où un ou plusieurs membres de la famille sont touchés
- De novo - c'est-à-dire des trios de proposants et des deux parents, où seul le proposant présente le phénotype
- Autosomique récessif
- Autosomique dominant, mais avec une grande parenté (par ex. idéalement 6-8 membres affectés sur 2-3 générations)
La description
Critère d'intégration:
Phénotype spécifique - Phénotypes d'intérêt suggérant une nouvelle maladie génétique sous-jacente :
- Présentations inhabituelles de troubles courants, par ex. avec des caractéristiques syndromiques/dysmorphiques clairement définies*.
- Présentations phénotypiques extrêmes.
- Des phénotypes entièrement nouveaux, jusqu'alors indéfinis.
Antécédents familiaux / pedigree - Phénotype suspecté d'être dû à une seule mutation génétique (de novo ou héréditaire) basée, le cas échéant, sur l'un des éléments suivants :
- Présence de caractéristiques syndromiques/dysmorphiques.
- Antécédents familiaux de présentations similaires chez d'autres parents.
- Modèle d'héritage.
- Consanguinité parentale.
Interprétation clinique - Si disponible (c.-à-d. non obligatoire mais augmentera la confiance dans l'adéquation), la présence de résultats cliniques et/ou d'investigation compatibles avec un nouveau trouble héréditaire/monogène :
- Exclusion des causes acquises non génétiques - par ex. ceux qui ont des antécédents clairs de cause environnementale probable.
- Génotype négatif pour les gènes connus sous-jacents au trouble/phénotype.
- Consentement - Participant (ou parent/tuteur légal s'il est âgé de moins de 18 ans) désireux et capable de donner son consentement éclairé pour participer à l'étude en tant que proposant (homme/femme), parent d'un trio ou membre de la famille élargie.
Critère d'exclusion:
- Le participant ou son tuteur légal/représentant légal ne veut pas ou ne peut pas donner son consentement éclairé. Dans les cas où un enfant participant potentiel a la capacité de consentir mais refuse de participer, la volonté de l'enfant sera respectée.
- Participant qui a déjà subi un génotypage/un panel/un test de laboratoire (par exemple pour des erreurs innées connues du métabolisme) et qui a une condition génétique définie/diagnostiquée.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cohorte
- Perspectives temporelles: Transversale
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
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Trouble monogénique
Les participants présentant des phénotypes cliniques évocateurs d'un nouveau trouble monogénique sous-jacent, avec/sans la présence d'une récidive familiale du phénotype et/ou de la consanguinité parentale seront inclus.
Séquençage Sanger et/ou nouvelle génération (NGS) - Des approches Panel/WES/WGS seront utilisées pour faciliter l'identification des variants de novo/hérités chez l'enfant/proband.
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Panel NGS, séquençage exome entier / génome (WES/WGS)
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Nouveau phénotype et découverte de gènes
Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
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Identification et caractérisation de nouveaux phénotypes monogéniques à partir de pedigrees spécifiques. Identification impartiale de nouveaux gènes rares à l'origine de maladies grâce à l'application de méthodologies de séquençage génétique à des phénotypes nouveaux ou établis. |
jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Générer de nouvelles connaissances biologiques
Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
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Obtenez des informations sur les mécanismes pathologiques (voies pathologiques connues ou nouvelles en aval) sous-jacents à la maladie monogénique et plus largement aux maladies courantes/complexes, en plus des connaissances fondamentales concernant la fonction physiologique des gènes.
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jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
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Gènes modificateurs des maladies monogéniques
Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
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Identifier les gènes modificateurs des troubles monogéniques - pour aider à comprendre l'hétérogénéité phénotypique des troubles mendéliens.
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jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
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Nouvelles cibles thérapeutiques potentielles
Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
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Identifier de nouvelles cibles thérapeutiques potentielles - tirer parti de ces connaissances pour identifier des cibles médicamenteuses moléculaires et cellulaires potentielles robustes et génétiquement définies (liées au gène primaire et/ou aux gènes modificateurs) pour le traitement de maladies rares (orphelines) et/ou courantes.
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jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
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Fonction du gène et validation de la cible
Délai: jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
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Dans la mesure du possible, déterminer l'impact fonctionnel des variantes pathogènes identifiées et valider les cibles basées sur le mécanisme de la maladie grâce à l'utilisation d'études précliniques (in vitro/in vivo) et/ou expérimentales humaines précoces.
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jusqu'à la fin des études, en moyenne 2 ans
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Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Houman Ashrafian, DPhil FRCP, University of Oxford
Publications et liens utiles
Publications générales
- 1- Chial H. Rare Genetic Disorders: Learning About Genetic Disease Through Gene Mapping, SNPs, and Microarray Data. Nature Education 2008;1(1):192.
- 2- Genes and human disease. World Heath Organization 2017. Retrieved from http://www.who.int/genomics/public/geneticdiseases/en/index2.html
- Ku CS, Cooper DN, Patrinos GP. The Rise and Rise of Exome Sequencing. Public Health Genomics. 2016;19(6):315-324. doi: 10.1159/000450991. Epub 2016 Nov 30.
- Mefford HC. Clinical Genetic Testing in Epilepsy. Epilepsy Curr. 2015 Jul-Aug;15(4):197-201. doi: 10.5698/1535-7511-15.4.197.
- de Ligt J, Willemsen MH, van Bon BW, Kleefstra T, Yntema HG, Kroes T, Vulto-van Silfhout AT, Koolen DA, de Vries P, Gilissen C, del Rosario M, Hoischen A, Scheffer H, de Vries BB, Brunner HG, Veltman JA, Vissers LE. Diagnostic exome sequencing in persons with severe intellectual disability. N Engl J Med. 2012 Nov 15;367(20):1921-9. doi: 10.1056/NEJMoa1206524. Epub 2012 Oct 3.
- Della Mina E, Ciccone R, Brustia F, Bayindir B, Limongelli I, Vetro A, Iascone M, Pezzoli L, Bellazzi R, Perotti G, De Giorgis V, Lunghi S, Coppola G, Orcesi S, Merli P, Savasta S, Veggiotti P, Zuffardi O. Improving molecular diagnosis in epilepsy by a dedicated high-throughput sequencing platform. Eur J Hum Genet. 2015 Mar;23(3):354-62. doi: 10.1038/ejhg.2014.92. Epub 2014 May 21.
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Anticipé)
Achèvement de l'étude (Anticipé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- IREC038
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
produit fabriqué et exporté des États-Unis.
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