- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT03589079
Afgrænsning af nye monogene lidelser i befolkningen i De Forenede Arabiske Emirater
Afgrænsning af nye monogene lidelser i De Forenede Arabiske Emirater
Studieoversigt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Monogene lidelser skyldes et enkelt defekt gen og nedarves i henhold til Mendels love (mendelske lidelser). Sådanne gendefekter opstår fra en mutation, der enten kan nedarves eller opstå spontant; begge kan forekomme i mangel af en tidligere familiehistorie. Arvelige mutationer kan være dominante eller recessive og autosomale eller kønsbundne. Ifølge WHO påvirker kollektivt monogene lidelser millioner af mennesker verden over, selv om de er individuelt sjældne. I øjeblikket vurderes over 10.000 menneskelige sygdomme at være monogene. Indtil for nylig har identifikation af de genetiske årsager, især af ekstremt sjældne fænotyper, ikke været mulig eller omkostningseffektiv på grund af de videnskabelige udfordringer med at identificere kausative mutationer gennem koblingsanalyse. Fremkomsten af omkostningseffektiv næste generations sekventering letter nu identifikation af alle sjældne varianter på tværs af hele genomet, hvilket igen muliggør mutationsidentifikation i små familier og, hvis de novo, selv i enkelte tilfælde.
Den kliniske anvendelse af enkelt-gen-sekventering giver potentielt håndgribelige fordele for patienter, informerer diagnose og prognose og kan vejlede behandlingsvalg. Næste generations sekventeringspaneler (NGS) sekventerer flere gener parallelt og går nu ind i det kliniske domæne. NGS giver betydelige fordele i forhold til enkeltgensekventering for tilstande, der er genetisk heterogene, såsom epilepsierne. Men efterhånden som flere gener indgår i et NGS-panel, stiger muligheden for tilfældige fund markant med tilhørende udfordringer i resultatfortolkningen. Da mange tilstande er fænotypisk såvel som genetisk heterogene, er erhvervelse af detaljeret fænotypisk information afgørende for meningsfuld fortolkning af NGS-resultater.
Monogene (mendelske) lidelser har historisk set givet det klareste middel til at belyse menneskets genfunktion. Koblingen af en sjælden DNA-variant til ændret proteinfunktion eller dosis til diskret fænotype har vigtige implikationer for fundamental biologi, monogen sygdomspatogenese, komplekse træk, diagnostik og terapi. Ved at repræsentere den lettest fortolkelige komponent af menneskelig genetik i definitionen af en klar, højpenetrerende fænotype, der opstår ved ændring i funktion af et enkelt gen, kan undersøgelse af monogene lidelser identificere det genetiske grundlag for nye eller eksisterende fænotyper og give indsigt i ikke-redundante biologiske veje, der kan informere terapeutisk målretning for både den specifikke sjældne variant og almindelige sygdomme. Følgelig er det primære formål med dette program at identificere nye monogene fænotyper og opdage underliggende kausale genetiske varianter ved genetisk sekventering i familier på tværs af UAE.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Forventet)
Kontakter og lokationer
Studiesteder
-
-
-
Abu Dhabi, Forenede Arabiske Emirater, 48338
- Rekruttering
- Imperial College London Diabetes Centre
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Barn
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Deltagerne vil udvise kliniske fænotyper, der tyder på en underliggende ny monogen lidelse, med/uden tilstedeværelsen af familiært tilbagefald af fænotypen og/eller forældres slægtskab.
Stamtavler af særlig interesse (i foretrukken rækkefølge) vil omfatte:
- Slægtsfamilier, ideelt set hvor et eller flere familiemedlemmer er berørt
- De novo baseret - dvs. trioer af proband og begge forældre, hvor kun proband udviser fænotypen
- Autosomal recessiv
- Autosomal dominant, dog med en stor slægtning (f.eks. ideelt set 6-8 berørte medlemmer på tværs af 2-3 generationer)
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
Specifik fænotype - Fænotyper af interesse, der tyder på en underliggende ny genetisk lidelse:
- Usædvanlige præsentationer af almindelige lidelser, f.eks. med klart definerede syndromiske/dysmorfe træk*.
- Ekstreme fænotypiske præsentationer.
- Helt nye, tidligere udefinerede fænotyper.
Familiehistorie/stamtavle - Fænotype, der mistænkes for at skyldes en enkelt genetisk mutation (de novo eller nedarvet) baseret, hvor den er tilgængelig, på en af:
- Tilstedeværelse af syndromiske/dysmorfe træk.
- Familiehistorie med lignende præsentationer i andre slægtninge.
- Mønster for arv.
- Forældres slægtskab.
Klinisk fortolkning - hvor tilgængelig (dvs. ikke obligatorisk, men vil øge tilliden til egnethed), tilstedeværelsen af kliniske og/eller undersøgelsesresultater i overensstemmelse med en ny arvelig/monogen lidelse:
- Udelukkelse af ikke-genetiske erhvervede årsager – f.eks. dem med en klar historie med sandsynlig miljøårsag.
- Genotype negativ for kendte gener, der ligger til grund for lidelsen/fænotypen.
- Samtykke - Deltager (eller forælder/værge, hvis den er under 18 år), villig og i stand til at give informeret samtykke til deltagelse i undersøgelsen som proband (mandlig/kvindelig), forælder i en trio eller udvidet familiemedlem.
Ekskluderingskriterier:
- Deltageren eller deres juridiske værge/juridisk repræsentant er uvillig eller ude af stand til at give informeret samtykke. I tilfælde, hvor en potentiel børnedeltager har kapacitet til at give samtykke, men nægter at deltage, vil barnets vilje blive respekteret.
- Deltager, som allerede har gennemgået genotype-/panel-/laboratorietest (f.eks. for kendte medfødte stofskiftefejl) og har en defineret/diagnosticeret genetisk tilstand.
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Kohorte
- Tidsperspektiver: Tværsnit
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
Intervention / Behandling |
---|---|
Monogen lidelse
Deltagere, der udviser kliniske fænotyper, der tyder på en underliggende ny monogen lidelse, med/uden tilstedeværelse af familiært tilbagefald af fænotypen og/eller forældres slægtskab vil blive inkluderet.
Sanger og/eller Next Generation Sequencing (NGS) - Panel/WES/WGS tilgange vil blive brugt til at lette identifikation af de novo/arvede varianter i barnet/probandet.
|
NGS panel, hel exom / genom sekventering (WES/WGS)
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
Ny fænotype og genopdagelse
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Identifikation og karakterisering af nye monogene fænotyper fra specifikke stamtavler. Uvildig identifikation af nye, sjældne sygdomsfremkaldende gener gennem anvendelse af genetiske sekventeringsmetoder til nye eller etablerede fænotyper. |
gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
Generer ny biologisk indsigt
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Opnå indsigt i de patologiske mekanismer (kendte eller nye nedstrøms sygdomsveje) bag monogen sygdom og mere bredt til almindelige/komplekse sygdomme, foruden grundlæggende indsigt vedrørende fysiologisk genfunktion.
|
gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Modificerende gener for monogene lidelser
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Identificer modificerende gener for monogene lidelser - for at hjælpe med forståelsen af fænotypisk heterogenitet af Mendelske lidelser.
|
gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Potentielle nye terapeutiske mål
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Identificer potentielle nye terapeutiske mål - udnytte disse indsigter til at identificere robuste, genetisk definerede potentielle molekylære og cellulære lægemiddelmål (relateret til det primære gen og/eller modificerende gener) til behandling af sjældne (forældreløse) og/eller almindelige sygdomme.
|
gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Genfunktion og målvalidering
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Hvor det er muligt, bestemme den funktionelle virkning af identificerede patogene varianter og valider sygdomsmekanisme-baserede mål ved brug af prækliniske (in vitro/in vivo) og/eller tidlige humane eksperimentelle undersøgelser.
|
gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Houman Ashrafian, DPhil FRCP, University of Oxford
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- 1- Chial H. Rare Genetic Disorders: Learning About Genetic Disease Through Gene Mapping, SNPs, and Microarray Data. Nature Education 2008;1(1):192.
- 2- Genes and human disease. World Heath Organization 2017. Retrieved from http://www.who.int/genomics/public/geneticdiseases/en/index2.html
- Ku CS, Cooper DN, Patrinos GP. The Rise and Rise of Exome Sequencing. Public Health Genomics. 2016;19(6):315-324. doi: 10.1159/000450991. Epub 2016 Nov 30.
- Mefford HC. Clinical Genetic Testing in Epilepsy. Epilepsy Curr. 2015 Jul-Aug;15(4):197-201. doi: 10.5698/1535-7511-15.4.197.
- de Ligt J, Willemsen MH, van Bon BW, Kleefstra T, Yntema HG, Kroes T, Vulto-van Silfhout AT, Koolen DA, de Vries P, Gilissen C, del Rosario M, Hoischen A, Scheffer H, de Vries BB, Brunner HG, Veltman JA, Vissers LE. Diagnostic exome sequencing in persons with severe intellectual disability. N Engl J Med. 2012 Nov 15;367(20):1921-9. doi: 10.1056/NEJMoa1206524. Epub 2012 Oct 3.
- Della Mina E, Ciccone R, Brustia F, Bayindir B, Limongelli I, Vetro A, Iascone M, Pezzoli L, Bellazzi R, Perotti G, De Giorgis V, Lunghi S, Coppola G, Orcesi S, Merli P, Savasta S, Veggiotti P, Zuffardi O. Improving molecular diagnosis in epilepsy by a dedicated high-throughput sequencing platform. Eur J Hum Genet. 2015 Mar;23(3):354-62. doi: 10.1038/ejhg.2014.92. Epub 2014 May 21.
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Forventet)
Studieafslutning (Forventet)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- IREC038
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Sanger og/eller Next Generation Sequencing (NGS)
-
Jagiellonian UniversityRekruttering
-
University Hospital TuebingenRekrutteringSjældne sygdomme | Genetisk dispositionTyskland
-
Addario Lung Cancer Medical InstituteDana-Farber Cancer InstituteAktiv, ikke rekrutterendeIkke-småcellet lungekræftForenede Stater
-
Institut National de la Santé Et de la Recherche...Institut Bergonié; Plateforme labellisée Inca - Institut Bergonié, Bordeaux og andre samarbejdspartnereAfsluttetBlødt vævssarkom | Kolorektalt karcinomFrankrig
-
ReprogeneticsReproductive Medicine Lab, LLCUkendt
-
Peking Union Medical CollegeUkendtBryst Neoplasma Kvinde | Mutation | TerapeutikKina
-
A2 Biotherapeutics Inc.Tempus AIRekrutteringKræft | Kolorektal cancer | Kræft i bugspytkirtlen | Ovariale neoplasmer | Livmoderhalskræft | NSCLC | Ikke småcellet lungekræft | Mesotheliom | Mesotheliom, ondartet | Bugspytkirtelkræft | Ovariekarcinom | Solid tumor, voksen | CRC | Mesotheliom; LungeForenede Stater
-
University Hospital, EssenNoscendo GmbH, Germany; Health Economics and Health Care Management, Bielefeld... og andre samarbejdspartnereRekrutteringSepsis | Septisk chokTyskland
-
Ambry GeneticsBeth Israel Deaconess Medical Center; HonorHealth Research Institute; University...AfsluttetDuktalt adenokarcinom i bugspytkirtlenForenede Stater
-
Tianjin Medical University Second HospitalUkendt