Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Afgrænsning af nye monogene lidelser i befolkningen i De Forenede Arabiske Emirater

11. februar 2020 opdateret af: Imperial College London Diabetes Centre

Afgrænsning af nye monogene lidelser i De Forenede Arabiske Emirater

Undersøgelsen har til formål at identificere nye monogene fænotyper fra specifikke stamtavler og opdage den underliggende kausale genetiske variant ved hjælp af genetisk sekventering (Sanger og/eller Next Generation Sequencing - Panel/WES/WGS) metoder i familier på tværs af De Forenede Arabiske Emirater (UAE).

Studieoversigt

Detaljeret beskrivelse

Monogene lidelser skyldes et enkelt defekt gen og nedarves i henhold til Mendels love (mendelske lidelser). Sådanne gendefekter opstår fra en mutation, der enten kan nedarves eller opstå spontant; begge kan forekomme i mangel af en tidligere familiehistorie. Arvelige mutationer kan være dominante eller recessive og autosomale eller kønsbundne. Ifølge WHO påvirker kollektivt monogene lidelser millioner af mennesker verden over, selv om de er individuelt sjældne. I øjeblikket vurderes over 10.000 menneskelige sygdomme at være monogene. Indtil for nylig har identifikation af de genetiske årsager, især af ekstremt sjældne fænotyper, ikke været mulig eller omkostningseffektiv på grund af de videnskabelige udfordringer med at identificere kausative mutationer gennem koblingsanalyse. Fremkomsten af ​​omkostningseffektiv næste generations sekventering letter nu identifikation af alle sjældne varianter på tværs af hele genomet, hvilket igen muliggør mutationsidentifikation i små familier og, hvis de novo, selv i enkelte tilfælde.

Den kliniske anvendelse af enkelt-gen-sekventering giver potentielt håndgribelige fordele for patienter, informerer diagnose og prognose og kan vejlede behandlingsvalg. Næste generations sekventeringspaneler (NGS) sekventerer flere gener parallelt og går nu ind i det kliniske domæne. NGS giver betydelige fordele i forhold til enkeltgensekventering for tilstande, der er genetisk heterogene, såsom epilepsierne. Men efterhånden som flere gener indgår i et NGS-panel, stiger muligheden for tilfældige fund markant med tilhørende udfordringer i resultatfortolkningen. Da mange tilstande er fænotypisk såvel som genetisk heterogene, er erhvervelse af detaljeret fænotypisk information afgørende for meningsfuld fortolkning af NGS-resultater.

Monogene (mendelske) lidelser har historisk set givet det klareste middel til at belyse menneskets genfunktion. Koblingen af ​​en sjælden DNA-variant til ændret proteinfunktion eller dosis til diskret fænotype har vigtige implikationer for fundamental biologi, monogen sygdomspatogenese, komplekse træk, diagnostik og terapi. Ved at repræsentere den lettest fortolkelige komponent af menneskelig genetik i definitionen af ​​en klar, højpenetrerende fænotype, der opstår ved ændring i funktion af et enkelt gen, kan undersøgelse af monogene lidelser identificere det genetiske grundlag for nye eller eksisterende fænotyper og give indsigt i ikke-redundante biologiske veje, der kan informere terapeutisk målretning for både den specifikke sjældne variant og almindelige sygdomme. Følgelig er det primære formål med dette program at identificere nye monogene fænotyper og opdage underliggende kausale genetiske varianter ved genetisk sekventering i familier på tværs af UAE.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Forventet)

150

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiesteder

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

  • Barn
  • Voksen
  • Ældre voksen

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Køn, der er berettiget til at studere

Alle

Prøveudtagningsmetode

Sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Deltagerne vil udvise kliniske fænotyper, der tyder på en underliggende ny monogen lidelse, med/uden tilstedeværelsen af ​​familiært tilbagefald af fænotypen og/eller forældres slægtskab.

Stamtavler af særlig interesse (i foretrukken rækkefølge) vil omfatte:

  • Slægtsfamilier, ideelt set hvor et eller flere familiemedlemmer er berørt
  • De novo baseret - dvs. trioer af proband og begge forældre, hvor kun proband udviser fænotypen
  • Autosomal recessiv
  • Autosomal dominant, dog med en stor slægtning (f.eks. ideelt set 6-8 berørte medlemmer på tværs af 2-3 generationer)

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • Specifik fænotype - Fænotyper af interesse, der tyder på en underliggende ny genetisk lidelse:

    1. Usædvanlige præsentationer af almindelige lidelser, f.eks. med klart definerede syndromiske/dysmorfe træk*.
    2. Ekstreme fænotypiske præsentationer.
    3. Helt nye, tidligere udefinerede fænotyper.
  • Familiehistorie/stamtavle - Fænotype, der mistænkes for at skyldes en enkelt genetisk mutation (de novo eller nedarvet) baseret, hvor den er tilgængelig, på en af:

    1. Tilstedeværelse af syndromiske/dysmorfe træk.
    2. Familiehistorie med lignende præsentationer i andre slægtninge.
    3. Mønster for arv.
    4. Forældres slægtskab.
  • Klinisk fortolkning - hvor tilgængelig (dvs. ikke obligatorisk, men vil øge tilliden til egnethed), tilstedeværelsen af ​​kliniske og/eller undersøgelsesresultater i overensstemmelse med en ny arvelig/monogen lidelse:

    1. Udelukkelse af ikke-genetiske erhvervede årsager – f.eks. dem med en klar historie med sandsynlig miljøårsag.
    2. Genotype negativ for kendte gener, der ligger til grund for lidelsen/fænotypen.
  • Samtykke - Deltager (eller forælder/værge, hvis den er under 18 år), villig og i stand til at give informeret samtykke til deltagelse i undersøgelsen som proband (mandlig/kvindelig), forælder i en trio eller udvidet familiemedlem.

Ekskluderingskriterier:

  • Deltageren eller deres juridiske værge/juridisk repræsentant er uvillig eller ude af stand til at give informeret samtykke. I tilfælde, hvor en potentiel børnedeltager har kapacitet til at give samtykke, men nægter at deltage, vil barnets vilje blive respekteret.
  • Deltager, som allerede har gennemgået genotype-/panel-/laboratorietest (f.eks. for kendte medfødte stofskiftefejl) og har en defineret/diagnosticeret genetisk tilstand.

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

  • Observationsmodeller: Kohorte
  • Tidsperspektiver: Tværsnit

Kohorter og interventioner

Gruppe / kohorte
Intervention / Behandling
Monogen lidelse
Deltagere, der udviser kliniske fænotyper, der tyder på en underliggende ny monogen lidelse, med/uden tilstedeværelse af familiært tilbagefald af fænotypen og/eller forældres slægtskab vil blive inkluderet. Sanger og/eller Next Generation Sequencing (NGS) - Panel/WES/WGS tilgange vil blive brugt til at lette identifikation af de novo/arvede varianter i barnet/probandet.
NGS panel, hel exom / genom sekventering (WES/WGS)

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Ny fænotype og genopdagelse
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år

Identifikation og karakterisering af nye monogene fænotyper fra specifikke stamtavler.

Uvildig identifikation af nye, sjældne sygdomsfremkaldende gener gennem anvendelse af genetiske sekventeringsmetoder til nye eller etablerede fænotyper.

gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Generer ny biologisk indsigt
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
Opnå indsigt i de patologiske mekanismer (kendte eller nye nedstrøms sygdomsveje) bag monogen sygdom og mere bredt til almindelige/komplekse sygdomme, foruden grundlæggende indsigt vedrørende fysiologisk genfunktion.
gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
Modificerende gener for monogene lidelser
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
Identificer modificerende gener for monogene lidelser - for at hjælpe med forståelsen af ​​fænotypisk heterogenitet af Mendelske lidelser.
gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
Potentielle nye terapeutiske mål
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
Identificer potentielle nye terapeutiske mål - udnytte disse indsigter til at identificere robuste, genetisk definerede potentielle molekylære og cellulære lægemiddelmål (relateret til det primære gen og/eller modificerende gener) til behandling af sjældne (forældreløse) og/eller almindelige sygdomme.
gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
Genfunktion og målvalidering
Tidsramme: gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år
Hvor det er muligt, bestemme den funktionelle virkning af identificerede patogene varianter og valider sygdomsmekanisme-baserede mål ved brug af prækliniske (in vitro/in vivo) og/eller tidlige humane eksperimentelle undersøgelser.
gennem studieafslutning, i gennemsnit 2 år

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: Houman Ashrafian, DPhil FRCP, University of Oxford

Publikationer og nyttige links

Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

1. januar 2018

Primær færdiggørelse (Forventet)

1. januar 2021

Studieafslutning (Forventet)

1. januar 2021

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

2. juli 2018

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

16. juli 2018

Først opslået (Faktiske)

17. juli 2018

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

12. februar 2020

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

11. februar 2020

Sidst verificeret

1. februar 2020

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Sanger og/eller Next Generation Sequencing (NGS)

3
Abonner